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产品介绍GBS(Genotyping-by-Sequencing)是指通过测序进行基因分型,其命名是为了与传统的通过芯片进行基因分型的方法相区别,是一种常见的简化基因组测序技术。其原理是将基因组DNA进行酶切,然后对酶切片段两端序列进行高通量测序。通过分析获得SNP信息并进行基因分型,是一种快速、简便、低成本的基因分型方法,适合对大规模样品进行标记筛选。GBS技术可以根据研究目的灵活调整所需捕获酶切位点的片段数(Tags),从而控制捕获序列的范围。基于简化基因组技术(GBS)的遗传图谱构建,能够降低基因组的复杂度,数据量低,操作简便,节约成本,特别适合大样本量研究。玉米、木薯、枣树等物种都已成功运用GBS技术构建了高密度遗传图谱,为进一步进行目标性状定位、分子辅助选择和图位克隆重要农艺性状基因奠定了基础。技术流程技术原理
(1)将不同样本和含不同barcode接头成对放在平板里;(2)使用ApeKI限制酶进行酶解;(3)使用T4连接酶,将接头连接到片段两端因酶切产生的粘末端(stcky end);(4)将含不同barcode的样本混池,随后过片段长度筛选柱,过滤尚未反应的接头;(5)加入PCR引物,进行PCR扩增。技术优势
物种适用范围广:有无参考基因组均可进行研究;
投入低:研究所需数据量低,适合对超大大样本量研究;
周期短:2-4个月即可获得相关结果;
样品要求量低:单个样品DNA送样量低至300ng。
送样要求样品类型:样品材料或者DNADNA总量:≧1ugDNA浓度:≧30ng/ul分析示例群落structureSNP突变频谱 性状相关侯选区域鉴定遗传图谱连锁群性状关联分析
GBS文库构建,GBS文库构建
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