双管齐下:自动化设备搭配试剂,全方位助力合成生物学

2023-04-06 20:09:01 苏州镁伽科技有限公司


镁月研读

探索生命科学自动化


合成生物学,重新定义生物制造

合成生物学是继“DNA双螺旋结构的发现”和“人类基因组计划“之后,以工程化的手段设计合成基因组为标志的第三次生物技术革命。作为一门交叉学科,促进了生命科学从基于观测、描述及经验的科学跃升为可预测、可定量及可工程化的科学,并在医疗、能源、工业、农业、环境、信息等领域的应用日益广泛。


合成生物学作为一个战略性新兴产业技术,其本质指人们将“基因”连接成网络,让细胞来完成设计人员设想的各种任务,该领域近年来得益于合成生物技术突破、政策支持等因素取得了快速发展。


在《2016—2045年新兴科技趋势报告》中也明确提出,“合成生物科技”是最值得关注的科技及发展趋势之,并认为“合成生物科技的进步,将推动人类跨入生物科技的新纪元”。


如果将合成生物学的产业链按照上中下游分类,上游则包含可以驱动产业发展的技术生态系统,如DNA/RNA合成、测序及编辑,以及相关自动化企业的产品与服务;中游产业涉及对生物系统和生物体进行设计、开发的技术平台;下游产业则是涉及多个行业的应用开发和产品落地。如果上中游产业通过不断地技术革新、提高生产效率及构建解决方案,在未来可能会占据产业链的核心位置。


双管齐下,镁伽合成生物学平台

镁伽合成生物学方案,通过DBTL(Design-Build-Test-Learn)这一闭环,深入掌握基因线路的设计原理,构建集成的自动化分子克隆工作流程,利用高通量自动化设备及试剂赋能质粒构建和菌种筛选过程最大限度地减少DNA序列分离过程中的错误和污染,提高目标蛋白的产量,真正做到解放科学家的同时,保证数据质量的可靠性、一致性和重现性。


提速增效,预分装减少人工操作

磁珠法免离心质粒提取试剂盒

Mega-Centrifuge-Free-Plasmid Mini Kit  (Magnetic Beads)

该试剂盒可以实现目标质粒DNA的高效提取和纯化,可广泛应用于合成生物学的全自动化质粒构建。

产品特点:

快速:提取全过程无需离心,从菌液收集到提取完成仅需45min;

高通量:96通道,一键提取;

高得率:1mL过滤菌可提取25μg质粒;

高质量:质粒可直接用于测序和下游细胞转染。


预分装dsDNA HS定量试剂盒

dsDNA HS Assay For Microplate Reader

适用于双链DNA的大规模定量,可广泛应用于全自动化质粒构建过程中的DNA定量以及NGS建库中的Input DNA定量、DNA文库定量等。

产品特点:

灵敏精确:对dsDNA具有高度选择性,对常规污染物如蛋白质、盐类等具有良好耐受性;

操作简便:为预分装试剂,使用时只需将检测工作液与待测dsDNA样品混合,即可使用酶标仪读数;

应用快捷:搭配8个浓度的标准品,无需稀释即可建立标准曲线。


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数据验证,无需进行自动化条件优化

镁伽合成生物学自动化配套试剂,通过高通量实验室质粒构建系统进行实验测试,以下为部分实验数据:


  • 高保真聚合酶试剂盒,可提高产物得率,增强扩增特异性

结果分析:通过对重叠延伸PCR法所得的全基因合成产物进行核酸电泳分析,发现与其他同类试剂相比,镁伽高保真聚合酶参与所得PCR产物的目的条带亮度更强,非特异性条带更少,可有效提高反应产物得率并增强PCR扩增特异性。



  • 预分装dsDNA HS定量试剂盒操作简单、灵敏精确、特异性良好、染料结合速率均一稳定


灵敏度

0.2-100ng范围内线性良好


特异性

RNA对测试值的干扰

小于5%

染料结合速率测试

1-7min都能均一结合

检测结果稳定



  • 磁珠法免离心质粒提取试剂盒,提取效率高,产物质量无忧

提取效率:采用该试剂盒提取48份1.0mL过夜培养菌液,通过对质粒产物进行核酸电泳和浓度检测分析,结果显示质粒提取产率佳、完整性好、纯度高,产物质量有保障。 


Marker : DL15000 上样7μL

样品:120μL 洗脱,上样6μL



产品比较:采用磁珠法免离心质粒提取试剂盒和传统柱法质粒抽提试剂盒分别提取8份1.0mL过夜培养菌液,实验结果显示,磁珠法质粒提取与传统柱法无显著差异。


磁珠法

柱法

Marker : DL15000 上样7μL

样品:120μL 洗脱,上样6μL



  • 合成生物学预分装试剂与自动化设备高度匹配

实验对比:在自动化分子克隆实验中,使用镁伽预分装试剂对实验进行优化。通过对比优化前后菌落生长情况,结果表明:优化前菌落密集,克隆间距小,部分克隆挑选困难;优化后菌落分布均匀、轮廓清晰,相较于同类试剂自动化匹配度更高,更易进行后续自动化克隆挑选。


优化前

优化后


研读小结

随着合成生物技术的快速发展,不断催生出位于产业上、中、下游的工具型、平台型和产品型公司。镁伽依靠鲲鹏实验室的科研能力,持续助力为行业带来高附加值的生产力工具和服务,提供一站式智能化合成生物学解决方案。可根据客户需求搭建高通量、自动化、信息化的合成生物学实验室,包括整体设备、试剂配套方案,及数据验证参数建议等。


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