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STR 介绍 短串联重复序列 (short tandem repeat,STR),又称为微卫星标记(microsatellite)。它广泛并均匀地存在于真核生物基因组中,一般 由一个长2~6bp的核心序列经多次串联重复排列而成,重复次数大多在10~60次之间。个体间核心序列的重复次数呈高度变异性,构成了STR的遗传多态 性。由于STR具有分布广泛均匀、多态性丰富、信息量大、检测简便等优点,被认为是继限制性片段长度多态性(RFLP)之后的第二代遗传标记,已广泛应用 于遗传图谱绘制、基因定位、法医鉴定、遗传病诊断等诸多领域。 基本原理 利用高通量测序技术对短串联 重复(STR)位点进行深度测序,经过生物信息学分析,实现对STR位点的检测,与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比,可以直接根据序列,准确判断STR位 点的重复次数。借助多重PCR技术,能够实现在一个PCR反应中完成几十个STR位点的扩增,二代测序的超高通量,可将上千个样本和STR位点混合检测, 大大降低实验成本。 服务流程 1、客户沟通,确认实验信息(包括物种,样本数,样本类型,检测片段),并进行相关分析,评估实验可行性。 2、样本质控,设计合成引物 3、小试、中试,调整多重PCR反应体系,评估扩增效果 4、PCR生产,构建高通量测序文库 5、上机测序 6、生物信息学分析,将实验报告和数据交付客户。 提供结果 提供的结果包括: 1、实验报告,含实验材料与方法,所用引物序列等等 2、结果汇总,各样本中STR位点的重复次数或片段大小(excel形式) 样本要求 1、若样品为基因组DNA,要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。 2、若分型样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于500ul,需用抗凝剂抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。 3、客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。 4、提供STR位点信息(序列及STR重复次数)。 上海翼和应用生物技术有限公司 服务热线******nbsp; ******br> 网址:http://www.biowing.com.cn/ 邮箱:biowing@vip.163.com
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