Tecan基因分型线上研讨会精彩回顾

2021-12-27 18:39:02, 帝肯生命科学帝肯（上海）实验器材有限公司

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本次线上研讨会由Davide Scaglione博士和Leonardo Caproni博士介绍了Allegro基因分型技术在多亲本杂交玉米重组自交系(RILs)上的应用。研究结果表明，这些标记可用于研究RILs的多样性以及支持农艺相关数量性状位点的鉴定。

关于基因分型的主要应用方向，你了解多少？

植物/动物性状选择和育种策略

疾病关联分析

种群多样性分析

种群结构与适应模式

Allegro基因分型已应用于多种生物研究种群研究。

但是灵活性是许多不同需求与期望的项目的关键需求。

Allegro与基因芯片相比又有哪些优势呢？

基因芯片平台	Allegro靶向基因分型
不可修改	容易实现panel修改
特定仪器	NGS的普及率提高，成本降低
更昂贵的费用	样本量的可拓展性
需要良好的SNPs	Panel的可拓展性（100-100k位点）
确认偏倚** （“选择性显示”）	删除确认偏倚在同一实验中实现基因分型和偏差的发现

**当一项研究或分析的数据被收集(或调查、筛选或记录)时，就会出现确认偏倚，使得目标人群中的一些成员比其他人更不可能被包括在最终的结果中。最终的研究样本变得有偏差，因为它与目标人群有系统性差异。确认偏倚与抽样偏差、选择偏差、检测偏差和观察者偏差有关。

本研讨会还介绍了Allegro基因分型利用Tecan DreamPrep实现高通量操作。

Allegro在DreamPrep自动化上有哪些价值呢？

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可以消除芯片平台的缺陷

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可以在保证（单个样本）价格竞争力的同时缩减规格

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可以扩大规模，最大限度地降低NGS成本

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灵活，允许持续优化panel，无需额外的花费

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可以成为一个集体资产：一个探针panel一旦在实验室共享，可以保证数据集的重现性与互操作性，且仅需一台测序设备，无需专门的平台，如基因芯片。

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关于帝肯

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