您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?
如果企业客服不在线,也可拨打400电话联系。或者发布求购信息
真菌的基因组通常较大且复杂,传统的技术无法满足真菌全基因研究的大数据量需求,新一代高通量测序技术, 以其高通量,高准确率,周期快的特点,为真菌的研究提供强有力的支撑,可用于预测真菌的重要基因和蛋白以了解其功能和可能机制;在研究植物致病性真菌方面,可以鉴定致病真菌与农作物互作及致病的相关基因,并可用于研究与其近缘物种的进化关系,比较基因组研究等;在食用真菌和药用真菌的研究方面,可以用于发现真菌复杂的代谢途径,鉴定其对人有益的代谢产物,比较基因组等;另外还可用于生物防治真菌的研究,工业酵母菌的研究等。
高性价比:低价获得 50× coverage的全基因组数据,及其组装结果
快速精准:摆脱传统研究方法,从碱基水平获得物种真实信息
1、数据处理
1) 去除接头污染和低质量数据;
2) 产出数据及质控统计。
2、基因组组装及概况(GC-depth 分析,k-mer 分析,NT 库比对)
3、基因组组分分析
1) 基因成分;
2) 重复序列;
3) 真菌非编码 RNA 预测。
4、基因功能分析
1) 通用功能注释(默认 KEGG, SwissProt, GO, 可选 Nr,COG)
2) 病原真菌致病性研究
病原与宿主互作数据库(PHI)注释;
碳水化合物相关酶(CAZy)数据库注释;
细胞色素 P450 数据库注释。
3) 分泌蛋白预测。
5、 信息挖掘推荐
1) 数据注释结果的初级应用
2) 不同类型真菌基因组分析推荐
6、 比较基因组
1) 结构变异(共线性)
2) 基因家族
3) 共有基因和特有基因
4) 物种进化(基于共有基因和特有基因或基因家族构建系统发育树)
7、定制化信息分析
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。
欢迎关注华大科技的微博和微信!
真菌de novo测序,
真菌de novo测序信息由华大科技为您提供,如您想了解更多关于真菌de novo测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
Orion Star A 便携式高端溶解氧测量仪
独立三槽-biometra TProfessional Trio 热循环仪
岩心/土壤高光谱成像仪
奥豪斯 SC310 pH电极
透射电镜(TEM)用氮化硅薄膜窗口
激光单粒子效应模拟测量系统
超低温高效节能冰箱U410-HEF, U570-HEF, C660-HEF & U725-G
856电导率仪
群组论坛--近红外(NIR)
您可能要找:分子生物学整体服务真菌de novo测序价格分子生物学整体服务参数
Copyright ©2007 ANTPedia, All Rights Reserved
京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号