产品简介
蛋白质全谱分析也可称为质谱shot-gun分析(鸟枪法),指的是蛋白质质谱检测,研究对象是完整的组织、血液、体液或其提取物,其目的在于鉴定出尽可能多的肽段和蛋白质。蛋白全谱分析的优势就是可以全面鉴定整个细胞、组织或复杂混合样品的大量蛋白质。基于质谱技术的蛋白全谱分析,可为高通量的蛋白质谱定量和修饰分析提供重要参考信息。
技术原理:
将溶液内蛋白质分子或SDS-PAGE条带的复杂混合物酶解成肽段混合物,通过液相色谱分离,如2D-LC(阳离子柱SCX和C18反相柱串联)或1D-LC的C18反相柱,进行蛋白质谱测试,最后用相应的数据库进行检索匹配,可同时鉴定成百上千种蛋白质。
技术路线:
内容分析
产品优势:
• 高效率样品分离:根据样品性质,可以选择SDS-PAGE或者SCX-HPLC两种分离方法。
• 高鉴定率:系统全面地研究组织或细胞中尽可能多的蛋白质,可鉴定多达6000种蛋白。
• 适用范围广:无物种特异性限制,理论上可用于所有物种。
• 仪器性能优良:基于高分辨率(大于105)、高质量精度(小于1ppm)质谱平台,可获得更加准确的结果。
技术平台:
Q Exactive, Thermo、TripleTOF 5600,AB SCIEX、LTQ Orbitrap velos, Thermo
应用领域:
全蛋白质表达谱分析
蛋白质质谱检测
血浆蛋白质组表达分析
植物蛋白质组表达分析
微生物蛋白质组表达分析
亚细胞器蛋白质组表达分析
互作蛋白质种类鉴定
样品要求:
1.样品类型:总蛋白;
2.样品总量:>500mg(新鲜组织样); >300ug-500ug(提取蛋白量)。
3.样品重复:三个生物重复或技术重复
案例分析
1、综合蛋白质组学和代谢组学揭示碱蓬对盐和碱胁迫的总反应机制
本研究通过碱蓬幼苗暴露于盐胁迫和碱胁迫72 h,整合蛋白质组学和代谢组学进行不同胁迫条件下的反应机制研究及代谢通路差异分析 。
碱蓬蛋白质样品在对照,盐和碱胁迫下的代表性2-DE凝胶图
参考文献:
1. Pang Q, Zhang A, Zang W, et al. Integrated proteomics and metabolomics for dissecting the mechanism of global responses to salt and alkali stress in Suaeda corniculata[J]. Plant and Soil, 2016, 402(1-2): 379-394.
蛋白全谱分析,蛋白全谱分析
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