2022-10-19 14:15:53, APT-MKT 上海中科新生命生物科技有限公司
随着对生命体深入认知需求的不断提升,生命科学研究正聚焦于更高分辨率及更高维度——即单细胞及空间水平。通过单细胞及空间组学,可以获得样本中每个细胞及其在组织空间位置上的分子表达水平,使得人们能够更精准地针对细胞亚群或特定空间区域进行研究及后续干预。然而,您是否了解现阶段有哪些主流的单细胞及空间组学技术呢?下面小编来为您盘点一番。
单细胞转录组
毫无疑问,单细胞转录组是这类技术中成熟最早,应用最为广泛的技术。它解决了bulk转录组无法解析细胞异质性的问题,大幅推动了肿瘤、免疫、神经、发育等多个领域的研究。
主要解决问题
细胞亚群的组成及差异;
细胞亚群的基因表达图谱及细胞间表达差异。
【中科新生命】单细胞转录组产品特色
采用10x Genomics 最新 Chromium X 平台,获得更高的细胞检测通量及更稳定的性能;
数十种组织解离经验及标准流程,包括FFPE组织、冻存组织等疑难样本。
单细胞蛋白质组
蛋白质是执行生物功能的主要分子,也是现阶段药物研发的主要对象。同时,由于转录后调控的广泛存在,同一基因的mRNA和蛋白表达状态往往不一致。因此,单细胞蛋白质组研究有着其不可替代的意义。
以技术流派维度区分,细胞表面蛋白(CITE-seq)、质谱流式(CyTOF)等技术保留了单细胞转录组细胞通量高的优势,但也存在明显的缺陷:检测蛋白数量少(~平均约数十个蛋白)且只针对特定靶向蛋白。
与此同时,近年来出现了一种新的技术流派SCoPE2-MS——基于微孔板收集制备单细胞蛋白溶液,通过高灵敏度质谱实现单细胞蛋白质组检测。在此基础上,中科新生命合作参与了该方法的优化研发,实现了在384孔板完成样本制备(细胞分选-蛋白提取-酶解-TMT标记)一体化流程,可实现高达上千个细胞的单细胞蛋白质组学分析。
主要解决问题
高灵敏度的单细胞蛋白质组表达图谱及细胞间蛋白表达差异。
【中科新生命】单细胞蛋白质组产品特色
超高蛋白检测数量;
完善的样本前处理及后续分析流程。
深度空间代谢组
空间组学是指在保持样本原有空间位置分布的基础上,对组织内各个位置进行高通量组学检测的技术手段。深度空间代谢组主要利用质谱成像技术,实现空间水平高分辨率且能精准定位组织中的代谢物分布。对组织中的代谢异质研究、积累和调控机理至关重要。
主要解决问题
空间水平高分辨率靶向/非靶向代谢组检测。
【中科新生命】深度空间代谢组产品特色
采用超高灵敏度基质辅助激光解吸电离技术(MALDI2),实现低至5µm的空间分辨率;
专业质谱成像及化合物定性软件,保证分析可靠性;
提供组织切片-基质喷涂-上机检测-数据分析完整解决方案。
空间转录组
目前,已有多种商业化技术手段可实现空间位置水平上转录组的检测,例如:10x Genomics Visium、GeoMx Digital Spatial Profiler(DSP)等。为了满足不同的研究需求,需要灵活选择不同的技术进行检测。
主要解决问题
空间水平细胞亚群分布;
空间水平基因表达图谱及差异检测。
【中科新生命】空间转录组产品特色
多平台布局,可根据整体实验方案灵活选择;
全套组织切片-空间转录文库构建-数据分析解决方案流程。
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