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高通量STR/SSR分型服务

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STR 介绍
短串联重复序列 (short tandem repeat,STR),又称为微卫星标记(microsatellite)。它广泛并均匀地存在于真核生物基因组中,一般 由一个长2~6bp的核心序列经多次串联重复排列而成,重复次数大多在10~60次之间。个体间核心序列的重复次数呈高度变异性,构成了STR的遗传多态 性。由于STR具有分布广泛均匀、多态性丰富、信息量大、检测简便等优点,被认为是继限制性片段长度多态性(RFLP)之后的第二代遗传标记,已广泛应用 于遗传图谱绘制、基因定位、法医鉴定、遗传病诊断等诸多领域。
 基本原理
利用高通量测序技术对短串联 重复(STR)位点进行深度测序,经过生物信息学分析,实现对STR位点的检测,与传统的凝胶电泳或毛细管电泳相比,可以直接根据序列,准确判断STR位 点的重复次数。借助多重PCR技术,能够实现在一个PCR反应中完成几十个STR位点的扩增,二代测序的超高通量,可将上千个样本和STR位点混合检测, 大大降低实验成本。
 服务流程
1、客户沟通,确认实验信息(包括物种,样本数,样本类型,检测片段),并进行相关分析,评估实验可行性。
2、样本质控,设计合成引物
3、小试、中试,调整多重PCR反应体系,评估扩增效果
4、PCR生产,构建高通量测序文库
5、上机测序
6、生物信息学分析,将实验报告和数据交付客户。
提供结果
提供的结果包括:
1、实验报告,含实验材料与方法,所用引物序列等等
2、结果汇总,各样本中STR位点的重复次数或片段大小(excel形式)
样本要求
1、若样品为基因组DNA,要求:DNA浓度≥20ng/ul,体积>20ul。纯度OD 260/OD280 在1.8~2.0之间。
2、若分型样品为血样,样本要求:血液样品,体积大于500ul,需用抗凝剂抗凝,送样过程中请注意保持低温,防止DNA降解。提取DNA将收取DNA提取费。
3、客户在寄送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少在运输过程中因温度变化导致DNA降解的可能。
4、提供STR位点信息(序列及STR重复次数)。

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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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