最简单的16S测序也能发14分的Paper

2021-06-29 11:02:15, TIANGEN


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“荣登”《Neuron》IF=14.4


 文  章  题  目 

Mechanisms Underlying Microbial-Mediated Changes in Social Behavior in Mouse Models of Autism Spectrum Disorder


研究背景


自闭症谱系障碍(ASD)的发病率在全球范围内持续上升,因其受遗传因素和环境因素的影响,有效治疗ASD的方法仍不明确。自闭症儿童患胃肠道疾病的可能性是无发育障碍儿童的3.5倍。


动物模型的研究表明,肠道微生物能够以一种非常强大的方式调节中枢神经系统(CNS)驱动的行为。本文研究发现L.reuteri(罗伊氏杆菌)能够逆转不同ASD小鼠模型的社会缺陷,通过这种单一细菌进行微生物治疗,可以挽救遗传、环境和特发性ASD小鼠模型中的社会缺陷。


实验材料


  • WT小鼠:野生型小鼠;

  • Shank3B−/−鼠:SHANK3基因的突变会导致人出现自闭症,Shank3B−/−小鼠也表现类似自闭症的社会行为;

  • BTBR 小鼠:近交系小鼠表现出ASD的核心症状,包括异常的社会行为,鉴于在BTBR小鼠基因组中没有发现ASD风险基因的遗传变异,该模型被认为是ASD的特发性模型;

  • C57BL/6J小鼠:属于近交系小鼠,是实验动物小鼠中使用最广泛的品系之一。

所有小鼠都保持12h的光/暗循环,并且可以随意获得食物和水。对于所有小鼠模型,只有雄性小鼠被纳入研究,每个实验至少使用两窝。


研究思路


按照提出生物学问题,解决生物学问题的逻辑,文章分两步走:

Q1:L. reuteri可以逆转ASD 小鼠的行为缺陷,这种影响是否在其他ASD小鼠模型中也同样发挥作用?

A1:根据ASD发病机制,选择Shank3B−/−小鼠模型和BTBR 小鼠模型,通过L.reuteri 干预实验确定,L.reuteri可以逆转其他ASD小鼠模型的行为缺陷。


Q2:发挥作用的途径是什么?

A2:首先研究是否是通过肠道菌群的改变从而改善其ASD行为。排除肠道菌群影响之后,基于普遍认知继续从血液循环和迷走神经两个方面找原因。最终通过“肠道渗漏”实验和“迷走神经切断术”将发挥作用的途径锁定在迷走神经。


结果展示


01. Shank3B−/−小鼠肠道菌群组成及L.reuteri对其ASD行为的改变 

Shank3B−/−小鼠表现ASD行为,主成分分析与shannon指数显示Shank3B−/−小鼠与对照小鼠在肠道菌群组成上差异显著。用L.reuteri处理Shank3B−/−小鼠,根据三箱社交偏好行为观察、社交互动时间等方法评估,结果显示,Shank3B−/−小鼠在社会行为上有明显提升,与对照小鼠表现相似。说明L.reuteri 能够逆转Shank3B−/−小鼠的ASD行为。


02. BTBR小鼠肠道菌群组成及L.reuteri对其ASD行为的改变

一些环境和遗传因素已被确定与自闭症发病率增加有关。然而,大多数ASD病例仍然是特发性的。BTBR近交系小鼠表现出ASD的核心症状,包括异常的社会行为。但在BTBR基因组中没有发现ASD风险基因的遗传变异,该模型被认为是ASD的特发性模型。


与C57BL/6J小鼠相比,BTBR小鼠的肠道微生物组成发生了显著改变, BTBR小鼠L.reuteri显著低于C57BL/6J小鼠,而与C57BL/6J小鼠共住可恢复其社会缺陷。


同样,直接用L.reuteri干预,可以逆转BTBR小鼠的ASD表现。


03. L.reuteri 干预后不改变小鼠肠道菌群结构

研究者借助Shank3B−/−小鼠模型,研究上述变化是否是通过调节肠道菌群产生的。通过16S扩增子,比较L.reuteri 处理前后的肠道菌群差异,发现L.reuteri 对宿主整体微生物组成没有显著影响。


04. 对于切断迷走神经的小鼠,L.reuteri 干预后不改变其ASD行为

基于普遍认知,人体存在双向“肠道微生物群-脑”轴,细菌在其中启动信号,通过血液循环或迷走神经从肠道传输到中枢神经系统。为了验证血液循环途径,作者进行了“肠道渗漏”实验,结果表明Shank3B−/−小鼠肠道通透性没有明显改变。之后研究迷走神经是否可以作为L.reuteri肠道和大脑之间的连接的途径,通过双侧膈下迷走神经切断术,发现L.reuteri在对照组小鼠的ASD社会行为有逆转作用,但对于迷走神经切断组小鼠没有ASD社会行为的逆转作用。


实验结论


>  用L.reuteri是一种很有前途的非侵入性微生物治疗ASD相关社会功能障碍的方法。

>  精准的微生物治疗可以通过迷走神经及多巴胺信号等途径帮助ASD小鼠在遗传、环境和社会缺陷方面改善。


文献引用

Sgritta M, Dooling SW, Buffington SA, Momin EN, Francis MB, Britton RA, Costa-Mattioli M. Mechanisms Underlying Microbial-Mediated Changes in Social Behavior in Mouse Models of Autism Spectrum Disorder. Neuron.2019Jan16;101(2):246-259.e6.

doi:10.1016/j.neuron.2018.11.018.Epub 2018 Dec 3. PMID: 30522820; PMCID: PMC6645363.


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