直播回顾|贺玖明教授课程回顾

2021-05-19 17:53:28, 生命科学 武汉迈维代谢生物科技股份有限公司


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3月25日贺玖明教授做一场关于“质谱成像和代谢组学研究”的课程报告。

有的小伙伴没能看直播,感觉错过了几个亿!

不过没关系,今天我们给大家准备了回看和PPT摘录!

代谢物常用分析方法包括MRI、PET-CT、光学成像、LC-MS、MALDI-MSI等技术,但这些方法只能针对特定的或已知的分子,实现生物体内多种分子的高覆盖、高灵敏的成像检测,仍然是一大难点。其中MRI、PET-CT、光学成像等多用于活体检测;LC-MS联用技术多用于体液或组织匀浆分析,混合后的代谢平均水平;无法满足原位与时空分析的需求;MALDI-MSI技术适合于蛋白质等大分子,需高真空,对代谢物分析专属性差、灵敏度低。

对于药物研发方面,了解药物的组织分布、药效和安全性是非常重要的。比如一个理想的抗肿瘤药物,需要有高的抗肿瘤活性(药物在肿瘤聚集和释放)和低的毒副作用(在正常组织暴露较少),也就是药物的靶向性递送很关键。目前抗肿瘤药物的研究趋势,已从细胞毒药物到分子靶向药物再到免疫治疗药物。总体来说,需要药物到达指定的靶器官,进入肿瘤部位后才能发挥药效。

质谱成像是很强的定性定量工具,还有分子定位作用,结合代谢组学研究同时实现功能识别。质谱成像的应用方向主要有分子组织学,临床医学方面的分子病理、分子分型、分子分期,代谢组学方面的代谢表型和标志物,新药研发方面的药物靶向分析和药效毒理研究。

新型常压敞开式离子化技术,优势是无需在高真空系统中操作、使用方便,有利于大体积、远距离样本的检测;无需复杂样本前处理,实现快速检测。我们课题组对成像装置进行了优化,通过一个接口就可以和不同厂家的仪器连接,实现检测灵敏度高、动态范围宽、化学特异性强的质谱分子成像新方法。AFAI-MSI技术可以检测超过1500个代谢物峰,包括胆碱、胆酸、脂质等多种代谢物,灵敏度达到pg级水平,能比较完整地检测出同一通路上的代谢物,比如中心碳代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢等。此外,利用AFAI-MSI技术对脑组织做冠状切面、矢状切面分析,发现了天冬氨酸、腺嘌呤等小分子,对大鼠脑组织进行3D成像可以更形象的看到代谢物空间分布。

质谱成像的方法做肿瘤的代谢组学研究。基本流程是首先得到很多光学的照片,比如免疫组化的染色图等,把它和质谱成像的图做精准的匹配,然后对感兴趣的区域做提取,提取出来后进行代谢组学的统计分析,基于多变量分析可发现很多的差异代谢物,然后用差异代谢物做分子的自动判别,对于一些代谢物可以做直接的分布展示,看出不同区域的代谢差异。

举个食管癌组织原位代谢组学研究的例子。收集了几百例的食管癌组织。组织类型分为癌变组织、癌旁上皮组织、癌旁肌肉组织、远端的正常上皮组织、远端的正常肌肉组织。检测结果可以看到癌变组织聚到一类,癌旁正常组织相对远端的正常组织具有更加接近癌变组织的趋势,揭示癌变对癌旁正常组织的代谢具有影响,在食管癌筛查诊断中具有可降低假阴性的意义。

在以上的基础上又提出了一个新的思路。关注肿瘤的代谢不仅仅是在代谢物的层面,还关注代谢酶的层面。之前做蛋白质组学的老师可能会知道,用蛋白质组学的方法来发现酶水平的变化,但是酶量可能会很少,数据会被高丰度蛋白所覆盖,所以用蛋白组学发现关键酶的效率是很低的。所以现在我们采用了新策略,就是通过代谢组的变化,通过代谢网络能推测起作用的改变的酶,然后用传统的生物学方法例如免疫组化来验证找到的酶的改变。


最后总结质谱成像的一些特点。




99%的代谢组学研究者都在阅读下文:

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