2022-07-21 08:20:33, 共享未来的 深圳华大智造科技有限公司
TBM科研训练营
随着对肿瘤认识的不断深入,肿瘤学的研究方法呈现出新的发展趋势,从显微技术到基因测序,再到如今的时空技术,生命全景时空图谱绘制将不再遥远,时间和空间维度多维研究技术结合,将以全新研究思路出发,既能够获得单个细胞间异质性,又能获得细胞在组织空间上的结构位置信息,发现更多未知且精细化结果。那么基于DNBSEQ测序平台上的时空组学(STOmicsTM) 及单细胞技术(DNBelab C4)又能在肿瘤的临床科研中发挥怎么样的“妙用”?多组学的测序数据又是如何整合和分析的?肿瘤微环境改变和转移复发又是如何发生的呢?
特邀嘉宾
张岩 教授
哈尔滨工业大学
哈尔滨工业大学生命科学与技术学院计算生物学研究中心主任,博士生导师。硕士及博士就读于日本新泻大学。中国生物信息学会(筹)理事,中国抗癌协会肿瘤标志专委会常务委员,中国抗癌协会肿瘤标志专委会肿瘤测序与大数据分析专家委员会组长,中国计算机学会生物信息学专委会委员。中国生物医学工程学会数字医疗与医疗信息化分会委员。
研究方向:生物信息学及肿瘤信息学、计算表观遗传学。以负责人承担国家自然科学基金联合基金重点项目1项及面上项目4项,省部级重点项目及应用研发项目等10余项。研究方向涉及到临床医学数据、肿瘤生物学、发育生物学等领域的数据分析及技术平台开发。系列研究成果发表在Nucleic Acids Research、Molecular Oncology、Development、Epigenomics、Briefings in Bioinformatics、Database等杂志。
吴靓 副研究员
深圳华大生命科学研究院
中国科学院大学基因组学博士,华中科技大学生物医学工程硕士。主要从事高通量单细胞技术平台开发、单细胞组学用于肿瘤异质性及微环境的研究。主导开发高通量单细胞样品制备平台3项,申请专利11项。发表SCI文章18篇,其中以第一作者/通讯作者(含共同)在Cell、Nature Communications 及 Genomics ,Proteomics & Bioinformatics 等期刊发表文章9篇。主持广东省青年基金1项。
王晨飞 研究员
同济大学生命科学与技术学院
同济大学生命科学与技术学院任特聘研究员。获得吴瑞奖学金、中国博士后创新人才支持计划、上海市科技启明星等荣誉。2012及2017年于同济大学生命科学与技术学院获得生物信息学学士、博士学位。2017-2020年分别在同济大学生命科学与技术学院、美国哈佛大学Dana-Farber癌症研究所从事博士后研究。
研究方向主要为开发单细胞多组学整合分析的生物信息学方法,研究细胞命运转变在肿瘤、发育及衰老相关疾病中的调控及作用。代表性研究工作包括开发了单细胞转录组与表观组整合分析方法MAESTRO,单细胞肿瘤免疫分析平台TISCH,空间转录组学精度提升算法STRIDE等。以第一/通讯作者身份在Nature、Nature Cell Biology、Cell Stem Cell、Genome Biology、Nucleic Acid Research、Cell Discovery 等杂志发表多篇研究论文。
苏建忠 教授
温州医科大学生物医学大数据研究所
温州医科大学生物医学大数据研究所所长,温州医科大学眼视光学院、生物医学工程学院生物信息方向学术带头人,浙江省杰青。主要研究方向为癌症计算表观遗传学;以DNA甲基化等表观数据深度分析为基础,解析癌症发生发展过程关键表观调控机制,开发具有重要实用价值的表观遗传特征分子识别新算法,开展基因组DNA甲基化编辑新技术研究,精确鉴定可用于临床的癌症早期诊断和亚型分类分子标记物。共发表学术论文36篇,总影响因子260余点,其中SCI影响因子大于10的论文15篇。以第一或通讯作者(含共同)在Nature Genetics(1篇,IF=27.13)、Nature Communications(1篇,IF=12.12)、Genome Biology(2篇,IF=13.21)及Nucleic Acid Research(3篇,IF=11.56)等国际高水平期刊发表研究论文13篇。
王芳 教授
中山大学附属第一医院
中山大学附属第一医院精准研究院PI。2016-2020年美国MD安德森癌症中心(MD Anderson Cancer Center)博士后,曾任哈尔滨医科大学副教授,2020年入选中山大学“百人计划”。近年来一直致力于癌症生物信息学的研究工作,围绕癌症异质性和微进化,基于癌症多组学数据开发一系列生物信息学算法,揭示肿瘤异质性和免疫微环境、追踪肿瘤细胞演化过程、识别癌症相关的突变位点和新的候选治疗靶点。
相应的科研成果在国际期刊上累计发表SCI论文30余篇,成果相继发表在Nature Methods、Briefing in Bioinformatics、Plos computational biology、Nature Communications 等高水平的国际期刊杂志上,中国抗癌协会肿瘤标志专委会会员,中国计算机学会会员。
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