玩游戏就玩咱生物人的游戏!

2021-03-27 20:54:15, 海狸纳米科技 苏州海狸生物医学工程有限公司


一提起多人在线游戏,你的脑海中可能会记起诸多大名鼎鼎的成功者名头,如《魔兽世界》、《网路创世纪》。华盛顿大学的Howard Hughes医学研究中心的研究人员将神秘的蛋白质折叠(protein folding)世界进了在线游戏的竞技场。这个游戏名叫Foldit,让全世界的玩家比赛设计蛋白质,而科学家们则可以研究玩家设计的蛋白质,看看是否能运用到新药中。

开发者Popovic说,“我们的目标是让任何人都能操作,即使他们根本不了解生物化学或蛋白质折叠”。目前,这个游戏只能使用那些三维结构已被研究人员解决的蛋白质。但Popovic说,“不久之后会引入我们还不知道解决之法的蛋白质”。

Foldit 官网首页界面

要玩好这个游戏首先要对蛋白质有一点知识。蛋白质由氨基酸通过氨键链接构成,而我们看到的主干结构(螺旋、片状物)就已经是经过一点折叠形成的超二级结构了。当然,这还不算完,我们的任务就是把这些超二级结构组合起来使能量越低越好,这样才能得到高分。还有一点补充的知识可以在图中看到。

建议将此操作说明图点击放大查阅

下面说说技巧。在一个Puzzle刚开始的时候,首先要想好大概怎么折叠会比较好,然后用橡皮键把想要拉近的部分连接起来。橡皮键的使用很简单,在分子的一部分用右键拉出去放到分子的另一部分就行了。想要去掉的话也很容易,那东西旁边会有个小叉,点掉就是了。好了,连接好之后Wiggle一下,你会注意到分子就按照你的意思大概折起来了。Wiggle完之后Shake一下,然后去掉橡皮键再Wiggle一下Shake一下,分子就基本上叠好了。


但是这样还不够高分,怎么办呢?我们可以按照我的图上说明的几个原则稍微拉动一下整个分子。如果你想某些部分在你拖动的时候保持不动的话,用右键点击一下,这个部分就会被蓝色覆盖,也就是锁起来了。解锁也是用右键点击。注意在这里锁定对于Wiggle无效。稍稍拉动分子之后,Wiggle一下Shake一下(以后简便就叫W-S了~~~),分数就有可能提高。


接下来就是耐心了。不断摇动一下分子,然后W-S一下,如此重复。如果效果实在不好的话,可以Reset Puzzle重置一下用别的想法重新再来。


有时候Shake完之后再Shake一下还会有几分可加,所以可以试试。另外,Wiggle的算法就是在Rosetta里边用的调整算法,所以很占CPU,如果大家Wiggle后看见分数没怎么增加的话就赶快停了,免得浪费。
似乎差不多就是这样了~~~

游戏官网每年两次将举办蛋白结构预测大赛,并和所有玩家分享一些被预测出但还未被验证的出色玩家作品。在2010年的大赛中一个名为“空虚碾碎机”的队伍所预测的绿脓杆菌分泌蛋白结构获得了最后的胜利,而通过对他们作品的验证研究,科学家成功的破解出了猴子逆转录酶(M-PMV)的结构,而另一位名为Mimi的玩家作品也协助科学家还原蛋白酶(M-PMV)的天然构型。这些问题曾困扰全球医学界达15年之久,而现在真正切切的被那些仅仅留下ID的游戏玩家解决了。研究人员表示这个酶的结构可以帮助医学家设计新的抗反转录病毒的药物,对彻底解决艾滋病毒起了非常重要的作用。

该游戏官方网址:http://fold.it/portal/

(以上资料来源于网络,海狸纳米收集整理)

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