蛋白检测的陷阱：您的目标多肽可能已被“吃掉”

2026-07-14 11:58:26, 艾本德 Eppendorf China 艾本德中国

蛋白组学在药物研发和代谢组学研究中的作用愈发凸显。

？

但一个普遍存在又常被忽视的问题是：

制备完成的目标多肽 / 目标蛋白，很可能在上机前，一部分就已经悄悄“留在”了耗材容器壁上。

▲ 微量样品信号偏低

▲ 同批样品不同批次结果“漂移”

▲ 差异蛋白难以复现

…… 

这些困扰实验的问题，根源就在于耗材表面的非特异吸附正在默默“吃掉”您的样品。


一、文献实锤：

普通 PP 和玻璃真的吃样

2024 年，汉堡大学医学中心与 Eppendorf 在 Chemistry – A European Journal 发表 “APS（Assay for Characterizing Adsorption – Properties of Surfaces）” 研究文献。

文献中提到：

用含 3531 条肽的 HeLa 胰酶消化物，在不同小瓶中孵育 24 h，再做 LC – MS/MS 定量。

对比材料如下：

▲ 普通聚丙烯（PP）

▲ 低蛋白吸附 PP（LoBind 类）

▲ 普通硼硅玻璃、低吸附玻璃

结果非常直接：

▲ 普通 PP 显著吸附大量长链、疏水肽

▲ 玻璃更严重，>18% 肽在 24 h 后明显下降

▲ 低蛋白吸附 PP 小瓶几乎没有显著吸附肽


上图显示，普通 PP 吸附明显，LoBind PP 接近零


多肽或蛋白样本的被吸附，直接导致后续结果的误差。对此，小 E 的解决办法是：LoBind 系列离心管和 LoBind 系列深孔板。小体积样品可以用 LoBind 离心管；在高通量培养、筛选、储存阶段，蛋白样品可放在 LoBind 深孔板里。

二、除了防止蛋白被“吃掉”

还需要防止被污染干扰

BioBased 生物基深孔板就是为这一点准备的，它具有：

经认证的纯净度：不含蛋白及蛋白酶，降低额外蛋白污染和随机降解

单孔 500 μL / 1 mL / 2 mL，覆盖表达、裂解、纯化、储存等不同阶段。

对做蛋白组学、高通量表达或蛋白互作的实验室，这意味着：在板的阶段尽量不引入“板子自己的蛋白和蛋白酶”，让您看到的变化真正来自样品。

三、蛋白和多肽的

“防吸附&防污染”耗材小技巧

上游表达/筛选

用小 E 的 BioBased 深孔板或者 LoBind  蛋白低吸附深孔板做表达、裂解和初筛，减少板材带来的背景蛋白与蛋白酶。

中游关键样品处理：

转入 LoBind 蛋白低吸附离心管，进行纯化、浓缩和酶解，降低肽和蛋白在管壁上的损失。

下游质谱与保存：

LC – MS 前使用 LoBind 蛋白低吸附耗材，长期样品库保存可用深孔板，避免容器材质造成系统偏差。

小 E 的提醒


普通 PP 和玻璃并不“中立”，会吃掉您的肽和蛋白信号，而低吸附 PP 能显著缓解这一问题。再配合通过“无蛋白和蛋白酶”认证的深孔板，就能为蛋白和多肽搭建起一整套“低吸附、低污染”的耗材体系——让每一条目标多肽、每一个目标蛋白，都更有机会出现在你的数据中，而不是停留在管壁和板壁上。


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