年度盘点 | 迈维代谢医学项目文章集锦(部分)附带文献解读

2022-12-22 10:36:49, 小迈 武汉迈特维尔生物科技有限公司


2022
2023

时间一晃而过,弹指之间,2022年已接近尾声,历史翻开新的一页,我们迎接新的一年。回首2022,历史的考验一波接一波,你我参与其中,命运与共。过去的一年,迈维代谢持续给大家展示组学研究成功案例,希望给广大科研工作者一点启发。


文一


                  新冠患者肠道微生物功能受损的后遗症研究

Prolonged Impairment of Short-Chain Fatty Acid andL-Isoleucine Biosynthesis in Gut Microbiome in Patients With COVID-19

● 期刊:Gastroenterology

 影响因子:22.682

 发表时间:2022.02

 合作单位:香港中文大学医学院

 检测方法:短链脂肪酸检测、L-异亮氨酸检测


研究内容:由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的冠状病毒病(COVID-19)与肠道微生物组成改变有关。作者对COVID-19患者在疾病缓解前后的肠道微生物组功能进行了表征,并检测了粪便代谢物。该研究发现COVID-19在疾病缓解前后的肠道微生物功能发生紊乱,包括短链脂肪酸和L-异亮氨酸生物合成减少。补充短链脂肪酸或L-异亮氨酸的策略可能会改善疾病的结局。

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文二



贻贝在热和缺氧胁迫下的代谢反应

Metabolic response of Mercenaria mercenaria under heat and hypoxia stress by widely targeted metabolomic approach

● 期刊:Science of the Total Environment

 影响因子:10.753

 发表时间:2022.02

 合作单位:中国科学院海洋研究所

 检测方法:广泛靶向代谢组


研究内容:成年硬壳蛤耐温范围为1~34 °C,并且可以在缺氧条件下存活两周。因此,硬壳蛤可以作为理想的模式生物来研究热缺氧条件下的代谢适应机制。本研究采用广泛的靶向代谢组学分析来研究耐热、耐缺氧双壳类硬壳蛤鳃的代谢反应。研究表明糖酵解、厌氧代谢和TCA循环受到压力的影响。肉碱的积累可能会促进脂肪酸β氧化。油磷脂的积累可以维持细胞膜的稳定性。渗透剂在缓解ROS 压力和维持蛋白质稳态中发挥关键作用。

点我查看文献解读原文项目文章 | 动物领域连续两篇!贝类代谢组、昆虫多组学研究成果


文三


阿维菌素对意大利蜜蜂和中华蜜蜂的影响有明显不同的分子模式

Distinct molecular impact patterns of abamectin on Apis mellifera ligustica and Apis cerana cerana 

● 期刊:Ecotoxicology and Environmental Safety

 影响因子:7.129

 发表时间:2022.01

 合作单位:山东农业大学

 检测方法:广泛靶向代谢组


研究内容:阿维菌素对蜜蜂健康产生不利影响。阿维菌素暴露后,中华蜜蜂的死亡率高于意大利蜜蜂,且阿维菌素对中华蜜蜂的影响在转录、翻译和代谢水平均大于对意大利蜜蜂的影响。尽管存在这些差异,但在阿维菌素暴露后,意大利蜜蜂和中华蜜蜂的多种途径,包括氨基酸代谢、免疫系统、运动、碳水化合物代谢和发育过程都发生了改变。这两种蜜蜂物种可以通过几个相同的基因家族对阿维菌素应激作出反应,例如Hsp、CYP450、OBP和角质层蛋白。需要进一步的研究来探索这些分子缺陷是否会转化为对觅食和行为的有害影响。

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文四


TM广靶助力强化结肠癌放疗仿生纳米载体研究

All-In-One Biomimetic Nanoplatform Based on Hollow Polydopamine Nanoparticles for Synergistically Enhanced Radiotherapy of Colon Cancer 

● 期刊:Small

 影响因子:13

 发表时间:2022.02

 合作单位:西安交通大学

 检测方法:TM广靶代谢组


研究内容:放射治疗是结肠癌治疗中最重要的治疗策略,但是在实体瘤破坏中仍有提高放射敏感性的巨大需求。为此,本文设计了一种基于中空聚多巴胺纳米粒子(HP)的仿生纳米载体,其具有同源靶向和pH响应药物释放特性。在这项工作中,HP是通过螯合竞争诱导聚合策略构建的,然后用癌细胞膜修饰。仿生纳米载体同时具有介孔壳和大空腔的结构,能高效负载Apoptin100-109(AP)和维替泊芬(VP)(AVPt@HP@M)。在X射线照射下,AVPt@HP@M通过缓解缺氧(Pt)、促进肿瘤细胞凋亡(AP)和X-射线诱导的光动力(X-PDT)(VP)等多种途径实现结肠癌的放疗增敏。

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文五


代谢组探究环境紫外线辐射诱导太平洋牡蛎行为习服机制

Ambient ultraviolet B radiation induced valve behavioral acclimation of Pacific oyster which resulted from the different response strategies of smooth and striated adductor muscles 

● 期刊:Ecotoxicology and Environmental Safety

 影响因子:7.129

 发表时间:2021.12

 合作单位:鲁东大学

 检测方法:广泛靶向代谢组


研究内容:双壳贝类对短波长光(UVB)表现出行为反应,这表明海洋无脊椎动物也可能表现出复杂的光诱发行为和非图像形成视觉。然而,牡蛎神经元中多种光转化输入的整合仍未得到充分阐明。因此,在未来的研究中应该探索对双壳类动物存活至关重要的非眼睛感光机制。

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文六


细菌诱导肿瘤血栓并表达溶细胞素增强肿瘤治疗

Bacteria-Elicited Specific Thrombosis Utilizing Acid-Induced Cytolysin A Expression to Enable Potent Tumor Therapy

● 期刊:Advanced Science

 影响因子:16.8

 发表时间:2022

 合作单位:湖北大学

 检测方法:广泛靶向代谢组


研究内容:本研究中,作者选用兼性厌氧细菌在肿瘤组织定殖,引起血栓从而阻断肿瘤细胞营养物质和氧气供应,实现对肿瘤细胞的饥饿治疗并阻断肿瘤细胞转移。此外,为了强化疗效,研究人员利用基因重组技术将含有溶细胞素基因的质粒转入细菌,使细菌表达毒性蛋白致死肿瘤细胞。基于细菌平台的肿瘤治疗体系,体内生物安全性是人们关注的首要问题。为了尽可能降低治疗过程中可能存在的安全隐患,研究人员在目的基因质粒构建过程中引入酸启动子,使细菌溶细胞素蛋白的表达受肿瘤酸性微环境调控,实现肿瘤高效、安全、精准治疗。该工作拓展了基于细菌平台的肿瘤治疗研究,为肿瘤细菌治疗临床应用提供了理论基础。

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文七


虫草及其替代品的脂质组学研究

Lipidomic profiling of wild cordyceps and its substituents by liquid chromatography-electrospray ionization-tandem mass spectrometry

● 期刊:LWT- Food Science and Technology

 影响因子:4.952

 发表时间:2022.04

 合作单位:武汉大学中南医院

 检测方法:定量脂质组


研究内容:本研究首次基于LC-ESI-MS/MS分析了野生和栽培虫草及菌丝体的脂质组学特征。对野生冬虫夏草及其替代品的脂质提供了全面的见解,不仅为其药理作用提供了化学证据,还促进了更好的质量控制。

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文八


定量脂质组识别心梗预警和预后新型标志

Plasma Quantitative Lipid Proles: Identication of CarnitineC18:1-OH,CarnitineC18:2-OH and FFA(20:1)as Novel Biomarkers for Pre-warning and Prognosis in Acute Myocardial  Infarction

● 期刊:Frontiers in Cardiovascular Medicine 

 影响因子:6.05

 发表时间:2022.04

 合作单位:汕头大学附属粤北人民医院

 检测方法:定量脂质组检测


研究内容:本研究对AHC、UA、AMI三组样本做了定量脂质组检测,共检测到795个脂质代谢物。AMI组特异性表达25种脂质代谢物。应用机器学习方法得到CarnitineC18:1-OH、CarnitineC18:2-OH和FFA(20:1)3个脂质标志物,这三种脂质代谢物可作为诊断AMI的潜在生物标志物。随后的1年随访分析表明,这三种脂质生物标志物在预测AMI患者因心血管事件再次入院方面也有很好的表现。

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文九


能量代谢和全谱代谢组学助力新华医院皮肤科团队发现了一种新的疾病——CAOP综合征

S1P defects cause a new entity of cataract, alopecia, oral mucosal disorder, and psoriasis-like syndrome

● 期刊:EMBO Molecular Medicine

 影响因子:12.134

 发表时间:2022.04

 合作单位:上海交通大学医学院附属新华医院

 检测方法:能量代谢和全谱代谢组检测


研究内容:在临床治疗中,发现一名14岁的中国男性患者(患者1)和一名5岁的西班牙裔女性患者(患者2),首次被诊断为白内障、脱发、口腔粘膜病和银屑病样(CAOP)综合征,本文旨在研究CAOP综合征的病因,并尝试阐明这种新疾病的发病机制。

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文十


迈维靶向检测助力江西农大黄路生院士团队发表宿主基因影响肠道菌群的重要成果见刊nature

ABO genotype alters the gut microbiota by regulating GalNAc levels in pigs 

● 期刊:nature

 影响因子:43.07

 发表时间:2022.04

 合作单位:江西农业大学

 检测方法:靶向检测N-乙酰半乳糖胺


研究内容:本研究历时十二年,通过对两个时代1500多个个体,每个个体三个生长阶段和三个肠道部位共5100多个样品的系统研究,有力证明宿主遗传会影响肠道菌群的组成和丰度。发现并验证ABO血型基因的一个350万年前的2.3kb缺失导致家猪肠道中N-乙酰半乳糖胺浓度的降低,从而使其丹毒丝菌科相关细菌丰度的下降。

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文十一



蚕丝合成和血淋巴氨基酸代谢的联合分析揭示甘氨酸在蚕丝产量中的作用

Combined analysis of silk synthesis and hemolymph amino acid metabolism reveal key roles for glycine in increasing silkworm silk yields

● 期刊:International Journal of Biological Macromolecules

 影响因子:8.025

 发表时间:2022.04

 合作单位:浙江省农业科学院

 检测方法:氨基酸代谢检测


研究内容:在本研究中确定了甘氨酸和苏氨酸是影响丝产量的关键氨基酸。通过结合血淋巴氨基酸代谢和丝合成分析,观察到甘氨酸通过促进SG DNA合成来增加丝产量。为深入了解氨基酸营养代谢与高效蚕丝合成的关系,进一步优化蚕饲料配方提供了依据。

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文十二


P53 deficiency affects cholesterol esterification to exacerbate hepatocarcinogenesis 

脂质代谢组学助力P53调控肝癌研究

● 期刊:Hepatology.

 影响因子:17.298

 发表时间:2022.04

 合作单位:武汉大学

 检测方法:广泛靶向脂质组学检测


研究内容:P53缺失或突变直接导致USP19和SOAT1表达增加,以促进胆固醇酯化,从而支持肿瘤的发生。阿伐西米等药物对SOAT1的抑制代表了一种可行的新的治疗策略,特别是那些面对HCHFD而出现的、由p53缺失或突变驱动的肝癌。类似的治疗方法可能适用于其他癌症,因为Usp19和SOAT1上调的频率与较低的存活率相关。

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文十三


DIA定量蛋白质组学助力解析ICP发生的分子机制

Comprehensive  Analysis of Quantitative Proteomics With DIA Mass Spectrometry and ceRNA Network in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy 

● 期刊:Cell and Developmental Biology

 影响因子:6.081

 发表时间:2022.07

 合作单位:广州医科大学

 检测方法:DIA定量蛋白质组学检测


研究内容:本研究首次全面分析了10对ICP胎盘的蛋白质图谱,并构建了ceRNA网络。富集分析显示ICP胎盘中的自噬功能被破坏。核心蛋白—SPI1、FOXK1、SLC13A3和MBD2及其上游lncRNAs和miRNAs可能是缓解ICP患者围产期不良结局的潜在药物靶点。KCNQ1OT1和XIST作为一种常见的调控性lncRNA,可能在ICP发展中发挥重要作用,有必要进一步探讨它们的功能。此外,靶向自噬相关蛋白的药物可能是ICP治疗的一个有前途的未来。

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文十四


食源性碳点诱导小鼠高血糖症的潜在机制

Maltingbarley carbon dots-mediated oxidative stress promotes insulin resistance in mice via NF-κB pathway and MAPK cascade

● 期刊:Cell and Developmental Biology

 影响因子:6.518

 发表时间:2022.07

 合作单位:哈尔滨工业大学

 检测方法:转录组检测


研究内容:本实验探究了MBCDs诱导小鼠高血糖症的潜在机制。MBCDs诱导的ROS过量产生作为刺激信号分子激活Nrf2/NF-κB/MAPK信号,导致IR和高血糖症。长期摄入啤酒中的CDs可能导致葡萄糖稳态失衡,这可以通过抑制ROS的产生来改善。该研究为科学评价食源性CDs的毒理学效应提供了重要参考。

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文十五


迈维代谢RNA修饰检测助力病毒感染分子机制研究

N4-acetylcytidine regulates the replication and pathogenicity of enterovirus 71 

● 期刊:Nucleic Acids Research

 影响因子:19.160

 发表时间:2022.08

 合作单位:深圳大学

 检测方法:RNA修饰检测


研究内容:本文结果表明ac4C在病毒感染中起关键作用,并证明EV71与宿主ac4C修饰系统相互作用来调节复制。ac4C通过促进RNA翻译、RNA稳定性和RNA与3D的结合来增强EV71的复制。此外,ac4C突变体在小鼠中表现出降低的致病性。然而,还需要更多的工作来阐明ac4C调节病毒RNA功能的分子机制,例如,确定参与调节病毒RNA稳定性的因子,以及评估ac4C对3D构象变化的影响。本次研究数据揭示了ac4C在RNA病毒在细胞质中复制的基本功能,并为EV71感染的预防和治疗提供了一个新的靶点。

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文十六


Nat Genet发表中山大学肿瘤中心RNA m6A形成与DNA去甲基化结合介导的染色质可及性和基因转录的调控机制

RNA m6A regulates transcription via DNA demethylation and chromatin accessibility

● 期刊:Nature Genetics

 影响因子:41.3

 发表时间:2022.09

 合作单位:中山大学

 检测方法:核酸修饰检测


研究内容:本文描述了RNA m6A形成与DNA去甲基化结合介导的染色质可及性和基因转录的调控机制,强调了RNA m6A与DNA修饰之间的串扰在生理和致病过程中的重要性。 

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文十七


脊髓损伤患者中菌群与机体的共代谢机制

Alterationsin gut microbiota are related to metabolite profiles in spinal cordinjury

● 期刊:Neural Regen Res

 影响因子:6.1

 发表时间:2022.10

 合作单位:山东第一医科大学附属中心医院

 检测方法:广泛靶向代谢组学及T500检测


研究内容:SCI可导致小鼠肠道菌群严重紊乱。同时,本文发现SCI组中27种代谢物减少,320种代谢物增加。结合KEGG富集分析结果,筛选出5种差异显著的代谢物(L-亮氨酸、L-蛋氨酸、L-苯丙氨酸、L-异亮氨酸和L-缬氨酸)作为可能在损伤部位产生一定影响的标志物。相关性分析结果表明,肠道菌群的改变与这五种代谢物相关。猜测可能的机制为:这五种代谢物的积累,可能激活氧化应激和炎症反应,参与SCI损伤后的继发性损伤,从而导致菌群失调。本研究结果为通过粪便微生物移植改善SCI后继发性损伤提供了新的理论依据。

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文十八


代谢物与冠状动脉预后和左室重构的新关系

Plasma metabolomics provides new insights into the relationship between metabolites and outcomes and left ventricular remodeling of coronary artery disease

● 期刊:Cell Biosci

 影响因子:9.5

 发表时间:2022.10

 合作单位:广东省人民医院

 检测方法:广泛靶向代谢组学检测


研究内容:本研究为冠心病左室功能不全患者血浆代谢物与临床结果及其中间病理过程的关系提供了新的认识。整合代谢物的预测模型有助于提高CAD死亡和MACE的风险分层。代谢特征似乎增加了死亡或MACE风险,部分原因是促进不利的左心室功能障碍,这为进一步研究CAD的潜在治疗靶点提供了支持。

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文十九


TM广靶单组学轻松发文思路挖掘颅内动脉瘤破裂标志物

Plasma metabolic signatures for intracranial aneurysm and its rupture identified by pseudotargeted metabolomics

● 期刊:Clinica Chimica Acta

 影响因子:6.314

 发表时间:2022.11

 合作单位:南方医科大学珠江医院

 检测方法:TM广靶代谢组


研究内容:作者进行了一项TM-广泛靶向代谢组学研究,系统地定义IA发生过程中的代谢概况和相关途径。代谢组学分析显示,与对照组相比,UIAs患者的代谢途径有显著的9种之多,其中谷胱甘肽代谢变化最为显著。此外,两种途径似乎在从UIA到RIA的进展中起着至关重要的作用。此外,作者开发了综合生物标志物发现策略,进一步选择和结构验证两组基于6和5代谢产物的生物标志物组合,使用两种机器学习算法(LASSO和随机森林)对UIA及其破裂进行分类,具有潜在的临床应用价值,这是一种越来越被认为是评估和预测疾病状态的有效方法。

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文二十


Nature子刊:新发1型糖尿病患儿肠道菌群的功能和代谢变化

Functional and metabolic alterations of gut microbiota in children with new-onset type 1 diabetes

● 期刊:Nature Communications

 影响因子:17.694

 发表时间:2022.10

 合作单位:复旦大学附属儿科医院&上海中医药大学

 检测方法:广泛靶向代谢组&短链脂肪酸检测


研究内容:该多组学研究和动物实验扩展了我们对T1D微生物功能和代谢异常的见解,表明特定肠道细菌和代谢产物可作为T1D新的辅助诊断、预防和治疗靶点。

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大好时代,

希望每个科研人都能C位出圈!




迈步前行,维新不辍

01
初具规模

●公司现有近1.5万平实验室与办公室,总部位于武汉,另设华东研发中心、长沙诊断产品研发与生产中心;
●公司现有
CT+BT+IT研究背景组成的近500人交叉型人才团队,其中研发技术人员占60%
作为国内专业的代谢组学研究中心,质谱仪数量已超过40套,主要来自AB SCIEX/Agilent/Thermo/BRUKER

等知名质谱品牌。


02
创新技术

●创新性地开发了广泛靶向代谢组检测技术,构建了业内领先27w个物质组成的代谢组学数据库
●自主开发了转录组+代谢组、mGWAS、空间代谢组、4D蛋白组和单细胞多组学等领先的
生信算法
累计发表800多篇论文,其中CNS及其子刊10多篇,参与发表了首篇新冠代谢组和脂质组研究论文。


03
砥砺奋进

●2021年9月完成1亿元A轮融资,由红杉资本中国基金独家领投,加速CRO和临床质谱研发;
●2022年初在美国Boston建立海外子公司并正式运营;海外子公司网址:www.metwarebio.com

●2022年相继推出4D蛋白质组、时空多组学和10多个临床质谱产品。



 

敦煌沙漠之行







未来迈维代谢的两架马车创新IVD和科技服务,将带领整个迈维走向更高更远的天地!




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