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LncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,它们大部分具有编码蛋白的结构特征,如帽式结构和polyA尾,广泛存在于各种生物体内,在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,与动植物的生长发育,人类的疾病发生有着密切关系,也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。
LncRNA在九十年代初就已经被发现,但直到2002年对小鼠的全长cDNA文库进行分析才发现了大量lncRNA。随着对cDNA文库的不断注释、高通量测序技术的广泛应用,越来越多的LncRNA被逐渐发现。目前研究表明,LncRNA具有种类多、作用方式多和数量多等特点。此外,研究还发现LncRNA在整个转录组中占有很高的比例,其表达丰度远远超过蛋白编码基因。近年来的研究表明lncRNA的生物学作用非常广泛,对胚胎发育、细胞增殖分化、器官发生等方面都具有重要作用。lncRNA测序使用高通量测序技术结合先进的生物信息学分析,一次性可获得样品中几乎全部的lncRNA和mRNA信息。
技术流程
技术优势
通量高,单样本推荐测序量12Gb;
流程优化,项目周期显著降低;
可开展全转录组关联分析,深入挖掘基因表达状态和转录组水平表达调控状态;
提供组学数据构建服务,让数据后期利用更加便利。
送样要求
RNA总量:RNA总量≥2ug;
RNA纯度:OD260/280在1.8-2.0之间,核酸完整无降解;完整性RIN≥8.0;浓度≥100 ng/μL。
分析示例
差异基因可视化散点图及火山图
上下调差异基因GO注释柱形图
差异基因KEGG富集图
表达差异基因聚类图
基因可变剪接类型分析
SNP信息统计
lncRNA与mRNA 表达量比较分析
LncRNA测序,LncRNA测序
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