iTRAQ(isobaric tag for relative and absolute quantitation)定量蛋白质组是基于对肽段的NH2-进行标记,将来自不同样品的同一个肽段做上不同的标记,通过标记物质的含量来指示肽段的含量,并根据肽段含量推断出对应蛋白质的含量。该方法因其标记效率高、灵敏度高、定量准确以及一次可以标记至多8个样品等特点,是目前非常流行的定量蛋白质组方法,可以快速发现不同处理、不同突变体、不同环境条件影响的蛋白质组的差异,并且锁定差异蛋白质进行功能研究。
SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)是瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold 博士及其团队与AB-SCIEX联合推出的一项全新的质谱技术。与传统的shot-gun技术相比,SWATH采集模式能够将扫描区间内所有的肽段母离子经过超高速扫描并进行二级碎裂,从而获得完整的肽段信息。因此,SWATH技术是一种真正全景式的、高通量的质谱技术,同时也解决了shot-gun鉴定较低重复度的缺点。作为国内较早SWATH技术服务的公司,金开瑞现可提供SWATH定量蛋白质复合体、SWATH定量蛋白质组的技术服务。
SILAC定量蛋白质组分析
SILAC ( Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture)技术是利用哺乳动物细胞增殖对必需氨基酸的依赖性原理而设计的代谢标记蛋白质的方法。SILAC技术应用于定量蛋白质组研究,为全面、系统地定性和定量分析复杂哺乳动物细胞蛋白质组提供了有效的方案,是目前进行细胞中蛋白质相互作用和蛋白质表达差异的定量蛋白质组学技术。