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仪器种类 | 捕集离子淌度质谱 |
timsTOF Pro 2配备的捕集离子淌度质谱(TIMS)增加额外一维度的气相分离,可显著降低样品复杂度。基于双TIMS技术的平行累积连续碎裂技术( PASEF®)技术可达到>120Hz的扫描速度而不会损失灵敏度和分辨率,实现对低丰度肽段离子多次重复选择并碎裂,以提高低丰度肽段的二级谱图质量,使分析复杂蛋白样本成为可能。
由平行累积连续碎裂技术( PASEF® )驱动,使得 4D-蛋白质组学和 4D-脂质组学为无偏向性细胞和血浆蛋白质组学、液体活检多组生物标志物发现,以及整合基因组学、蛋白质组学和表观蛋白质组学拓宽了道路。
4D-组学时代 —— 解锁第四维度的价值
4D-组学的重大突破
速度:PASEF 技术实现了在不影响分辨率情况下达到超过 120 Hz 扫描速度。
深度:额外一维离子淌度提高了数据完整性。
高通量:超快数据采集速度使其可以使用短梯度实现生物样本的高通量分析。
耐用性:独特的仪器设计使得其可以连续分析数千个样品,仪器保持稳定的性能而无需清洁。
4D-Proteomics™ 的新标准:更快速度实现蛋白质组全覆盖
基于质谱( MS )的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。然而,受到目前质谱仪的扫描速度、灵敏度和分辨率的影响,实现蛋白质组的全覆盖仍然具有挑战性。timsTOF Pro 2 使用平行累积连续碎列( PASEF® )的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度,只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。
双 TIMS 和 CCS 的分析
捕集离子淌度谱( TIMS )首先是一项重要的气相分离技术,它是在高效液相色谱( HPLC )和质谱分离的基础上,带来额外一个维度的分离,可大大降低样品分析复杂度,极大提高峰容量和分析物鉴定可靠性。
同样重要的是,TIMS 离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦,从而独特地提高灵敏度和扫描速度。
双 TIMS 技术可以实现近乎 100% 的离子利用率,离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放。这种平行累积连续碎裂( PASEF® )的过程能够实现碰撞横截面( CCS )的分析。
CCS 额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性,可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率( FDRs )。
优化的硬件性能
timsTOF Pro 2 质谱仪整合了新一代 TIMS 分析仪和一个完全重制的不锈钢堆叠环形离子向导( SRIG )。新的设计能够提供三倍高的离子容量。一种新的离子冷却多极杆和改进的离子注入四极杆设计,以及进一步简化的离子光学大大提高了离子从TIMS 模块到 TOF 飞行管的传输效率,进一步最大限度地提高 MS 和 PASEF MS/MS 中的离子传输和灵敏度。TIMS 模块独特设计意味离子在前一根淌度管内累积,在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放,可以实现近乎100%的离子利用率,几乎不造成离子的损失。
PASEF®
重新设计的 MS/MS 技术,以满足蛋白组学的速度要求。肽段离子通过捕集离子淌度谱( TIMS ) 分离,洗脱( ~ 100 ms ),并在四极杆飞行时间质谱( QTOF )上进行检测,生成 TIMS MS 热图。在 PASEF® 方法中,相同的 TIMS 分离后的离子又通过四极杆对特定离子进行逐一隔离。母离子和碎片离子谱图按离子淌度值进行对齐。平行积累连续碎裂( PASEF® )技术实现了 > 120 Hz 的扫描速度, 使用 PASEF® 可以实现多次选择低丰度肽段离子来提高低丰度肽的二级谱图质量。
PASEF® :鸟枪法蛋白质组学的完美选择
由 PASEF® 驱动的 timsTOF Pro 2 可以实现超过 120 Hz 的扫描速度,而不会损失灵敏度和分辨率。这是通过离子在淌度管内的的累积、分离和四极杆隔离能同步进行来实现的。
极高的稳定性和通量
无需清洗
许多用于蛋白质组学应用的 MS 仪器需要每月清洁一次,在大样本组中每天 24 小时运行。仪器性能下降即使在较短的时间段内也是显而易见的。timsTOF Pro 2 卓越稳定性意味着仪器可以全天运行很多周,而没有明显的信号和其它性能下降。
“ 自 2019 年 2 月我们开始使用 timsTOF Pro 的 26 个月以来,我们已运行了 25,000 多个 LC/MS 样本,其中约 5,000 个样本是不去高丰度的血浆样本。到目前为止,我们的停机时间几乎为零。”
PaSER Run & Done —— 加快4D-蛋白质组学的鉴定速度
PaSER( 实时平行搜索引擎 )是一个结合硬件和软件的解决方案,能够实现基于样本序列管理的实时数据库搜索引擎。
PaSER 以很快的速度就能提供结果,包括 PTM 搜索。通过使用基于 GPU 的搜索,PaSER 在实时或离线模式下可以提供相同的结果,而无需使用简化的算法或中间步骤。PaSER 极快的搜索速度使得在数据采集结束后数秒就能同步拿到搜库结果,真正实现运行并完成! PaSER 有效地打破了大队列样本数据分析通量壁垒。
此外,实时蛋白组学的非标记定量也可以跨越 PaSER 获得的数据结果集,使其瞬间能过渡到定量蛋白质组学。通过 TIMS Viz 使得淌度偏移质量对齐( MOMA )变得可视化 ,从而用户可以鉴定和识别只有 4D-Omics 才能看到的共洗脱多肽。
dia-PASEF 增加鉴定可信度
dia-PASEF比传统的 DIA 方法有更高灵敏度和选择性,是因为它将 PASEF 原理也应用进来,结合了 DIA 的优点和 PASEF 离子利用率高的优势。
TIMS 分离提高了选择性,而且可以将单电荷母离子排除掉,从而降低本底噪音干扰。
利用分子量和碰撞横截面 CCS 值的相关性,dia-PASEF 能够实现高可信度化合物鉴定。在 LC-MS/MS分析中, dia-PASEF 能够采集包含 m/z,离子淌度值( CCS ),保留时间和离子强度的 4D 数据。
前所未有的蛋白质覆盖深度
凭借强大的 SRIG( 不锈钢堆叠环形离子向导 )装置和新优化的 dda-PASEF 方法 ,timsTOF Pro 2 单针能够达到前所未有的蛋白组学覆盖深度。使用自制 HEK 酶切样本, 上样 200 ng,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 60 分钟梯度下能够鉴定 超过 7,000个 蛋白和 60,000 条多肽。
因此 timsTOF Pro 2 可以通过数据库搜索和运行之间的匹配,无需任何谱图库,在一些日常细胞系蛋白组定量实验中实现很高的蛋白覆盖深度。
和常规的靶向蛋白组学分析技术( SRM 和 PRM )相比,prm-PASEF 在单针中可极大提高监测多肽数目,同时不影响仪器选择性或灵敏度。
靶向质谱( MS )技术是蛋白质组学实验中一种强大的技术,用来验证大队列样本中的候选生物标志物。与数据依赖采集( DDA )和数据非依赖采集( DIA )相比,这可以增加检测灵敏度。可是该技术受到在单针中监测离子数目和液相分离出峰时长以及整体灵敏度间的折中限制。只有通过更长的色谱分离时长或降低质谱的灵敏度和选择性,才能获得大量目标肽的完整数据。
prm-PASEF 可以极大地提高单针中靶向监测的多肽数目,这得益于布鲁克 timsTOF Pro 2 的第四维分离可以极大提高选择性和灵敏度, PASEF 技术带来的速度可以增加靶向分析离子数量。
随着某些特定细胞、少量细胞群或生物穿刺样本的生物研究越来越重要,低样本量蛋白组定量变得至关重要。而如此低的样本量对于质谱灵敏度提出了很高要求。使用高灵敏度的质谱仪对如此低的样本量进行原型定量至关重要。timsTOF Pro 2 上样 200 ng HeLa 样本,使用 Aurora - 25cm 色谱柱,在 30 分钟梯度下使用 PaSER 能够鉴定超过 74,200 个蛋白和接近 30,000 条多肽。
dia-PASEF —— 高通量定量蛋白质组学中实现无与伦比的数据完整性和分析深度
使用标准 dia-PASEF 方法多针测试结果有着很高重复性。三种不同的 dia-PASEF 窗口设置下使用 Aurora-25cm 柱在 60 分钟梯度下可实现接近 8,000 个蛋白定量和超过 70,000 条多肽,而且有极高的定量准确性。
高灵敏度磷酸化蛋白组学分析和同分异构体分离
支持 CCS 的近邻位磷酸化位点定量
dia-PASEF 在 timsTOF Pro 2 上的高灵敏度、扫描速度和重现性甚至可以实现低样本量的磷酸化蛋白质组学分析。例如可以实现小鼠脑样本起始总蛋白仅为 25 μg 的磷酸化蛋白质组的非标记定量。使用 Evosep 每天 30 个样本的分析方法,三次重复可鉴定出多达 4,473 个 unique 磷酸化多肽。这些结果为针刺活检的应用带来了希望,可以用信号转导的信息补充癌症蛋白质基因组学数据。这些结果为针刺活检的应用带来了希望。此研究结果由 Stefan Tenzer 教授提供。
分析样本量有限时的细胞信号传导
当肽段在色谱上发生共洗脱时,由于等重性和信号重合,不能测量 CCS 值的传统蛋白质组学是不能实现磷酸化肽异构体的定量的。PASEF 技术使得基于 TiO2 富集时,使用 150 ug 蛋白富集起始量就能够鉴定 27,768 个磷酸化肽,展现了淌度偏离质量对齐( MOMA )的优点。1,946 条鉴定的共洗脱异构体中,20% 的异构体可以被TIMS 完全分离,这可以使得我们可以更好地理解邻位蛋白磷酸化位点信息。
" 除了高灵敏度之外,timsTOF Pro 质谱仪的另一独特之处在于其基于气相的位置异构磷酸化多肽分离能力,从而为理解信号传导通路提供更详细的信息。"
布鲁克timsTOF Pro 2 捕集离子淌度质谱 双 TIMS 和 CCS 的分析,timsTOF Pro 2
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2020-2023年中国质谱学术大会日程将于2023年6月9-13日在杭州召开,布鲁克将携ASMS 2023最新发布的前沿质谱技术和产品盛装参与本次会议,欢迎大家前往布鲁克展台(A11-13)和布鲁克午餐会(6月10日)交流指导!布鲁克午餐会 ——单细胞蛋白质组学和空间多组学6月10日 12:00-13:30杭州太虚湖假日酒店 紫光厅B会议日程12:00-12:15-12:20 签到发餐+欢迎致辞12:20-12:40《全新
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蛋白质组学技术已经成为推动精准医学加速临床转化的主要支撑技术。通过蛋白质组学技术能够探索疾病机制获得疾病诊疗标志物,发现治疗药物靶点。围绕临床应用,面对临床队列设计复杂、样本异质性、血液高丰度、样本微量等挑战,布鲁克与青莲百奥共同组织了此次“高深度蛋白质组学新技术研讨会”,与临床疾病专家共同讨论血液蛋白质组学和空间蛋白质组学等热点方向的前沿进展,推动多学科融合,助力技术创新临床应用。此次会议将于2023年05月23日15:00-17:00在北京召开,届时临
注册参会:https://live.vhall.com/v3/lives/watch/794235164 注册链接: https://live.vhall.com/v3/lives/watch/794235164
Get ready for an exciting week of science and innovation at ASMS 2023 in Houston! Bruker is thrilled to be a part of the action from June 4-8, 2023. We're bringing our A-game and we can't wait to show you what we've go
布鲁克最新发布#摘要#应用在免疫肽组学的PaSER™ Novor,具有更快速、实时从头测序的特点使用PaSER 2023b蛋白质组学软件实现无需构建谱图库的dia-PASEF数据分析(Library-free dia-PASEF®)与Mass Dynamics合作, 实现4D-Proteomics™知识可视化2023年3月6日美国伊利诺斯州芝加哥 —— 布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)在美国HUPO会议上宣布为基于timsTOF平台的4D-蛋白质组
3月15日17:00-18:00单细胞蛋白质组学可以帮助我们深入了解细胞水平的分子过程。timsTOF SCP质谱使我们比以往任何时候都更容易获得这些信息,而且其避免了对昂贵和有偏向性的标记技术的需求。 赶快加入本次的在线讲座,内容包括:演示单细胞蛋白质组学完整分析流程:样品转移、分离、采集以及数据实时分析;如何解决样品制备、稀释和处理过程中相关难题;涵盖分析过程中可能遇到的灵敏度和稳定性问题。注册会议:https://www.bruker.co
2023年2月22日中国苏州 —— 布鲁克公司于2月22日至23日出席了在苏州举办的AntibodyChina 2023第六届求实抗体药物深度聚焦峰会。继2022年多款国产ADC药物相继出海,抗体药物继续高速发展。双抗药物与ADC药物持续火热,三抗/四抗等多抗药物开启新型抗体的新篇章,“新型免疫检查点”点燃行业靶点新风向,工艺生产技术持续优化加速产业化进程。本届论坛由求实药社主办,携手130+讲者与1200+行业同仁,深度探讨抗体药物开发中难点,
工作地点北京岗位职责1.负责蛋白质组学相关研究解决方案的开发;2.在客户现场独立进行QTOF相关仪器的演示实验、应用培训课程;3.通过对样本集的分析,展示QTOF的能力,并向潜在客户报告结果;4.与全球市场部及国外工厂保持密切沟通,制定符合全球战略的中国市场和策略:翻译和编纂市场资料;策划和组织市场推广活动;组织并实施对销售团队的内部培训。岗位要求1.化学、生物化学或相关领域的硕士或博士学位;2.有蛋白质组学或代谢组学的样品制备
大 有 可 “微”近年来,蛋白质组学在质谱技术的驱动下得以快速发展。蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。越来越多科研工作者也是聚焦于组学研究向临床应用转化的工作,使其能够更好服务于精准医学。临床样品来源非常广泛,包括体液样本、生物穿刺、临床切片、石蜡包埋(FFPE)以及激光显微切割(LCM)的组织样品等。这些生物样本是病理分子生物学和蛋白质组学研
新闻摘要● 采用第 4 代 TIMS XR cell,具有更宽的动态范围,进样 1 微克蛋白,可以在 60 分钟内鉴定超过 10 万条肽段(1% FDR);● 增加的动态范围与 14 位 Digitizer 可提供出色的定量蛋白质组学结果(CVs值<5%);● 共同销售 CellenONE PICO 液体分配系统,推进单细胞蛋白质组学 (SCP) 应用;● 全新 PaSER™实现实时数据流和智能数据采集控制;● timsTOF Pro 2 带动 4D
新闻摘要● 靶蛋白快速、大视野的 MALDI HiPLEX-IHC 成像,并把新鲜冷冻或 FFPE 组织切片小分子 MALDI 成像数据叠加,为空间生物学和癌症研究提供了具有说服力的创新性证据;● 基于 MALDI 定位的 timsTOF fleX 平台,全新 microGRID 技术可在低至 5 µm 像素间隔的整个切片中提供几乎无伪影的图像;● SCiLS™ Lab 2023a 软件展现了 4D 特征搜寻功能的高级成像分析,可实现支持 CC
高通量蛋白质组学成为了生物医学基础研究和应用开发的重要前沿和突破口,而如何实现对大队列样本稳定可靠地分析也逐渐成为了科研热点和难点。总的来说,实现高通量蛋白质组学面临如下挑战:蛋白质组学样本自身的复杂性(蛋白丰度的动态范围>106)使得低丰度蛋白鉴定异常困难;目前质谱仪采集速度和灵敏度的局限性,使得短梯度下难以实现蛋白深度覆盖;大队列样本分析对高通量方法和仪器稳定性提出了很高的要求。近日迈维代谢继斥资千万引进timsTOF fleX质谱仪
截至目前,人类蛋白质组计划收录的质谱数据可覆盖人类约90%的蛋白,同比可映射至其他物种的蛋白。尽管如此,复杂体系单针蛋白组学鉴定深度依旧受限于液相分离能力、质谱扫描速度和灵敏度等因素。近些年,基于离子大小和结构在气相中进行分离的技术成为质谱领域的关注焦点。该技术不仅在高效性和便捷性上点燃了大众对离子淌度的兴趣,更因其能结合传统液相 (LC) 和质谱 (MS) 的技术优势而备受瞩目。为了能将基于新型捕集离子淌度的4D-蛋白质组学技术讲清楚,我们将通过一系列的
蛋白质组研究是后基因组时代最前沿和热点的研究领域之一。近年来,基于质谱技术的蛋白质组学研究取得了令人瞩目的成果。蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。 为促进蛋白质组学的研究和学科发展,帮助从事相关研究的用户学习和了解蛋白质组学研究技术及方法,中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)、 国家蛋白质科学中心(北京)、北京蛋白质组
基于创新性离子淌度的4D代谢组学,不仅能够显著推动已知的甚至是未知代谢物的准确鉴定。更重要的是,区别于从基因组到代谢组的纵向多组学 (Longitudinal Multi-omics),结合4D蛋白组+4D修饰组+4D代谢组的4D功能多组学 (4D Functional Multi-omics) 的研究新范式,聚焦“代谢调控”的三大核心因素:蛋白+修饰+代谢物,更精准、更系统、更深入地解析生物分子功能与代谢调控机制。作为全球4D-蛋白质组学技术的引领者布鲁
新冠疫情的大肆猖獗,目前已导致全球超过2.6亿人被感染。随着新冠病毒变异体的不断出现,人类还将继续与病毒战斗。如何更为高效的找到治疗新冠的药物,也就成为了当务之急。中药自新冠疫情以来,发挥了重要的作用,已有多个中药复方被证实有效并用于新冠的临床治疗中。因此,从中药成分的丰富宝库中,有望筛选出治疗新冠的活性成分并开发成药物。但是,传统植物化学-药理学评价的方法,要经过提取、分离、纯化、鉴定、活性筛选等步骤,不但耗时耗力,而且目标性差。因此需要一种更为高效,且
基于单细胞层面的研究为生物系统中细胞间的同质性和异质性提供了更精准的信息,随着蛋白质组学技术的快速发展,检测技术和灵敏度的提升,使实现单个体细胞的蛋白质组学分析成为可能。为推动单细胞蛋白质组学的发展,拓展单细胞研究的视野,布鲁克和景杰生物将于2021CNHUPO会议期间联合举办“单细胞蛋白质组学专题午餐会”,线上线下同步进行,诚邀您与会。会议时间: 2021年10月14日12:30-13:35会议地点: 武汉 东湖宾馆 1楼 晴川厅网络直播:
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