2022-03-25 03:06:40, ACD/Labs 李丹 Advanced Chemistry Development, Inc. (ACD/Labs)
引言
ACD/pH Selector是同时预测多结构logD曲线的工具。通过研究多目标结构的logD与pH的变化曲线,可以帮助用户更科学地制定前期的筛选策略。本文着重于pH Selector界面的介绍,有关预测结果的解读请见pH-logD曲线在HPLC分析方法开发过程的应用策略(
打开软件
在开始菜单栏下的ACDLabs文件下找到PhysChem History并
软件打开后的界面如下图所示,首先用户需要在Options下的Calculation中对预测算法进行设定。推荐的算法是GALAS,如果用户想了解该算法的具体内容可以
在作图界面用户需要录入所有的目标结构。录入完结构后,
注意:如果结构中有手性异构体,其logD是一样的。软件只会显示其中一个结构的pH-logD曲线图。
下图是软件预测后的界面,用户需要
预测结果界面说明
结构显示窗口
用户可以使用导航按钮或将鼠标悬停在Structure IDs图例中的ID上,在不同结构之间切换。
pH-logD曲线图
用户可以利用pH-logD曲线图获取有用信息,横坐标是pH值,纵坐标为logD。如果用户发现横坐标的pH值不是0-14,勾选上Show Full pH Range即可。用户也可以勾掉Structure IDs中的某些结构让其不显示在logD叠图中。在LogD曲线图中,所选结构的曲线以粗体显示。
图中的不同颜色根据下图的规则行进显示。绿色区域代表的是所有结构离子化状态占比在0-10%时对应的pH范围,橙色区域代表的是所有结构离子化状态占比在10-25%时对应的pH范围,红色区域代表的是所有结构离子化状态占比在25-50%时对应的pH范围。用户可以根据研究目标结构的数量有选择性的利用这些信息。
其中在叠图中还有四条黑色的竖线,一般默认是4条,用户可以通过如下窗口对黑线的条数进行调整。软件放置四条黑线的原则是尽量远离红色区域并让彼此距离最大,可以人为调整黑线放置的位置。用户在分析pH-logD叠图时可以不用考虑黑线对应的pH值。
离子形态曲线
横坐标为pH值,纵坐标为百分比,表示的是选定结构在不同pH值下的微观状态以及不同微观状态所占比例。其中不同的颜色的曲线代表的是对应的微观离子所带电荷情况及存在状态。通常在分析pH-logD图时,不太关注该曲线图。如果需要利用物质不同带电荷状态解决分离问题,建议在Percepta中的pKa预测模块中分析。
色谱柱列表
该列表不是软件在推荐色谱柱,而是提供不同色谱柱的pH值耐受情况。可以
log D Table
表中以0.5个pH值为单位显示了所有结构在不同pH值下具体的logD数值大小。不同的颜色与pH-logD图中的颜色保持一致。
往期回顾
01
pH-logD曲线在HPLC分析方法开发过程的应用策略
02
如何对齐pH selector的logD和Percepta logD的纵坐标
06-27 福立仪器
好礼来袭 | 分享您身边的特洁安身影06-27
大盘取厚势 落子开新局:战略聚焦开启品牌发展新篇章——访Veralto大中华区总裁秦晓培06-27 星羽
实验操作 | 质粒构建、转化、提取、鉴定、转染、测定(完整版)06-27 小 M
有投必奖 | 大家都用 MCE 产品做了啥? (感染领域)06-27 小 M
科研助攻 | 一文讲清:如何破解 PPI 靶点成药难题06-27 小 M
干货分享 | 谈谈天然产物的改构策略06-27 小 M
玉研口鼻暴露系统 | 精准、可控、高通量的动物肺部疾病造模工具,助力创新药物研发06-26 玉研仪器
高分离 高灵敏 高通量——福立液相LC5190重新定义分离需求06-26 福立仪器
医药行业指南:电位滴定仪选型攻略来啦~06-26
屹路同行 悦启新程06-26 屹尧科技
徕卡精准空间生物学解决方案 第四弹06-26 童昕、南希
【直播预告】第一届大湾区生物电镜制样讲习班06-26 徕卡显微系统
徕卡常规显微镜历经严苛的ISO9022标准测试06-26 徕卡显微系统
Viventis LS2 Live 光片显微镜发布会06-26 徕卡显微系统
前沿应用 | 经皮无创血糖检测中葡萄糖拉曼峰直接观测06-26 鉴知技术
SNEC光伏展圆满落幕 | OTT HydroMet闪耀时刻精彩回顾06-26 OTT HydroMet
激光指向稳定在光刻系统应用中的关键作用,及其优化方案!06-26 圈内人都会关注
推陈出新!通微公司携新品亮相本届CPHI06-26 Unimicro
远离氟污染!开启无氟接触前处理技术新篇章06-26