2021-11-11 19:17:58, 景杰学术 杭州景杰生物科技股份有限公司
糖基化修饰是广泛分布且非常重要的翻译后修饰之一,对人体维持正常的生理功能发挥举足轻重的作用,一直是修饰组学研究的焦点之一。在实际应用中,多种疾病诊断的生物标志物和蛋白质药物是糖蛋白,大量糖蛋白的特殊功能与疾病的相关性亟待深入解析。由于其重要价值,糖蛋白质组学(Glycoproteomics)于2021年被Nature Methods杂志列为重点关注技术(Method to Watch)。
然而,糖蛋白的鉴定目前仍是蛋白质组学中最难的部分。组成糖蛋白的糖原类型多样、糖链结构复杂等原因是阻碍糖蛋白组学研究的主要障碍。传统的N-糖蛋白质组学研究普遍采用的方法是将聚糖去除,对糖链与所修饰的多肽分开进行分析。该方法虽降低了分析难度,却也丢失了糖链与蛋白质糖基化位点间重要的对应关系信息。
图、常见的蛋白质糖基化的分类与结构
景杰生物基于质谱的完整N-糖肽分析产品,可以同时获得糖基化位点及其对应糖型的完整信息,有助于获取糖链和糖基化位点间的对应关系信息,为生物标志物发现和疾病致病机理等研究提供更有力的研究工具。
图、完整N-糖肽组学分析提供糖基化修饰位点上的完整糖链信息
产品特色
Advantages
信息完整可获取糖蛋白+糖基化修饰位点+完整糖链信息
灵敏度高使用QE HF-X超高分辨质谱仪
质量保证 临床大队列组织样本项目实测验证
深度分析 创新修饰多组学,深入挖掘信息
内部验证数据结果
*组学项目结果受样本状态影响,以上为测试结果,不代表深度承诺
典型案例
Cell | 胰腺癌潜在治疗靶点与早期诊断标志物
该研究运用完整N-糖肽技术比较了PDAC、NATs和正常导管组织的分子特征,表明抑制相关糖蛋白生物合成,或可用于PDAC的早期发现和治疗干预。PDAC中有75个N-连接糖蛋白显著上调,上调糖蛋白的糖型主要为唾液酸糖型和/或岩藻糖型。聚焦其独特糖型可能会增加癌症标志物的特异性。抑制相关糖基化酶活性可削弱肿瘤中糖基化修饰上调,可能成为一种潜在的PDAC治疗策略。
Nat Commun | 完整N-糖肽揭示高级别浆液性卵巢癌亚型及临床预后分析
该研究对119例HGSC组织样本进行了N-完整糖肽修饰组学分析,聚类分析将所有样本分成三类肿瘤亚型,且N-糖结构与高级别浆液性卵巢癌分子分型呈现出高度相关性,比如岩藻糖基化与间充质亚型之间的相关性等。进一步的生存分析显示糖蛋白糖型信息(如唾液酸糖型、高甘露糖型)与HGSC患者临床预后差有关。
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参考文献
1. Singh, A. Glycoproteomics. Nat Methods 18, 28 (2021).
2. Liwei Cao, et al., 2021,Proteogenomic characterization of pancreatic ductal adenocarcinoma. Cell.
3. Jianbo Pan, et al., 2020. Glycoproteomics-based signatures for tumor subtyping and clinical outcome prediction of high-grade serous ovarian cancer. Nature Communications.
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