【王老师带你玩转FlowJo®】之插件安装好帮手——PluginWizard

2024-08-12 16:15:39 碧迪医疗器械(上海)有限公司(BD中国)


转眼间王老师带你玩转FlowJo®系列专栏已经给大家介绍了很多前沿的算法和插件的使用了,每一次分享都会收到很多热烈反馈。那么也有老师和我交流说觉得插件安装要跑R程序很麻烦,担心自己安装不成功,不能很好的体验相关插件的功能。


那么今天王老师就给大家带来FlowJo® Exchange官网近期更新的PluginWizard插件,他的主要功能就是帮助老师们自动安装插件。

在介绍PluginWizard插件之前,王老师想“澄清”一件事情。FlowJo Exchange官网的插件并非都需要我们跑R的程序,相反这些插件只占据很小一部分,如下图所示。

备注:不依赖R/依赖R是根据是否要跑R语句来划分的

(以上图片可点击放大查看)


PartI—— PluginWizard插件详解

    不依赖R的插件安装通过我们之前已经反复和大家强调过的“三步法”安装即可。那么依赖R的插件则可以请插件安装魔法师帮助我们完成。


1.关于PluginWizard插件调用。选中任意文件,点击Workspace下的Plugin按钮即可调取PluginWizard插件界面。

    PluginWizard的功能界面看似平平无奇,其实暗藏玄机。插件安装魔法师整合了FlowJo® Docs英文说明书官网,R/Rtools软件下载界面以及自动连接FlowJo® Exchange官网行使自动下载安装包的功能。最重要的是他能够自动下载R包,让我们和R语句说再见。


2.首先是最上方的FlowJo® Docs官网链接,点击链接到插件安装步骤详解界面。

3.Step01对应的是R软件下载界面(Windows用户建议下载3.6.2版本软件)。

4.Step02-04对应的是我们需要手动设置R安装路径、Plugin文件夹路径以及勾选自动安装插件包选项。

5.Step05对应的是FlowJo® Exchange官网。点开后的小窗口中我们可以概览最新插件版本和在本地中已经下载的插件版本。点击相应插件的最新版本就会自动链接到插件包下载界面。

6.Advanced对应的是Rtools下载界面(Windows用户建议下载Rtools35.exe版本),Phenograph聚类插件依赖Rtools。

7.Step01-05完成以后,点击OK即可。插件魔法师将为你下载相应插件所需R包,下载完成以后会弹出以下界面,点击OK然后重启FlowJo®。

(以上图片可点击放大查看)


PartII——PluginWizard插件安装、操作演示视频

    除了图文详解我还为老师们准备了相应的演示视频。PluginWizard不依赖R,所以我们先根据“三步法”对魔法师进行安装,相信插件安装不再难!

(视频可点击浏览)


最后我还要提醒老师们的是,无论是大家购买的正版FlowJo®还是申请的30天免费试用版本,所有功能都是一致的,大家赶快用起来吧!

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