2019-12-03 13:07:50, 美谷分子仪器 美谷分子仪器(上海)有限公司
点击上方关注
通过以下方式联系Molecular Devices:
产品咨询热线:400-820-3586
售前服务邮箱:info.china@moldev.com
或直接在公众号内留言
Molecular Devices
源自美国
专业的生物分析仪器公司
上一期的视频中,
我们学习了如何进行 ELISA 实验数据处理,
不知道大家学会了吗?
来和我一起进入今天的新内容吧——
IC50 指“反应”被抑制一半时抑制剂的浓度,
在制药领域中是一个很重要的参数,
对药物的药效、安全性等的评价等具有重要意义。
但计算 IC50 时,
我们需要完成的抑制率-浓度曲线,
往往需要至少 4 个参数来定义,
而这个 4 参数拟合的过程,
常常成为一个繁琐且复杂的难点。
那么如何处理才更方便呢?
本期,让我们一起看看——
如何在 SoftMax Pro 软件上,
快速使用 4 参数拟合调用 IC50 值。
*流量预警:13.5 MB。
以实例手把手教你通过四参数拟合确定 IC50 值
进入我们的案例就是 IC50,也就是常见的半抑制率。这个是广泛用于毒理、安全性评价、药效的一个常见的处理方式。
IC50 这个词语常见伴随着四参数拟合,有 A 值,也有 D 值。那么四参数呢, 四个参数来定义这条曲线,就是我刚才所说的,A 上平台,D 下平台,C 值是对应着半有效剂量,EC50/IC50,B 就是它的斜率。公式就是这样的。那么在四参数的情况下,如果你的纵坐标,你的 y 轴是抑制率的时候呢,它 50% 对应的就是我们今天想知道的 IC50 这个浓度。
在整个案例中,我首先会给大家介绍如何进行对照组的调用,就是建立 100% 的 control。在这个基础上之后,我们进行抑制率的计算,然后在这个基础上之后我们可以去作图。作完图在这个图的基础上同样用 interpx 的公式去调用你感兴趣的 IC50。
好,我们来进入案例。
大家看到我这边是有一张 ELISA 板的,然后这个结果其实我把组给分配好了。我们点一下 Template Editor 来看一下这些组是怎么排布的。
首先,PlateBlank 组,药物处理组,这个是我们之前就设置过的。这个时候,我们来添加这个 Control 组,那么在这个组设置的时候呢,大家留意一定要选择 Custom 这边。点 OK。
那么第一步呢,因为 Control 组一般就是溶剂处理组,也就是细胞活力最高的没有任何抑制率的,那么我们把它定义为 100%,用来做个矫正。怎么去定义呢?双击 Control 组,其实非常简单,我们只要调用这两个孔的均值就行了,所以我们在 Formular 中输入 Average(values)。点 OK,定义值就完成了。
在这个值的基础上,我们去原来的药物处理组的表格。
我已经添加好了一列,叫 inhibiton%,我的公式已经输好了,我们来看一下这个公式是怎么完成的:就是你药物处理组的每个 OD 值,除以我前面提供的 100%,这个比值之后再用 1 去减,这就对应它的抑制率:药物效果越好,他的 OD 值越低,它的抑制率就会越高,最后再乘以 100% 就行了。
在这个的基础上,我们就可以做一个药物的剂量和抑制曲线图。
点一下 StandardCurve,在默认的这个图里面,他的横坐标是你的浓度,纵坐标是你的抑制效应,我这边已经全部拟合好了。
那么这个是怎么完成的呢?也是非常简单。我们点一下 Plot Editor。我们可以看到,这也是我们软件的一个特点,就是横坐标和纵坐标可以完全自己定义。这边的横坐标是浓度,那么纵坐标,我们就可以选择刚才建好的 inhibiton%。
如果你只需要简简单单的看你的浓度跟你的 OD 值之间的变化的话,就可以选择这个MeanValue,这就是你的药物浓度和 OD 值的变化。但是我们今天需要拿 IC50,所以选择 inhibiton%,这样一个曲线就做完了。
在这个曲线的基础上,我们就可以去拿 IC50 和 IC20 这种值了。
那么怎么去拿呢?我通过 Comparison Model 让大家看得更清楚一点。首先我定义我的抑制率需要多少,这里建一个 Summary 2,这个时候比如说我要定一个 IC50,这里输入 50,这就是了。
后面呢,一样的,非常简单,通过 Interpx,然后调用这条标曲,并且调用 Summary 2 去换算对应的浓度。那么 20.825 就是这张图的IC50 值。点 OK。
那么有的时候你们需要其他的抑制率,比如说我要换 IC80、IC90,都是非常灵活的,软件可以完全自动判断的。包括 IC20,都是可以的。
这就是今天的案例,IC50,半抑制率的调用。
以上就是使用 SoftMax Pro 7 版本酶标仪软件使用 4 参数拟合调用 IC50 值的全部内容,更复杂或特殊的情况在此未进行讨论,欢迎大家留言咨询~
❤我觉得我值得收藏❤
05-09 赛默飞生命科学
5月展会预告,相约两城共研药品质量问题05-08 市场宣传部
重磅:生态环境部《土壤和沉积物 甲基汞和乙基汞的测定》(HJ 1269—2022) 标准发布及详细解读05-08 仪真分析
精准开班 深度服务丨仪真分析烷基汞高级培训班圆满举办05-08 仪真分析
2024长沙智能制造装备博览会,珂睿科技邀您5月来相会05-08 珂睿marketing
【网络研讨会】制药行业技术分享会(线上)05-08
培训课程 | 马尔文帕纳科2024年实验室培训课程,下半年报名通道开启05-08
【活动信息】马尔文帕纳科即将亮相创新药物递送技术高峰论坛05-08
【活动预告】锂电行业粒度培训班 · 长沙站05-08
新品解析三部曲(一)Mastersizer 3000+ 帮助您对真实样品做出独立判断05-08
人见人爱的蛋白Marker买大送小啦!05-08 赛默飞生命科学
大电池绝热量热仪BTC-500在GB/T 36276-2023及GB/T 36276-2018中的应用案例05-08 William Yao
高频激振器是如何产生50kHz频率?05-08 圈内人都会关注
喜报丨苏州佳谱科技再凭实力荣获陕西省环境保护科学技术奖二等奖!05-08
节庆喧嚣渐远,在皖仪“劳动与奉献”赞歌正亮!05-07 WAYEAL皖仪
固有溶出测试来了,您准备好了吗?05-07 仪器事业部
这不是玄学,来试试不挑质谱的高深度血浆蛋白质组学!05-07 莲莲看
支持大规模设备更新,电转仪“以旧换新”方案来了05-07 赛默飞生命科学
一文读懂|全球首款自复制RNA(saRNA)疫苗ARCT-154背后的专利05-07 耀海生物
热烈庆祝普立泰科和中科院化学所联合举办的“2024 Agilent PL-GPC用户交流及培训会”圆满落幕05-07 普立泰科