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宏基因组Binning的方法,可以在自然环境样本中有效区分每个菌株基因组信息。Binning即是从微生物群体序列中将不同个体的序列(reads或contigs)分离开的过程。主要用于微生物组的两方面应用:关联分析和单菌组装。
分析流程
技术参数
实验策略测序量项目周期400bp左右小片段文库≧30G raw data约70个工作日
技术特色
不依赖于微生物的分离培养,环境微生物单菌基因组(框架图)研究的一种新的途径和高性价比策略;
可以得到环境中丰度较低的,为研究低丰度微生物提供了途径;
引入了宏观生态的研究理念,对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究,可以更准确地反应出微生物生存的真实状态。
1对1项目服务,直接对接生信分析师,没有中间环节,沟通更高效。
多组学关联分析,可关联代谢组等研究结果,全方面深化研究。
送样要求
样品类型样品浓度样品总量取样材料或者环境样本DNA30ng/ul≧1ug
分析示例
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