Opentrons Flex™ 核酸提取工作站：协同工作，助力高质量基因组 DNA 提取与纯化

2024-03-25 09:37:26, Opentrons 合创生物工程（深圳）有限公司

提取基因组 DNA 是生命科学和应用测试实验室中常见的实验流程，尤其在基因分型测试、测序和临床研究等下游应用中，对 DNA 的质量和纯净度要求十分严格。

本期将为大家介绍，结合 MACHEREY NAGEL 公司的 NucleoMag^® Tissue 试剂盒，使用 Opentrons Flex^™核酸提取工作站提供基于磁珠的快速基因组 DNA 纯化解决方案。该试剂盒设计精简，适用于 96 孔板模式，可为 PCR、NGS 或其他酶反应提供高质量、高纯净度的 DNA 模板。而 Opentrons Flex^™核酸提取工作站则可高效纯化 HeLa 细胞基因组DNA。该工作站配备了 Opentrons Flex^™环形磁力架、加热振荡模块，以及 5-1000 μL 单通道和 8 通道移液器，还可选择 96 通道移液器，适用于各种样本类型提取 DNA，包括其他真核细胞或组织。

Opentrons Protocol Library 中提供了 Opentrons Flex^™ 核酸提取工作站与 NucleoMag^® Tissue 试剂盒结合使用的协议，用户可直接下载使用。

应用优势

操作方法经过验证，确保全自动提取纯化过程准确性。

产量和纯度重复性好，可稳定回收基因组 DNA。

处理能力强，最多可同时处理 96 个样品。

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NucleoMag^® Tissue 试剂盒的原理是基于核酸在特定结合条件下可逆吸附到 NucleoMag B-beads 上。在处理高达 20 mg 的组织样本或 1x10^6 个细胞时，首先加入蛋白酶 K 和裂解缓冲液 T1，然后通过加入缓冲液 MB2 促进核酸与磁珠的可逆结合。随后，在磁珠吸附后，使用洗涤缓冲液 MB3 和 MB4 进行洗涤，以去除盐和其他杂质。接着进行干燥步骤或进行 MB5 洗涤，最后使用洗脱缓冲液 MB6 将 DNA 洗脱下来。该过程中所有的移液和磁珠纯化步骤都由 Opentrons Flex™ 完成。

应用数据

从 HeLa 细胞中提取 DNA

利用 Opentrons Flex^™ 工作站搭配 NucleoMage^® Tissue 试剂盒，从 2.4x10^5 个 HeLa 细胞中成功提取高纯度 DNA。随后通过 TapeSta-tion 对纯化后的 DNA 进行评估，包括评估 DNA 完整性(DIN)和片段大小分布(虚拟凝胶成像)，结果显示，DNA的平均 DIN 值为 9.0 ± 0.09。这表明 Opentrons Flex^™ 工作站与 NucleoMage^® Tissue 试剂盒结合使用，能够稳定地从 HeLa 细胞中提取高质量的 DNA。

值得信赖的 qPCR 检测结果

通过进行 qPCR 分析(用蓝色条表示)，使用PowerTrack^™ SYBR GreenMaster Mix 作为试剂，针对靶向基因组中 β-2-微球蛋白的 190 bp 区域，经IDT 设计引物。据 qPCR 结果显示，在所有测试样本中都能稳定检测到扩增片段，表明这个自动化核酸纯化流程适用于各种常见的基于酶的下游应用。这些结果证明了 Opentrons Flex^™ 工作站搭配 NucleoMag^® Tissue 试剂盒提取的 DNA 在 qPCR 检测中所表现出的可靠性。

若需深入了解 Opentrons Flex^™核酸提取工作站与 NucleoMag^® Tissue 试剂盒协同工作内容，以及更多具体的应用案例、实验数据和优化技巧，请访问 Opentrons 官网“资源” - “知识中心”页面，获取详细应用笔记。