高通量高深度蛋白质组学研究解决方案：Zeno™ SWATH® DIA全景质谱采集新技术

2022-11-09 14:01:40, SCIEX SCIEX

随着蛋白质组学应用领域的不断发展，人们正在研究更大的生物队列，通常使用从生物样本库或其他来源难以获得的珍贵样本进行研究。由于体液、组织、细胞等生物样品的复杂性，数据依赖性采集(DDA)技术具有随机性，因此在进行蛋白质鉴定和定量时有一定局限。而数据非依赖性采集（DIA或者SWATH DIA）技术可以克服这一局限，尤其是Zeno™ SWATH® DIA技术可使二级质谱灵敏度提高5-6倍左右，在进行复杂基质的蛋白质鉴定和定量时效果要优于DDA技术，这一优势在高通量高深度蛋白质组学研究中表现得尤为突出。



ZenoTOF™ 7600系统联用微升液相用于高通量定量蛋白质组学研究


使用ZenoTOF 7600系统连接微升流速液相，应用Zeno SWATH DIA流程，进行高通量蛋白质组学研究，考察蛋白质鉴定和定量结果。


样本：HeLa细胞或K562 细胞裂解产物

液相系统：Evosep One 系统 (Evosep, Denmark)的预设方法200 SPD、100 SPD 和 60 SPD（sample per day）；或ACQUITY UPLC M-Class液相系统（Waters）

质谱系统：ZenoTOF™ 7600系统（SCIEX），采集模式：Zeno SWATH DIA

主要优势：

  • 匹配高通量：单日可完成高达200个样本的蛋白质组质谱数据采集；

  • 兼顾深度覆盖：采用100 SPD的方法，进样200ng，仍然可以鉴定到约5499个蛋白质

  • 提升可定量蛋白质数量：在鉴定到的蛋白质组中有约90%的蛋白质可被定量（CV<20%）

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ZenoTOF™ 7600联用纳升液相用于高深度蛋白质组学研究


样本：K562细胞裂解液

液相系统：NanoLC 425系统 (SCIEX) 或ACQUITY UPLC M-Class液相系统（Waters）

质谱系统：ZenoTOF™ 7600系统（SCIEX），采集模式：Zeno SWATH DIA

主要优势：

  • 纳升流速色谱体系下获得更高的灵敏度和更好的色谱分离效率

  • Zeno SWATH DIA技术的高灵敏度和高扫描速度，实现蛋白质组全景覆盖

  • 减少进样量，提升耐用性，同时获得高深度高重现度的蛋白质组覆盖


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ZenoTOF™ 7600联用纳升液相用于250pg超微量蛋白质组学研究


样本：K562细胞裂解液

液相系统：ACQUITY UPLC M-Class液相系统（Waters）

质谱系统：ZenoTOF™ 7600系统，采集模式：Zeno SWATH DIA

主要优势：

  • 纳升体系下实现皮克级超微量上样，面向单细胞和极微量样本分析

  • Zeno SWATH DIA技术的高灵敏度，可在250pg样本中鉴定到近千个蛋白质

  • 即使分析极微量的样本，也能够获得CV<20%的可重现定量结果


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