沃特世 LCMS 实战｜AnalyzerPro 让药物开发快一步，样品提交到杂质确认全流程

在药物工艺开发里真正拖慢节奏的，很多时候不是反应本身，而是反应之后的数据确认。

样品已经提交，结果还没出来；

精确质量已经拿到，杂质还没确认；

异常峰已经出现，但还停留在“未知”状态。

数据能不能尽快转成可用判断。

本篇应用文章展示了一条从样品提交、精确质量采集，到 AnalyzerPro  进一步筛查和确认的完整路径，目标明确：让合成和工艺化学人员更容易调用靶向与非靶向筛查流程，用更短的路径获得可读、可讨论的结果。

药物开发从实验室合成路线走向中试和生产，核心任务之一就是优化反应条件：既要提高目标产物收率，也要尽量减少副产物生成，因为副产物不仅会拉低收率，还可能带来安全和分离上的额外负担。

但真正落到分析端，常见断点仍然存在：

• 高分辨质谱价值很高，但门槛也高：精确质量能提升化合物确认的置信度，但很多研发环境长期对 HRMS 的复杂度和数据解释存在顾虑。 

• 样品提交与结果回收不够顺：工艺开发往往不是一个样品，而是一批条件对比样品，提交效率和结果回流速度都会影响判断节奏。 

• 靶向与非靶向要同时兼顾：既要确认 API，又不能漏掉反应体系里新冒出来的峰。 

• 未知峰发现之后，仍然需要进一步筛查和缩小范围：发现峰只是起点，后面还要看分子式、库检索结果，以及是否能与已知降解物对上。

分工清晰：

MS 负责把精确质量数据带到更日常的研发环境中；

RemoteAnalyzer 负责把样品提交做得更简单、更标准化；

AnalyzerPro 则负责采集后的进一步处理、目标筛查和未知峰的线索收敛。

• RemoteAnalyzer 支持单样、批量、CSV 和 96 孔板等提交方式； 

• 可同时进行靶向与非靶向流程； 

• 结果可通过邮件发送，也可导出到 ELN； 

• 数据随后可转入 AnalyzerPro ，结合已知降解物 mol 文件和 PubChem 做进一步筛查。 

这篇应用文章选择了格列吡嗪作为模型化合物，在酸性、碱性和氧化三种条件下进行降解处理，模拟工艺优化过程中可能出现的不同杂质情形。

在 RemoteAnalyzer 中，作者采用了：

• 一个非靶向 Peak Detection 工作流，用于检测超过阈值的高强度峰并返回精确质量； 

• 同时加入一个靶向维度，即提取格列吡嗪母体化合物的 EIC，目标 m/z 为 446.18565，作为质量确认实验。 

数据采集完成后，再把结果转入 AnalyzerPro，结合已知格列吡嗪降解物 mol 文件以及在线库检索做进一步筛查。

Step 1｜样品提交

在 waters_connect 平台上，以 RemoteAnalyzer 作为用户接口，可以按单个样品、批次、CSV 或 96 孔板方式提交。本实验实际采用的是手动 vial 提交。

Step 2｜自动结果输出

以酸降解样为例，每个样品完成后，系统会生成并发送 PDF，内容包括：

• 峰检测色谱图 

• 格列吡嗪 EIC 

• 每个检测峰对应的质谱图 

Step 3｜AnalyzerPro 离线处理

采集到的数据可从 RemoteAnalyzer 下载，并被打包成 AnalyzerPro sequence，用于离线处理。随后在 AnalyzerPro 中设定处理方法，包括阈值、加合物、ppm 质量误差等参数。为了帮助识别未知峰，作者还把6 个已知格列吡嗪降解物以及 API 一并纳入筛查方法。

Step 4｜数据审阅与目标确认

附件展示了 AnalyzerPro 的联动审阅界面：样品列表、目标设置、颜色标记的目标确认摘要、响应值、保留时间、TIC 对齐、XIC 和对应谱图都可以在一个页面中联动查看。颜色逻辑也很直接：

红色表示未找到，绿色表示找到且在误差范围内，紫色表示找到但超出误差范围。

Figure 1. AnalyzerPro XD 软件中的数据审阅界面，展示经处理的格列吡嗪降解产物数据。

附件给出的峰检测结果很清楚：

• 酸降解样品检测到 3 个峰，包含 API 

• 氧化降解样品检测到 3 个峰，包含 API 

• 碱降解样品检测到 8 个峰 

进一步处理后，AnalyzerPro 确认了：

• 酸降解和氧化降解样品中存在 impurity II 和 impurity III 

• 碱降解样品中存在 impurity V