安捷伦CDS的LC-UV-MS的数据自动化导出

要实现药学研究和开发工作的数字化孪生Digital Twin，就需要分析数据产生更大的价值，成为业务的模拟和仿真的核心素材。因此将各种色谱工作站里的结构化的数据全要素（通道）地提取出来进行后处理是很有必要的。本例以安捷伦的Openlab CDS为例，将其中的LC-UV-MS数据全通道提取，并转化为ACD/Labs格式数据自动化导出，支持科研决策以及数学模型的构建。

Agilent Openlab CDS在安装部署时，常见的部署方式有3种：Server网络版，单机网络版和单机版。本文中描述的方法可适用于上述3种不同的安装模式，此文档主要描述了怎么样把数据导出设定成一个后处理方法，一旦设定完成了，就可以用该后处理方法进行不同项目的数据自动化导出，不需要再次编辑后处理方法。

本文使用的软件是ACD Labs 基于Openlabs CDS 的SDK 开发的数据导出插件addon。

1. 打开 Data Analysis软件，选择任意项目，进入数据分析界面。

2. 点击file，选择New > New Method，进入方法编辑界面。

3. 在Select method configuration种随意选择一种方法的类型，点击create method。

4. 在Processing Method中 Tools下选择Post Processing Plugins，在右边的下拉菜单中选择Run external program

5. 在Custom name中自定义名称，勾选上Run plugin。External program 和Parameters中的内容需要从Aaddon > Import Data from OpenLab CDS下的Configure OpenLab CDS Processing Method界面复制粘贴过来

不要关闭OpenLab Data Analysis当前界面。下面将介绍如何设定Configure OpenLab CDS Processing Method。

1. 首先确保安装了相应的Openlabs Addo插件。在开始菜单 下找到Add-on for OpenLab CDS并点击打开

2. 在跳出的窗口中选择Configure OpenLab CDS Processing Method。

3. 在跳出的窗口中选择server 名并输入账号密码。

4. 会跳出如下界面。在Credentials中输入账号名和密码，如果勾选了Always Use These Credentials，软件会记住该用户和密码。如果需要更改点击Change。

5. 在Output Folder中输入数据导出的路径。可在Spectrus File Name Pattern(Optional)中设定导出数据的文件名中添加的信息，点击Tokens的下拉菜单可选择具体的信息。默认空白表示导出数据文件名不添加任何标签信息，导出文件名与原始文件名一致。

6. 在Data Import Setting File (optional)中可设定导出数据中的哪种信号，例如数据同时包含DAD和MS信号。可以指定导出不同通道的信号，如不填写则将数据中的所有信号导出到同一个文件，推荐不填写。

7. Import Processing Result中可设定最大等待时长，该设定仅对手动导出模式有效。

8. 所有参数设定完成后，分别将External program和Parameters中的信息复制粘贴到OpenLab CDS 设定后处理方法的界面中。

9. 设定完成后点击Save Method，将设定好的后处理方法保存成一个单独的方法文件。

1. 在Data Analysis软件中找到需要导出的数据，可以是单条数据或者同时选中多条数据，并link到设定好的数据导出方法。

2. 然后点击Save All Results，数据会导出到设定好的路径下。

在样品运行Sequence界面中设定processing method自动导出数据之前，推荐先运行手动导出，如手动导出成功表明此processing method设定参数无误。

在Openlab CDS中编辑进样序列时，可将设定好的数据导出方法添加到Process Method中，便可以在数据采集完成的同时完成数据的导出。

下图是软件自动导出的包含多条信号通道的数据， ACD/Spectrus Processor可以读取和查看该全通道数据。

全通道数据的自动化导出功能，显然可以通过安捷伦Openlabs CDS的原始数据 .dx 文件自动化后处理来实现。打开.dx文件则有赖于用户安装安捷伦的Openlabs 的客户端软件。当用户手边使用通用化的的ACD Spectrus Processor进行数据读取，解析和报告LC-UV-MS报告时，可以应用以上介绍的功能说明来实现。

如果您的单位要实现通用化的数据处理和报告，或者进一步要动态整合左右谱图知识为后续业务做决策，或者作为CRO,CDMO公司要向客户交换知识，但又认为PDF文件存在信息缺失，原始数据文件客户又无法直接读取。请及早联络ACD/Labs 的专家。我们会为您提供各种工具以及咨询服务。