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对抗新冠,非变性质谱高效筛选中药活性成分新策略

发布时间: 2022-01-04 17:41 来源:布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器

新冠疫情的大肆猖獗,目前已导致全球超过2.6亿人被感染。随着新冠病毒变异体的不断出现,人类还将继续与病毒战斗。如何更为高效的找到治疗新冠的药物,也就成为了当务之急。


中药自新冠疫情以来,发挥了重要的作用,已有多个中药复方被证实有效并用于新冠的临床治疗中。因此,从中药成分的丰富宝库中,有望筛选出治疗新冠的活性成分并开发成药物。但是,传统植物化学-药理学评价的方法,要经过提取、分离、纯化、鉴定、活性筛选等步骤,不但耗时耗力,而且目标性差。因此需要一种更为高效,且选择性更高的中药活性成分筛选方法。

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非变性质谱法,与非直接生物亲和法相比,避免了蛋白-配体复合物繁琐的分离步骤,并且能够获得化学计量信息。但是,蛋白-配体非共价结合作用力通常较弱,在质谱分析时要求分子间作用力不能被破坏。并且,蛋白-配体复合物通常分子量较大,所带电荷多,因此要求质谱在高m/z区域仍然能达到超高分辨率,以看清复合物复杂的m/z分布信息。


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图:基于磁共振质谱的非变性质谱高效筛选中药活性成分流程


布鲁克scimaX磁共振质谱,具有超过2千万的超高质谱分辨率,并且专利ParaCell检测器及磁控管控制技术,对高m/z,高电荷态离子具有优异捕集能力,可以轻松应对非变性质谱分析的难题。


作者将金银花、黄芩、连翘、甘草、大蓟、穿心莲等6种中药的提取物,分别分成不同流份,并与3CLpro共孵育形成蛋白质-配体复合物,然后利用磁共振质谱进行非变性质谱分析。如下图,能与3CLpro结合的天然产物成分,通过蛋白质以及蛋白质-配体复合物的Δm/z即可算出。



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图:利用非变性质谱法从黄芩中亲和筛选与3CLpro结合的天然产物


作者利用该方法,一共筛选出16种潜在活性成分(如下图)。其中如黄芩素,已被证实是3CLpro的非共价抑制剂,说明该方法可成功从复杂体系中筛选出有效的潜在活性成分。


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图:利用非变性质谱法筛选出的潜在活性天然产物


与等温滴定量热法(ITC)及表面等离子体共振光谱法(SPR)相比,非变性质谱法可提供化学计量信息,从而可以区分蛋白质与配体是否是特异性结合,在药物发现早期选择最有潜力的活性成分,缩短药物研发周期,并降低药物研发成本。


如下图所示,在同等浓度下,化合物2与3CLpro形成的蛋白质-配体复合物比化合物9-1少,而之前研究表明3CLpro只有一个底物结合位点(活性位点),说明化合物2可能是特异性结合,而化合物9-1可能是非特异性结合。

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图:非变性质谱法区分蛋白质与配体结合特异性。(A)apo-3CLpro滴定分析时的质谱图,3CLpro主要以P19+和P18+形式存在;(B)3CLpro与化合物2共孵育后的质谱图,蛋白质-配体复合物以P+L形式存在;(C)3CLpro与化合物9-1共孵育后的质谱图,非特异性结合。


综上,基于磁共振质谱的非变性质谱亲和选择法,能够从如中药等复杂体系中,高效筛选出活性成分,并且利用方法提供的化学计量信息,区分蛋白质与配体是否是特异性结合,从而有助于缩短整个药物发现研发周期,并节省物力人力。

标签:新冠 布鲁克 质谱 中药 活性成分
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