布鲁克创新方案——助力后新冠时代mRNA产品研发

2023-10-31 20:34:41, 制药高能火箭队 布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器


ASMS Poster# 布鲁克创新方案

助力后新冠时代mRNA产品研发


在后新冠时代,众多药企开始布局mRNA产品,其中肿瘤疫苗和常规传染病疫苗成为竞争焦点。

mRNA候选药物的分析要求比传统生物制品更为复杂。制造mRNA产品需要独特的工艺步骤,如体外转录(IVT)和脂质纳米颗粒配方,因此会产生不同的分析需求。QC分析需确认mRNA序列、5''端加帽效率以及3''端的poly(A)尾的分布等。mRNA产品的表征和化学、制造和控制(CMC)测试还需进行脂质分析,如脂质纳米颗粒(LNP)成分分析(以确保配方中脂质的正确混合比例)、脂质ID确认以及杂质分析和筛选等。

为了达到有关mRNA治疗/疫苗产品的特性、功能和安全性评估的监管要求,必须对众多关键质量属性(CQA)予以监控。由于mRNA的核苷酸组成单元相对简单,在酶解之后产生的重复单元多,因此其序列的质谱确证一直是一个难点。

布鲁克在mRNA分析领域拥有完整的解决方案。该解决方案结合了超高效液相色谱(UHPLC),TIMS离子淌度高分辨质谱或Q-TOF高分辨质谱,以及Biopharma Compass合规软件等,在提供丰富mRNA信息的同时,采用Biopharma Compass软件套装中的OligoQuest软件功能,可以多维确证mRNA序列信息,并简化mRNA分析的整个流程。

图:不同碱基长度核酸药物分析策略

对于不同碱基长度的核酸药物,其分析策略也有所不同。如下图所示,对于如mRNA、rRNA等较大的核酸药物,采用常规bottom-up方法,酶解片段会因为长度太短而产生很多重复,难以判断具体的位置。

图:18S rRNA (1869 nt) 自下而上分析

采用mid-down法,增加酶解片段的长度,提高酶解片段序列的特异性,可有效改善这一问题。与此同时,常规高分辨质谱难以区分核酸药物酶解片段异构体,而利用TIMS的超高离子淌度分辨率可有效解决这一问题,因此可提高如mRNA等复杂核酸药物的分析准确性。
对于mRNA等复杂核酸药物,长期以来缺乏简单有效的软件工具进行序列分析。Biopharma Compass软件中的OligoQuest软件,可简化mRNA的序列确证工作。如下图所示,EPO mRNA经一次酶解后,通过软件分析,序列覆盖度大于88%。识别出的5‘端和3’端片段,软件会分别以红色和蓝色标示。
mRNA的每个酶解片段,会按照寡核苷酸的序列确证流程,进行多维确证分析。下图为其中一个酶解片段(EPO mRNA 45-59)的多维确证界面,通过色谱、一级质谱、5‘端和3’端二级碎片等信息的确证,提高每个酶解片段乃至整个mRNA序列信息的准确度。

图:mRNA酶解片段多维确证界面

如下图,借助于布鲁克质谱的宽动态范围,真实同位素模式结合SNAP算法,即使低丰度片段也能准确分析。

在mRNA分析工作中,mRNA的酶解步骤通常较难控制。布鲁克可通过搭载Sample Stream样品前处理平台,实现mRNA分析从样品前处理、数据采集、数据分析等的整套全自动流程,提高mRNA分析结果重复性的同时,简化分析流程并提高实验室效率。

图:布鲁克mRNA全自动样品处理分析流程


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