2020-12-16 11:55:13, 华质君 华质泰科生物技术(北京)有限公司
1、何为质谱成像?
成像质谱(IMS)为非常灵敏的分子成像技术,提供分子及其空间分辨信息。分析对象可以是组织切片、物质表面、单细胞等,能同时在一次实验中可视化数千个不同分子的分布信息。为多分子同时成像技术。适于内源性化合物如脂质、肽和蛋白质,及外源性化合物如聚合物、药物的分布研究,提供从细胞到有机体的详细的生物过程分子信息。
2、质谱成像需要考虑哪些因素?
选择成像技术需要考虑至少七大要素:(a)空间分辨率(采样点之间的距离);(b)靶点浓度或采样灵敏度(采样斑点的大小);(c)离子化方式(纳喷最灵敏、其次 MALDI、再次 DESI);(d)优化便捷性(高度自动化与否、是否需要基质、基质是否能喷匀、无需基质最好);(e)组织切片或样品形状的兼容性(MALDI 及 DESI 空间受限,flowprobe 及 LESA 非常灵活兼容、是否保障样品生鲜态);(f)温度可控性以避免组织分解(LESA 唯一可控温);(g)数据转换和图像处理(3D 最佳)。
3、分辨率和灵敏度可以兼得吗?
空间分辨率和灵敏度就是“鱼和熊掌不可兼得”的关系!空间分辨率太高,有限靶点内的分子数目很少,对后端质谱的灵敏度要求就非常地高。受制于目前市场上质谱技术的灵敏度限制,业界普遍认为有实用价值的成像空间分辨率是 10~30 微米。再小些的分辨率几无合适的质谱仪能匹配;大一点儿的分辨率能联用的质谱仪会很多,灵敏度不成问题。空间分辨率如超过 300 微米,通常归类为轮廓(Profiling)分析(不应再称为成像 Imaging),用于如药物的组织间或组织内分布,或材料表面轮廓分析。
AP/MALDI 大气压基质辅助激光解吸源
4、目前质谱成像技术有哪些?
1)动植物成像,AP/MALDI UHR 或 MALDI 为成像优先选型,可达 5 μm 微米空间分辨率,最好配置 3D 成像软件。需要事先均匀地喷涂或制备基质。
AP/MALDI 的优点(相较于真空 MALDI)是常压操作,兼容各类基质包括挥发性基质、保持生理样品的原生态特征。固态激光的寿命非常长(近五年不用换),调谐非常简便,精巧好用。后端可兼容各类好质谱(QQQ、QTRAP、QTOF、Orbi、FTMS 等,当然选择 QTOF 的好处是分子量上限几无限制,其他类质谱有限制)。多数真空 MALDI 只能接 TOF 或 TOF-TOF。
2)DESI 需要溶剂,非无损技术,无需基质,适用于小分子、次生代谢物、脂质、多肽等分子成像。调谐和优化较难,需要专业背景知识,空间分辨率通常到 30-50 μm 微米;同样,后端可接各类好质谱(QQQ、QTRAP、QTOF、Orbi、FTMS 等),后续只能联接 Waters 品牌质谱仪。
3)AP/MALDI HR 型号可达 30 μm 微米空间分辨,是 UHR 的姊妹型号。多数用于分子量测定。
4)LESA 液滴萃取表面分析,为静态微萃取纳喷成像技术,灵敏度远高于 DESI,也高于 flowprobe,为全自动化机器人成像装置。空间分辨率一般,为 0.4-0.6 mm。此设备对代谢组学、脂质组学、蛋白质组学、微生物组学、抗体分析尤其是热门的抗体药物偶联物(ADCs)、非共作用(Non-Covalent Interactions)、药物分布分析、次生代谢分析等等都有广泛成熟的应用。是 Nature 杂志 2017 年推荐的组学流技术(文献可索取),无需基质,后端可自由选择各类高分辨或定量质谱(QQQ、QTRAP、QTOF、Orbi、FTMS 等,选择 QTOF 类的好处,是分子量范围几乎无限)。
液滴萃取表面分析–质谱系统(LESA-MS)
5)flowprobe,一种实时的动态微萃取成像技术,是美国橡树岭国家实验室的 Gary Van Berkel、及加拿大的 Tom Covey 博士等发明了静态液滴萃取表面分析(LESA)之后的又一创新发明,适用于细胞、组织、聚合物等平面类样品的药物分布研究、癌症分析、微生物聚类分析等方面。可看做为 DESI 升级版,灵敏度比 DESI 高 10-100 倍。若只论成像,flowprobe 分辨率差一些,为 0.6 mm,即几百 μm微米;基本和 LESA 及 DART 处于成像分辨率的第三梯队。但灵敏度远好于 DESI。
6)DART 为有机分子(分子量 5000 amu 以下)和部分金属有机物最佳的轮廓分析技术,广谱无歧视(甚至非极性组分亦能离子化),只是多肽和蛋白质难以分析。未达到成像级别,可称为轮廓分析(Profiling,法检材料物证分析的用途最广),空间分辨率最高只能到 0.4 mm。优点是非常皮实、快和高通量,最值得质谱人拥有,作为提高质谱潜能的工具。成像轮廓分析只是其一个小细分应用,DART 其他方面应用非常广泛。
DART 轮廓分析
5、质谱成像常被提及的技术参数是什么?它们之间有什么关系?
质谱成像有两个常被提及的技术指标:空间分辨率和灵敏度。空间分辨率是成像像素的尺寸,分辨率越高,像素尺寸越小,成像质量越细腻;灵敏度与空间分辨率是负相关。
这两个指标,需要再次指出,如同鱼和熊掌,不可兼得。提高分辨率必然降低灵敏度,反之亦然。
6、质谱成像技术,应如何选择?
几种技术各有长处和特色,可按具体的需求选择:
空间分辨率 | AP/MALDI(5-30 微米)> DESI(20-50 微米)> LESA 或 flowprobe(0.4 毫米) | |||
灵敏度 | LESA > flowprobe > AP/MALDI > DESI | |||
操作难度 | DESI(最难)> flowprobe(稍容易)> AP/MALDI(简便)> LESA (最容易) | |||
适合样品 | LESA 或 flowprobe:2-5 厘米的较大的平面类样品(动植物切片、材料等) | |||
AP/MALDI 和 DESI:3-10 毫米的组织切片等 | ||||
检测对象 | LESA 或 flowprobe:有机小分子和生物大分子(包括多肽、蛋白质)均可; | |||
AP/MALDI:小分子如药物、代谢物、脂质等;大分子如多肽等;蛋白质较难。 | ||||
DESI:有机小分子和多肽。蛋白质很难。 |
flowprobe 动态微萃取
7、想要做质谱成像,需要哪些配套设备?
如果是 MALDI 或 AP/MALDI,还需要切片机、导电玻片和基质喷涂仪。切片机用来把组织样品做成 10-20 微米的切片;导电玻片不同于普通的载玻片,上面镀有一层氧化铟锡(Indium-Tin Oxide,ITO),具备导电性能,专用于 MALDI 成像;基质喷涂仪用来在切片表面均匀地喷覆基质,基质在切片上分布的均匀度、结晶的尺寸会影响成像的质量。
如果是 DESI、LESA 或 flowprobe,只需要切片机,这几种技术不需要基质,省却相关操作。
8、是否需要专门的成像软件?如何获得?
是的,需要专用的成像软件把采集的数据处理成图像。常规 MALDI 的成像软件一般由质谱厂家提供;AP/MALDI 和 LESA、flowprobe 目前使用的是开源的免费软件,如 BioMap、MSiReader 等。3D 成像软件较为新颖先进,可联系厂家购买正版或申请短期试用版。
9、能否重点详细比较一下 AP/MALDI 和 DESI ?
两者的原理不同:AP/MALDI 是通过基质化合物传递激光的能量,将目标分子离子化;DESI 是通过溶剂滚动萃取,后续通过类似于电喷雾的机制将目标分子离子化。
1)分辨率,AP/MALDI 可到 5 微米,优于 DESI 的 20-50 微米。
2)检测对象,AP/MALDI 既可以成像有机小分子,也可以成像多肽等生物大分子;DESI 更适合有机小分子,多肽已经较难。
3)两者都需要配套设备,除共同需要的切片机,AP/MALDI 还需要导电玻片和基质喷涂仪;DESI 无其他需求。
4)能联接的质谱,AP/MALDI 可与 Thermo、SCIEX、Agilent 和 Bruker 的常见轨道阱、离子阱、QTOF、QQQ 等联接;DESI 后续只能联接 Waters 品牌质谱仪。
DESI 解吸电喷雾电离
10、AP/MALDI 对切片的大小、厚度有什么要求?
AP/MALDI 对组织切片的厚度要求一般为10-20 微米,尺寸一般为 3-10 毫米。
切片太厚会影响成像效果;尺寸会影响数据采集的时间,切片越大需要的时间越久,长宽近 10 毫米的切片一般需要 2 小时左右。
11、现在 AP/MALDI 在国内有用户吗?
截止 2019 年,配置 AP/MALDI 和 Thermo 质谱质谱的用户有中科大、中科院有机所等几十家;
对 SCIEX 质谱,用户有中科院动物所等几家。
12、这些成像技术的应用范围包括哪些方面?
1)LESA:代谢组学、脂质组学、蛋白质组学、微生物组学、抗体药偶联物(ADCs)及非共价作用(Non-Covalent Interactions)分析、药物分布分析、次生代谢物分析等;兼容培养皿;
2)AP/MALDI:药物、代谢物、中性寡糖和低聚糖、脂质和多肽的分布分析等;
3)flowprobe:对细胞、组织、聚合物等平面类样品的药物分布、肿瘤、微生物聚类分析等;兼容培养皿;
4)DESI:小分子、次生代谢物、脂质分析等。
13、DART 可以做质谱成像吗?
DART 能处理法检物证等轮廓分析,其空间分辨率可达 0.5 毫米。鉴于 DART 机理独特,技术成熟,操作非常方便,对某些有机化合物(无论极性、弱极性、非极性)的轮廓分析需求,当属首选。DART 在成像方面的应用属于细分领域;DART 在法检物证上的其他众多应用已经普遍为业界所接受。
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