使用 SoftMax Pro 7 软件进行生物相对效价的测定

2022-04-29 18:29:47, Judy 美谷分子仪器(上海)有限公司


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生物相对效价介绍

由于生物试验系统存在很多可变性,包括来自动物、细胞、仪器、试剂以及日常和实验室之间的变化。效价的绝对测量比相对与标准品效价的测量更具可变性[ 1 ],所以测试品的效价通常是通过与标准品的效价的比较来测量的,这称之为相对效价。相对效价测定的前提是测试品和标准品具有相同的活性物质,能够产生相同的生物学效应,这相当于两种产品具有平行的剂量-反应曲线,相对效价就可以从剂量-反应曲线之间的(恒定)水平距离估计出来,如图 1 所示[ 2 ]

图 1 :平行( a )和非平行( b )  4P 剂量-反应曲线

 (a) 平行曲线:无论生物效应(强度)如何,曲线之间的水平距离总是相同的,因此相关效价的估计值是常数;(b) 非平行曲线:随着强度的增加,曲线之间的水平距离变宽,相对效价的估计值随剂量而变化。


平行性检验的两类方法

两条曲线的平行性检验的方法根据平行性假设的验证方法分为两大类:一类是差异性检验,包括 F 检验和卡方检验,假设两条剂量-反应曲线是平行的,并寻找与这一假设相矛盾的证据;另一类是等效性检验,假设两条剂量-反应曲线是不平行,并寻找证据来证明这一假设的正确。F 检验是应用较简单的,也容易进行分析,适用于所有生物测定数据的常见模型:线性模型、非线性模型和广义线性模型。卡方检验对权重非常敏感,所得结论在整个方法的生命周期中难以稳健[ 3 ]。而等效性检验的关键是确定出科学、可靠的等效区间,这不仅需要积累足够多历史数据,还需要采用一定的统计学方法来确定最佳等效界值[ 4 ]


生物检定法的统计分析步骤

目前中国药典的生物检定统计法已收录了 F 检验的方法,并在量反应平行线测定法和四参数回归计算法两种方法中应用。这两种生物效价测定方法的统计分析步骤是一致的:模型方法的确认→实验设计的选择→异常数据的分析→统计检验→结论。

1

首先需要根据所检测产品的剂量-反应曲线选择合适的统计分析模型。模型筛选需要复杂的计算,所以建议使用专业的统计软件来协助完成[ 3 ]。SoftMax Pro 软件提供 Liner、semi-log、log-log、4p-logistic 等 21 种线性和非线性曲线拟合模型进行选择和比较,并且通过决定系数 R2、失拟 F 检验(残差平方和 SSE 和校正赤迟信息准则 AICc )及参数独立性( independence )来判断曲线模型拟合优劣,以此验证模型的有效性[ 5 ]

2

对于实验设计类型,根据不同的测定方法可加以限制的因级数来选择。药典给出了三种实验设计类型:随机设计、随机区组设计和交叉设计

3

对于异常数据的处理药典提出了狄克森( Dixon )检验法和格拉布斯( Grubbs )检验法。SoftMax Pro 7.1x 软件增加的 ESDMarkOutliers 函数可进行 Grubbs 检验法的检查,当指定异常值数目和检验的显著性水平之后,软件会给出这组数据中的异常值,并将其标记为“ Outlier (离群值)”,如图 2 所示。

图 2 :SMP 软件中 Grubbs 检验法计算

4

实验数据的统计分析,首先要满足三大前提条件:数据具有独立性、正态性和方差恒定,才能确保所计算的结果具有可靠性。数据独立性一般通过实验设计和具体操作要求进行保证,比如:在细胞类生物效价测定实验中,避免使用有严重位置效应的细胞孔;由于生物实验的变异大,在各样品不同剂量组设置多个重复样本;尽量使用 2 个以上的高浓度样本进行独立的系列稀释等。


当生物效价测定的结果不符合正态分布或方差齐性时,需要先对原始数据进行相应的转换,如对正偏态的数据使用对数转换,对于泊松分布的数据使用平方根转换等。如果转换后还达不到要求,需要再采用狄克森法或格拉布斯法进行必要的异常值检查和剔除[ 3 ]。当组内方差有明显差异时,通过加权的方式对曲线进行计算,使用合适的权重因子来调整数据,以便减少高浓度与低浓度之间的浓度偏差[ 6 ]。然后对实验数据进行平行性检验的统计分析,以四参数回归计算法为例,我们参照生物检定法的实例 6 人粒细胞刺激因子( GCSF )生物学活性测定— NFS-60 细胞/ MTT  比色法的方差分析公式,使用 SoftMax Pro 7.x 软件进行统计分析,其分析结果与药典实例 6 中的分析结果完全一致,如图 3 所示。

图 3 :SoftMax Pro 7.x 软件四参数回归计算法方差分析的结果(a)和 药典实例 6 中展示的方差分析结果(b)

5

根据 F 检验的统计分析结果,如果符合药典生物检定法中可靠性测验结果判断的条件,那么实验结果被认为是可靠和有效的。只有实验结果是有效的,方可按等反应剂量比的原则,采用约束模型中的标准品和测试品的剂量-反应曲线来计算相对效价。在 SoftMax Pro 7.x 软件中,对于平行直线模型的相对效价可以使用函数 RelPotPLA 进行计算,对于四参数模型的相对效价可以采用标准品和测试品约束拟合曲线的 EC50 的比值来计算。使用函数 RelPotCILowerPLA 和函数  RelPotCIUpperPLA 计算置信区间的下限和上限。在 SoftMax Pro 7.x 软件中药典实例 6 的实验结果判断及相对效价和相对置信区间的计算结果,如图 4 所示,这与药典中的计算结果(未展示)也是完全一致的。

图 4 :SoftMax Pro 7.x 软件药典

实例 6 的相对效价

相对置信区间的计算结果。



总结

SoftMax Pro 7 软件内置 21 种曲线拟合模型,包括常用的 Linear、semi-log、log-log 和 4p-logistic 等拟合方式,便于拟合模型的筛选和使用。可以选择使用自由拟合和约束拟合模型以及高级的统计学公式进行计算分析,完成生物相对效价的测定。另外,我们已经在 SoftMax Pro 7 软件中建立了符合中国药典生物检定法要求的随机区组设计 3.3 法分析模板、随机设计 3.3 法分析模板、随机设计 3.3 法-对数转换分析模板、随机设计 4.4 法分析模板、随机设计 4.4 法-对数转换分析模板及四参数计算回归法分析模板,如果有需要请联系我们。


参考文献:

[1] USP42.〈1032〉Design and development of biological assays[S]. 2019.

[2] Fleetwood K, Bursa F, Yellowlees A. Parallelism in Practice: Approaches to Parallelism in Bioassays. PDA Journal of Pharmaceutical Science and Technology. 2015 Mar 1;69(2):248-63.

[3] TAN De-jiang,HUANG Wei-jin,ZHU Rong-die et al. Some attention issues in potency calculating using 4-parameter model. Chin J Pharm Anal 2018,38(7):1238-1242.

[4] FENG GS,ZHU RD,TAN DJ,et al.The determination of equivalence limits and application in pharmaceuticals assays[J].Natl Med J China,2017,97(48):3835

[5] 使用 SoftMax Pro 7 软件选择最佳的曲线拟合方式,Molecular Devices Application note

[6] 如何在SoftMax Pro 7 软件中选择最佳权重因子, Molecular Devices Application note

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