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不同组织内RNA和蛋白质的表达水平进行定量分析是了解人类生物学和疾病的基础。迄今为止,大多数研究都集中在 RNA 检测上。然而事实上,位于转录下游的蛋白质,作为直接参与细胞重要活动的大分子,其表达水平通常与转录本水平之间的相关性较弱。因此对蛋白质组的详细研究可以补充转录组学研究,提供转录后调控机制以及人类生物学和疾病的见解。2020年9月10日,来自美国斯坦福大学医学院遗传学系的Michael P. Snyder团队在Cell期刊上发表题为“A Quant
想做蛋白质组学,但是细胞量太少怎么办?别担心,青莲帮您来搞定!青莲百奥早在多年前就致力于微量蛋白质组技术的研发,目前已能够实现对200个细胞进行蛋白质组学分析,且预期蛋白鉴定数可达1500-2000个!【微量蛋白质组学】您值得拥有!随着单细胞测序技术的发展,基因组学和转录组学都已经进入到了单细胞时代,而蛋白质组学的研究也逐渐向单细胞水平迈进。今天给大家介绍的这篇文章就是真正基于质谱的“单细胞”水平的蛋白质组学研究。2018年2月28日,美国华盛顿州环境分子
疫苗被认为是预防和控制传染病的有效手段之一,但新冠病毒疫苗的研发难度很大。在9月4日举行的2020中国国际服务贸易交易会上,三款国产新冠病毒灭活疫苗首次集体亮相引发关注,向伟大的中国疫苗研发团队致敬!多组学联合分析糖基化作为生物体内最为重要的蛋白质翻译后修饰形式之一,参与调控了蛋白质在组织和细胞中的定位、功能、活性、寿命和多样性。新型冠状病毒中的"高度糖基化现象",使病毒可以进行多种突变,给疫苗研发带来极大的难度,糖基化能保护特定表位免
PD1/PD-L1阻断疗法是近年来发展迅速且热门的新疗法。相对于传统放化疗方法,这种疗法显著延长了癌症患者的生存时间,具有明显的优势。然而并不是所有人都适合PD1/PD-L1阻断疗法,以肺癌患者为例,当PD-1的TPS指标<1%时则被认为不适合PD1/PD-L1阻断疗法。真实的PD-1的表达量检测受细胞表面多种因素所影响,如细胞表面的糖基化修饰基团正是其中之一。今天我们就来讲讲糖基化研究是如何指导增强PD1/PD-L1检测效力的。糖基化蛋白质组学台湾
石蜡包埋(Formalin Fixed Paraffin Embedded, FFPE)是目前医学领域中普遍采用的组织处理和保存方法,已广泛应用于病理科的常规病理临床工作中,关于FFPE组织的蛋白质组学的研究也越来越多。多组学联合分析今天小编带您了解下如何利用DIA定量蛋白质组学对上千个FFPE微量组织样本蛋白表达进行分析和验证来给临床诊断带来曙光!甲状腺结节中良性结节主要以甲状腺腺瘤或者结节性甲状腺肿大为主,而恶性的结节也就是甲状腺癌。据报道多达30%的
结肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是全球第四大致命癌症,仅2018年统计,发病数将近200万,致死人数约90万,其中CRC尤其是转移性CRC导致的死亡率明显高于非转移性CRC。那么当结肠癌遇上多组学会产出怎样的结果呢!这篇高分文献给你答案!近日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)曾嵘研究组、吴家睿研究组与海军军医大学第1附属医院(上海长海医院)张卫研究组联合国科大杭州高等研究院系统生物学重点实验室和上海科技大
乳腺癌是女性常见的恶性肿瘤之一,据资料统计,发病率占全身各种恶性肿瘤的7-10%,在妇女中发病率仅次于子宫癌,它的发病常与遗传有关,以及40-60岁之间,绝经期前后的妇女发病率较高,仅约1-2%的乳腺患者是男性。根据乳腺癌的分子分型又可以分为LuminalA型、LuminalB型、三阴性、HER2型。化疗耐药性导致的肿瘤复发是晚期乳腺肿瘤面临的主要临床挑战。针对这难题,近期来自赛克勒医学院的研究团队发表了“Proteomic patterns associ
2021-01-27 00:00:00168次过去的研究结果表明,肠道菌群与人类代谢密切相关,肠道菌群异常可能导致多种代谢疾病的发生,包括肥胖、2型糖尿病、非酒精性肝病、心脏疾病、营养不良等。为了理解肠道菌群影响宿主代谢的机理,研究人员的视角已经从传统描述性的菌群组成分析转移到因果关系的探究上。2020年9月4日,来自丹麦哥本哈根大学的Oluf Pedersen团队在国际学术期刊Nature Reviews Microbiology上在线发表了题为“Gut
物靶点(Drug Target)是指体内具有药效功能并能被药物作用的生物大分子,作为药物靶点的主要蛋白家族就有GPCR受体,离子通道、核受体、激酶等。自21世纪以来,基于靶点的药物发现模式逐渐取代了传统的基于药物化学结构的发现模式,成为现代创新药物研发的主流模式。因此,事先确定靶向特定疾病有关的靶点分子是现代新药开发的基础。针对靶点的研究可以清楚疾病症结所在,从而确定了新药的研发方向。此外靶点的研究还有助于了解药物作用机制,进而对已有药物进行改造,研发出毒
随着技术的快速发展,使用多组学数据联合来解析动植物和人类遗传科学问题已成为趋势,同时为科研发展提供了新机遇。为了推动多组学联合新方法发展,贴合广大研究生与青年教师的科研需求,青莲百奥从即日起至11月1日提供购买蛋白组学赠送代谢组学+联合分析的活动,满足广大科研工作者多层次组学的需求。PART.1文章一浙江中医药大学孙秋华教授发表题为“Multi-omics Analysis at Serum Proteomic&nb
中 心法则”是生物界遵循的一法则,基因组学告诉我们能发生什么,转录组学告诉我们会发生什么,北京蛋白质组学告诉我们执行者是谁,代谢组学告诉我们已经发生和正在发生的。想要完整的讲述一个故事,只有一个组学怎么行!多组学联合正如火如荼的进行着,今天小编带来一篇文章,先简单了解一下代谢组学与16S和ITS测序是怎样团结合作的。概述根际微生物群落组成受土壤源、植物基因型和代谢物的影响植物微生物是影响植物健康和生产力的主要因素,通过提高植物生长力、养分利用效率和胁迫耐受
代谢流简介 代谢组学反映的是静态的代谢物丰度,而单独某一种代谢物的增加,既可能是因为合成途径的活跃,也可能是由于消耗途径的克制。因此,对于特定代谢通路和代谢网络的研究,代谢组学往往不足以解释所有问题。代谢流(Metabolic Flux)是在传统代谢组学基础上演进的新技术,利用稳定同位素13C或者15N标记特定代谢物分子,并结合NMR或者GC-MS/LC-MS色谱质谱联用技术解析和追踪下游代谢
代谢组学的分析策略主要有非靶向和靶向两种,前者一般使用高分辨质谱获得丰富的代谢物信息,但存在数据复杂、重复性差、线性范围窄等缺点;而后者一般使用三重四等级杆质谱,数据质量有了很大提高,但通常只检测已知代谢物,覆盖度低。那么有没有一种方法可以结合非靶向和靶向代谢组学的优点呢?既能实现高覆盖率又能提高重复性?今天,小编就给大家讲解下中国科学院大连化学物理研究所高分辨分离分析及代谢组学研究组研究员许国旺团队于2020年6月24日发表在NATURE PROTOCO
HMDB简介Human Metabolome Database (HMDB) 数据库是由加拿大代谢组学创新中心[The Metabolomics Innovation Centre (TMIC)] 于2007年创立的代谢组学综合数据库,被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源,包含有关人体小分子代谢产物的详细信息,应用领域包括代谢组学、临床医学、生物标志物的发现等。HMDB信息该是数据库专门针对人体内源性代谢产物进行收录,包括代谢物简介、
多组学联合分析是什么?代谢物作为生物体表型的基础和直接体现者,是一种天然的表型指标。代谢组+其他组学研究模式已经在多个领域广泛使用,成为深入研究科学问题,系统阐释作用机制的利器。一方面,可以单独作为表型数据衡量各个样品的水平;另一方面,可以结合其他组学(转录组、蛋白组、微生物多样性、宏基因组、GWAS),缩小候选基因/通路、进行多水平互相印证、探究共生/寄生关系、辅助基因定位等。代谢组+转录组转录组测序可以得到大量差异基因、众多调控网络。难以确定关键途径,
转录组是研究功能基因的利器,通过转录组测序可以得到大量差异基因和众多调控网络,围绕转录组开展的多组学分析策略已是多种类型高分文章的“法宝”。代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后出现的新兴“组学”,是生物体表型的基础和直接体现者,研究的是生物体被扰动后其代谢产物的种类、数量及其变化规律的科学。1. 为什么要进行转录组+代谢组关联分析?生物过程具有复杂性和整体性,单一组学的数据难以系统多方面地解析复杂生理过程的调控机制。多组学联合分析可以共同探究生物体
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