面包酵母快速质检 | FlowRACS 新应用

2026-02-11 10:36:03, 小赛 青岛星赛生物科技有限公司


FlowRACS

面包酵母快速质检

抗冻性能分析

自动化、高通量的单细胞技术




近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所、天津农学院的研究人员,利用星赛生物的高通量流式拉曼分选仪(FlowRACS),开发了一种基于单细胞拉曼光谱的面包酵母质检新技术,能够快速、低成本、一体化地评估面包酵母细胞的代谢活性和抗冻性能,提高酵母菌株筛选的效率和准确性,为基于单细胞水平的高活性、高耐冻性酵母菌株的高通量筛选和培养奠定坚实的技术基础。相关研究成果发表于化学传感领域权威期刊Synthetic and Systems Biotechnology《合成和系统生物技术》(IF:4.4)。







酵母产品品控难





市场上面包酵母产品琳琅满目,质量却参差不齐。

为了提升发酵产品的品质,酵母企业通常寻求代谢活性强的面包酵母;同时,考虑到生产和储存过程中的条件限制,面包酵母的抗冻能力变得越来越重要。因此,迫切需要开发一种既高效、精确又经济的方法,用以评估面包酵母的代谢活性和抗冻性能
目前,酵母生产企业对面包酵母的生理性能评估仍依赖于传统方法(如标准平板菌落计数法和化学检测)。这些方法操作繁琐、成本高昂且耗时漫长,评估结果的敏感性和准确性有限。这些局限性严重阻碍了面包酵母产品的快速、准确、经济效益型的性能评估,限制了面包酵母产业的进一步发展。




品控新技术





#实验流程


单细胞拉曼光谱(SCRS)采集
酵母细胞的 SCRS 采集:对于低糖酵母,用不同浓度(50%、75% 和 100%)的D2O代替H2O制备 LSMLD 培养基,选择酵母细胞生长最佳的浓度用于后续培养。酵母细胞在 D2O-LSMLD培养基中于 30°C、180rpm 振荡培养2-6小时。用无菌水冲洗细胞三次以去除残留的D2O。将细胞稀释后,取适量细胞悬浮液置于载玻片上进行单细胞拉曼光谱分析。对于高糖酵母,用 H-LSMLD(D2O代替H2O)培养基代替 LSMLD培养基。

海藻糖的SCRS采集:制备梯度浓度的海藻糖标准溶液,取适量溶液置于载玻片上,在与采集酵母细胞SCRS相同的条件下进行单细胞拉曼光谱表征。

拉曼法测量细胞代谢活性
在细胞代谢过程中,活细胞会利用D2O,导致在 2040 cm-1至 2300 cm-1处出现C-D峰。细胞代谢活性通过分析氘峰替换率(C-D Ratio,CDR)获得,即SCRS中具有C-D峰的比例。
拉曼法测量海藻糖含量
通过分析酵母细胞和海藻糖的SCRS来测量细胞内海藻糖含量。研究表明,海藻糖在SCRS的指纹区域(485、536、851、920、1130、1360 和 1465 cm-1处观察到)有几个特征峰,并且峰高与海藻糖含量相关。

以 1130 cm-1处的峰面积为 y 轴,海藻糖浓度为 x 轴,建立海藻糖的拉曼标准曲线,因为峰面积比峰高更能准确地定量物质。使用R软件获取酵母细胞的平均 SCRS。将平均 SCRS 与拉曼标准曲线相关联,实现对酵母细胞内海藻糖含量的定量分析。

拉曼法测量细胞活力

通过分析酵母细胞的SCRS,获得MAL值,进而评估酵母单细胞的代谢活力。具有高MAL的细胞具有高效的代谢过程,表明在利用D2O方面效率更高,因此具有更高的C-D峰。



#实验结果


面包酵母SCRS采集并确定与产品质检相关的拉曼特征峰

研究人员从市场上购买广泛使用的酵母产品,获得了8种面包酵母菌株(菌株A-H),其中菌株A-D从商业化低糖酵母产品中分离获得,菌株E-H从商业化高糖酵母产品中分离获得。

图1 八种酵母细胞冷冻前和冷冻后的单细胞拉曼光谱(SCRS)

将冷冻前后的酵母菌株分别置于含D2O的培养基中孵育,每组菌株采集120-150条SCRS,海藻糖在1130 cm-1处显示出一个强峰,冷冻后的SCRS中海藻糖标准曲线显示海藻糖特征峰面积与海藻糖浓度存在线性相关(图1)。由于细胞对D2O的利用,在2000-2300 cm-1出现C-D峰,可用于量化酵母细胞的代谢活性。

酵母产品的细胞活性检测

将冷冻前后的菌株分别置于含D2O的培养基中,不同发酵时间点取样检测,结果发现,随着发酵时间的增加,低糖酵母菌株的细胞活性呈上升趋势(图2A-D),而高糖酵母菌株则呈下降(图2E-H)。拉曼光谱法检测细胞活性的结果与传统方法(平板菌落计数法)高度相关,所有菌株显示出高皮尔逊相关系数(r > 0.9)。

图2 传统方法(TM)和拉曼方法(RM)测量冷冻前和冷冻后(F)酵母细胞的代谢活性


在酵母冷冻后,所有菌株的细胞活性普遍下降,而低糖酵母菌株的下降幅度更大。

值得注意的是,与传统的标准平板菌落计数法相比,拉曼方法的细胞活性结果比传统方法高出10-20%。这归因于拉曼方法是在单细胞水平上检测细胞活性,可识别低代谢活性的酵母细胞,而这些细胞无法通过传统方法检测到。因此,拉曼方法在测量酵母细胞活性方面具有高灵敏度和准确性的优势,能够准确分析和评估酵母的发酵性能。

酵母产品细胞内海藻糖含量及低温保存存活率检测

分别使用拉曼方法和传统方法(蒽酮-硫酸法)测量八种酵母菌株在冷冻前后细胞内海藻糖含量和冷冻保存存活率。结果显示,每种酵母菌株胞内海藻糖的含量在冷冻后普遍增加,表明细胞通过内源性海藻糖合成来抵抗外部压力。

图3 传统方法(TM)和拉曼方法(RM)测量冷冻前和冷冻后(F)酵母细胞的胞内海藻糖含量、冷冻存活率

具体而言,高糖酵母菌株的冷冻耐受性要高于低糖酵母菌株,菌株A的胞内海藻糖含量最高为40.1 mg/g(图3A),菌株E的胞内海藻糖含量最高为139.5 mg/g(图3E),且高糖酵母菌株的冷冻保存存活率通常高于低糖酵母菌株,该结果与细胞活性一致。拉曼方法与传统方法在评估胞内海藻糖含量方面显示出高度相关性,证明拉曼方法的可行性和可信度。

酵母产品的发酵能力、胞内ATP含量和细胞活力检测

如图4D所示,在冷冻前,低糖酵母中菌株A显示出最高的MAL,表明具有最高的细胞活力,而菌株B最低;高糖酵母中菌株G的MAL最低,与传统方法的结果一致。值得注意的是,传统方法显示菌株H与其他菌株发酵能力差异较小,而拉曼法则显示其具有更高的MAL,表明菌株H的发酵能力未被传统方法识别。

图4 冷冻前后酵母制品的体积增量、代谢活性水平、细胞内 ATP 含量及异质性指数
添加剂对酵母产品的影响
拉曼法评估酵母菌纯培养菌株时与传统方法具有相同的可行性和可信度,然而酵母产品与纯培养菌株的MAL结果存在差异(图5A-B)。冷冻操作前,酵母产品的异质性指数(HI)高于纯培养酵母菌株,但其MAL值显著高于纯培养菌株(图5C),表明酵母产品具有更高的发酵能力。这种差异可能源于酵母产品中添加的乳化剂和抗氧化剂,这些成分增强了面团在发酵过程中的稳定性和抗氧化能力。

图5 传统方法与拉曼光谱法在评估酵母纯菌株方面的相关性,以及酵母纯菌株的发酵性能



本研究利用SCRS技术,建立了一种具有单细胞精度的面包酵母快速、精准评估方法。该技术通过重水孵育面包酵母细胞,根据SCRS的重水峰强度,实现了对单个酵母细胞代谢活性和细胞活力的量化分析,与传统方法相比具有更高的敏感性和准确性;根据SCRS中指纹区特征峰的分析,实现了对酵母细胞中海藻糖含量的定量检测,这一指标是衡量酵母细胞抗冻性能的关键,为耐寒酵母菌株的高效分辨及筛选提供了强有力的支撑。利用这一特点,研究人员可以进一步筛选出具有目标代谢水平和海藻糖含量的单细胞,并对其进行基因组测序或进一步培养,从而更有效地筛选培养出更有利于酵母产业发展的菌株。

这项新方法的应用,不仅加快了面包酵母产品的质量评估速度,还显著降低了评估成本。它能在短短几个小时内完成对产品中所有细胞的抗冷冻性能和代谢活性检测,与现有方法相比,速度提升了10倍以上,成本却仅为原来的十分之一。这一方法不仅为面包酵母生产商提供了高效的质检工具,也为消费者带来了更高质量的产品保障。




单细胞精度  表型快检









拉曼组能在单细胞精度,定量检测细胞利用含氢、含碳等底物的代谢速率、测定各种拉曼敏感产物(色素甘油三酯淀粉蛋白等)之多样性及其含量、表征细胞的环境应激性(如微生物药敏微生物药物应激机制肿瘤药敏性与药物应激机制等)、检测细胞之间的代谢互作、重建细胞内代谢物相互转化网络(拉曼组内关联分析;IRCA)、也可区分不同的物种。拉曼组能够测量的代谢表型范围仍在不断拓展中(点击查看)
国家重大科学仪器研制项目、科技部合成生物学重点研发计划等项目支持下推出的基于拉曼组技术的系列仪器,如单细胞拉曼光镊分选仪(RACS-Seq)、高通量流式拉曼分选仪(FlowRACS)等,打通了从单细胞代谢表型组表征到相对应高质量单细胞基因组测定的全流程,并示范了针对酶基因体内活性的高通量筛选、细胞工厂代谢功能快检、突变体(蓝光诱导产油超级微藻)代谢表型的高通量筛选、代谢模式转换识别等。


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