2022-07-17 04:07:25, 张振义 布鲁克衍射荧光事业部
对于非缺面孪晶导致|Fo|不对的问题,如果我们养成了良好的习惯:对于所有的晶体都应在RLATT里检查倒易点阵的排列,那么我们就会在第一时间去发现晶体的问题。然而除了非缺面孪晶,晶体的问题还包括很多,比如超晶格,调制结构(周期或者非周期的卫星衍射点),弥散的衍射信号等。但是单晶衍射数据处理的过程中,通常是基于定出的晶胞对有限的数据进行还原,而不是完全的数据,所以很多被排除在外的信号其实代表了晶体内含的一些结构性质。而这些在hkl文件并不会体现出来。从某种意义上说,单晶衍射是采用完美晶体的理论对不完美晶体进行的结构解析,所以hkl文件并不是衍射信息的全部。相对于单晶衍射来说,粉末衍射虽然没有单晶衍射数据的清晰,但是完全的衍射信息却全都记录在内,没有单晶衍射的“挑选”问题,所以更加的真实。所以不管什么样的数据,都不应该抛开衍射图,而把眼光局限在hkl文件上。实际上,大多数晶体学的问题都能在衍射图上找到答案。
当然Q峰不只是正峰,还有负峰。不正常的Q峰也不仅仅是,在我们常见的原子的周围,也完全可以在原子的位置。这时候如果你不会看电子云图(相对于Q峰,我更喜欢用电子云图来指导结构精修),表观上看到的就是原子热震动的诡异,太大或者太小。尤其是我们常说的截断效应造成的Q峰。截断效应的根本是我们无法收集到高分辨率的数据造成的数据短缺,从而导致的Fourier转换时峰的叠加造成的问题。它一般出现在原子的周围,像原子周围波浪一样。同时也会在某些特定的位置,形成峰的叠加或抵消。这个问题很多时候可以通过更高分辨率的数据得以解决,因为数学方程就在那里。所以如果晶体质量很好,可以收集高分辨率的数据,眼光就不要局限在师兄教你的0.83Å。如下图中的数据,原子不正常的NPD(不正常的叠加峰导致),仅仅提高一下分辨率就迎刃而解。
截断效应这是一个很大的话题,有时间我们深入的探索一下,不过简而言之,不要动不动就让截断效应来背锅...(未完待续)
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