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一、 芯片聚类分析 二、microRNA靶基因预测 “TargetScanS”, “miRanda (miRBase)”,“miRGen”等数据库预测差异microRNA的所有靶基因。 三、 靶基因GO分析 根据Gene Ontology数据库对靶基因进行功能显著分析,从而筛选显著性功能的靶基因。 四、 靶基因pathway分析 根据KEGG数据库对靶基因进行Pathway分类,并进行显著性分析从而得到显著性的Pathway分类 五、 构建的MicroRNA与基因的调控网络 通过构建MicroRNA与基因的调控网络,可以从中找出hub基因及hub microRNA. 六、 microRNA 、靶基因、转录因子调控网络 microRNA也会受到转录因子调控造成表达差异,通过系统研究转录因子与基因间的调控关系,可以为寻找重要转录因子及重要基因提供线索。
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