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生物芯片数据的分析

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型号	品牌	PIPES指数
表达谱芯片	基尔顿	5.0
		5.0
microRNA靶基因PCR芯片	卓立生物	5.0

仪器相关信息

仪器描述

芯片类型	服务描述	服务内容
cDNA表达谱基因芯片	为Affymetrix、Aligent、illumina及国内诸多品牌的表达谱芯片提供专业数据分析。	提供包括聚类分析、基因功能分类注释(GO分类）、代谢通路分析(pathway分析)、转录因子（TF）分析、Data-driven Network分析、Knowledge-driven Network分析、疾病的分型及（疾病）预测模型的构建等诸多项数据分析项目.
蛋白质芯片	基于SELDI-TOF-MS平台和MALDI-TOF-MS平台，为客户提供包括实验设计、实验操作、数据分析及实验验证在内的全程服务解决方案.	提供原始聚类分析、样本的主成分分析（PCA）、分组差异peak的筛选、疾病的分型、疾病预测模型的构建及差异蛋白鉴定.
MicroRNA芯片	为Exiqon、SuperArray等诸多类型的MicroRNA芯片提供数据分析	提供聚类分析、MicroRNA的功能、基因座分类、靶基因预测、靶基因预测、调控网络分析等多项服务.
Exon芯片	为各种平台的Exon平台提供数据分析	提供包括Exon水平表达值的获取、Gene水平表达值的获取、可变剪切体的寻找及后续分析.
SNP芯片	Illumina,Affymetrix等不同平台的SNP	分析项目：SNP注释、基于模式识别的SNP挖掘、诊断模型建立、不同SNP平台整合分析、SNP芯片与表达谱芯片，aCGH等其他高通量数据整合及后期的实验验证
甲基化（CpG）芯片	各种平台的甲基化芯片	项目包括分析探针水平数据的平滑处理以及差异CpG 岛的筛选、CpG 的基因注释并寻找CpG 岛对应的基因启动子、转录因子预测分析、甲基化显著基因的功能分析、甲基化与基因表达的相关性分析，及zei后的实验验证，测序引物设计等
质谱（MS）实验	ESI，MALDI等各种平台的质谱数据	分析项目包括不同的分组对应进行差异蛋白/峰的筛选，及其应基因的搜索，并进一步的进行gene ontology分类，pathway通路分析等。

生物芯片数据的分析,

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Illumina SNP 芯片服务 Illumina基因表达谱芯片服务 Illumina 850k (EPIC)甲基化芯片服务人 SNP 芯片转录组-ceRNA芯片

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