大爆炸!4D蛋白组/修饰组/空间蛋白组开启DIA宇宙

2022-11-11 12:10:45, 景杰生物 杭州景杰生物科技有限公司


◉ DIA宇宙


第四维度:离子淌度分‍离 (ion mobility) 的引入,使得蛋白质组学步入了4D新时代。作为国内4D蛋白质组学技术的引领者 (4D万象,道在日新 | 4D三周年,景杰全“新”出发),景杰生物基于对行业需求洞察及超万例的蛋白质组分析经验基础上,行业率先推出全新系列4D-DIA新产品 (2019年首次推出),产品线包括4D-FastDIA蛋白组Blood+DIA高深度血液蛋白组4D-ptmDIA修饰组空间蛋白组Spatial-DIA单细胞/微量Single-DIA,带来蛋白质组学在更多应用场景的全面拓展。


图1 景杰生物4D-DIA产品地图1.0

1 蛋白组定量:4D-FastDIA技术



4D-FastDIA蛋白组技术结合了4D蛋白组+dia-PASEF+深度神经网络搜库的众多权威技术,在4D高深度和高准确性的优势上,结合DIA策略低缺失值、高稳定性的特征,强强结合,进一步提升了蛋白质组分析的深度、重复性与稳定性

实测数据显示,4D-FastDIA鉴定深度在4D-LFQ (DDA) 基础上进一步提升 (图2上),对于常规样品单针可以实现6000+的鉴定深度,同时具有极高的鉴定可靠性 (图2左下) 和技术重复性 (Pearson 0.99,图2右下),数据完整度提高,缺失值显著下降。


图2 4D-FastDIA蛋白组项目数据

2 血液高深度定量:Blood+DIA技术



针对血液样本的特征,景杰生物Blood+DIA高深度定量技术,对样本前处理、色谱分离、质谱检测、数据分析等全流程进行了深度优化,具有更高的血液类样品鉴定深度和定量重复性。

Blood+DIA通过抗体特异性去除前14种高丰度蛋白,大大提升了进入质谱分析的低丰度肽段的绝对含量,使得蛋白的鉴定数量和定量重复性显著提升 (图3上),同时兼具高通量高稳定性的技术特性,特别适合大规模体液队列的快速分析。如下图所示,项目实测 (155个血液样本) 数据对单个血液样本实现1000+蛋白的高深度覆盖,且结果具有高重复性 (Pearson=0.99)(图3下)Blood+DIA技术结合权威的SwissProt数据库和强大的机器学习应用为分子机制发现、血液标志物筛选、药物靶点发现和临床转化应用提供新的强大工具

图3 Blood+DIA血液蛋白质组高深度定量

3 修饰组定量:4D-ptmDIA技术



4D-ptmDIA技术结合了景杰4D修饰组学技术 (4D-PTMomicsTM)+dia-PASEF+深度神经网络搜库的众多权威技术,极大提升修饰位点检测的灵敏度和位点定位准确性。通过新增的离子淌度分离,帮助解决修饰的同分异构问题,使得翻译后修饰位点的鉴定和定位更加可靠 (图4左)

实测项目数据显示,4D-ptmDIA技术进一步提升了修饰组学定量的深度、重复性与稳定性。内测数据显示,单个样本也取得了非常有竞争力的位点鉴定深度 (图4右)

图4 修饰组定量:4D-ptmDIA技术

4 空间蛋白组:Spatial-DIA



景杰生物Spatial-DIA技术独有的高灵敏度和高重复性特征,在空间蛋白质组学分析中呈现极佳的表现。项目实测数据显示,Spatial-DIA能在0.01 mm2 ×10 μm的常规组织样本 (约50~100个细胞) 中,平均检测深度大于3000个蛋白,相比常规蛋白组定量产品 (~1000个蛋白) 提升3倍以上。各类病理区域所含的蛋白能够通过PCA分析相互区分,不同组织间的相关性系数分析能够明显区分,高精度高深度高重复性地呈现空间微尺度分子景观。

图5 空间蛋白组Spatial-DIA

全新4D-DIA产品系列的上线,代表了4D蛋白组技术在各领域的应用场景更为完善丰富。其表现出来的强大性能,也将作为原生动力,促使蛋白质组学在4D新时代迸发出巨大能力。更多技术详情,欢迎扫码咨询或拨打科服热线400-100-1145




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