直播回放 | 华大智造单细胞平台C4 - Cell for All线上研讨会系列第三期:动物单细胞研究最新成果 精彩回顾

2022-08-12 05:28:27, 共享未来的 深圳华大智造科技有限公司



华大智造单细胞平台C4 - Cell for All线上研讨会系列第三期“动物单细胞研究最新成果”已经于2022年8月5日下午成功举办。本次研讨会与大家分享了两项应用DNBelab C4单细胞建库平台和DNBSEQ测序平台开展的动物单细胞研究成果。
















































“超个体”蚂蚁大脑细胞图谱研究
















































深圳华大生命科学研究院李启业博士分享了“利用单细胞转录组技术追踪蚂蚁社会分工的神经生物学基础”的主题报告。本研究首次应用单细胞测序技术,构建覆盖蚂蚁社会中所有分工角色的成体形态的大脑细胞图谱。


研究者通过单细胞测序分析了法老蚁4种不同品级(工蚁、雄蚁、处女繁殖蚁和蚁后)的成虫大脑,并划分出43种不同的细胞类群。接下来通过分析蚂蚁大脑具有的细胞类型,并结合形态学测量和分子生化分析等研究方法,揭示了蚂蚁伴随着社会分工而出现的脑部特异化现象和不同社会品级行为模式差异的神经基础。研究者还将蚂蚁大脑与模式昆虫果蝇的大脑进行了比较。


综合以上分析发现,尽管蚂蚁不同品级个体的大脑有不同方向和程度的特化,然而彼此之间又功能互补,执行不同的社会行为和功能,从而使得整个蚁群能够同时拥有生殖、育幼、觅食、防御等全面的功能。这也解释了作为“超个体”的蚂蚁为何只有在一窝蚂蚁凑成一个整体时,作为一个生物的所有生理机能才能齐全。

图1:单细胞测序分析蚂蚁大脑,划分出43种不同的细胞类群
















































斑马鱼胚胎早期发育的时空转录组图谱研究
















































深圳华大生命科学研究院刘畅博士分享了 “Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis” 主题报告。本研究首次绘制了斑马鱼胚胎早期发育的时空转录组图谱,构建了在组织空间维度上的发育轨迹。


研究者应用Stereo-seq技术结合多切片策略,选取受精后24h内6个关键发育时间点(3.3、5.25、10、12、18、24hpf)的斑马鱼胚胎,共91张矢状面冰冻切片进行了分析,在较高分辨率水平上剖析了斑马鱼早期胚胎发育中基因表达和调控网络的时空动态,并在此基础上搭建了斑马鱼早期胚胎发生时空转录组图谱在线开放资源库ZESTA (http://stereomap.cngb.org/zebrafish/data_index)。研究者还对每个时间点的Stereo-seq数据和scRNA-seq数据进行整合分析,构建了斑马鱼胚胎发生过程中细胞命运转变和细胞分子变化的时空发育轨迹,探索性地研究了细胞空间微环境与分化方向之间的关联。

图2:选取与时空组Stereo-seq相对应时间点的胚胎进行单细胞测序,并利用SPOTlight整合scRNA-seq和Stereo-seq数据。

















































精彩回顾















































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