这些信息不知道,SPR实验= 白忙活+白花钱

2026-01-23 10:06:30, 熊晓生 极瞳生命科技(苏州)有限公司


新手做 SPR 分子互作实验,最容易踩的坑就是 “信息不全就开工”—— 要么样品不符合要求,要么数据无法分析,甚至花了钱却得不到有用结果。其实,实验成功的关键第一步,是把 “样品信息” 和 “实验需求” 摸透!


这篇干货帮你拆解实验前必须摸清的 10 类关键信息,每个信息都讲清 “作用 + 影响”,再教你怎么根据这些信息选实验类型和方法,新手也能一步到位~


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一、先搞懂:为什么实验前要这些信息?

SPR 实验的核心是 “配体(固定在芯片)” 与 “分析物(流经芯片)” 的互作检测,任何一项信息缺失或错误,都会导致:

  • 芯片选错→配体无法固定或活性丧失;

  • 实验方案不匹配→测不到动力学 / 亲和力数据;

  • 样品浪费→浓度梯度设计不合理,珍贵样品白消耗;

  • 数据无效→非特异性结合过高,拟合结果失真

简单说:信息越全,方案越精准,数据越靠谱,成本越低!

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二、实验前必搜集的 10 类核心信息

  1. 实验核心目标

  • 需明确:

    ✅ 仅判断 “是否结合”?

    ✅ 测动力学参数(ka/kd)?

    ✅ 测亲和力(KD)?

    ✅ 高通量筛选排序?

    ✅ 浓度定量?

  • 作用:直接决定实验方案的核心逻辑,是所有选择的基础。

  • 对实验的影响:

    ○ 目标模糊→方案冗余(比如不需要动力学却做了多浓度梯度,浪费时间);

    ○ 目标错配→数据无用(比如想定量浓度,却选了 “结合表征” 方案)。

  • 新手注意:药物研发、机制研究优先选 “动力学 + 亲和力”;化合物库筛选选 “高通量排序”;目标分子浓度定量选 “浓度分析”。

  1. 配体 & 分析物的 “样品类型”

  • 需明确:

    配体(固定端):蛋白 / 抗体 / 核酸 / 小分子 / 膜蛋白 / 病毒?

    分析物(流动端):蛋白 / 抗体 / 小分子 / 核酸 / 多肽?

  • 作用:匹配芯片类型和固定方法(比如小分子需高载量芯片,膜蛋白需疏水芯片)。

  • 对实验的影响:

    ○ 类型错配→配体无法固定(如核酸分子用通用型 C5 芯片);

  • 新手注意:常见组合直接对号入座 —— 蛋白 - 蛋白→C5 芯片;蛋白 - 小分子→高载量羧基芯片;膜蛋白→C5/L1/HPA 芯片。

  1. 样品标签 / 修饰信息

  • 需明确:

    配体 / 分析物是否带标签?(6XHis/GST/Fc/ 生物素 / 无标签)

  • 作用:快速确定固定方式,避免化学修饰破坏样品活性。

  • 对实验的影响:

    ○ 带 His 标签→选 NTA 芯片(捕获法,温和不破坏活性);

    ○ 生物素修饰→选 SA 芯片(结合牢固,适合高通量);

    ○ 无标签蛋白→选 C 系列芯片(氨基偶联,通用型);

    ○ 生物素修饰→选 SA 芯片(结合牢固,适合高通量)。

  • 新手注意:标签信息一定要准确。

  1. 样品分子量(MW)

  • 需明确:

    配体和分析物的准确分子量(单位:Da/KDa)

  • 作用:计算理论最大结合信号(Rmax),判断是否需要调整配体固定量。

  • 对实验的影响:

    ○ 小分子(<1000 Da)→信号弱,需提高配体固定量(5000~10000 RU);

    ○ 大颗粒(如病毒,>1000 KDa)→需低固定量(≤100 RU),避免分子拥挤;

    ○ 无分子量→无法计算 Rmax,无法判断结合信号是否有效(比如实际信号远低于理论值,可能是配体失活)。

  • 新手注意:分子量可通过 UniProt(蛋白)、ChemDraw(小分子)查询,务必准确。

  1. 样品纯度 & 浓度

  • 需明确:

    纯度(建议≥90%); 初始浓度(如 1 mg/mL)。

  • 作用:纯度决定数据特异性,浓度决定是否需要浓缩 / 稀释。

  • 对实验的影响:

    ○纯度 < 80%→杂蛋白 / 杂质导致非特异性结合,拟合出假阳性结果;

    ○ 浓度过低→无法达到有效结合浓度(如低于 KD 值的 0.1 倍),测不到亲和力;

    ○ 无纯度数据→实验后才发现有效浓度过低,无法补救。

  • 新手注意:动力学实验要求纯度≥90%,筛选实验可放宽至≥70%;纯度不足需提前浓缩,避免实验中断。

  1. 样品缓冲液成分

  • 需明确:

    缓冲液类型(PBS/HEPES/Tris)、离子强度(如 150 mM NaCl)、添加剂(DMSO / 甘油 / 表面活性剂)、pH 值。

  • 作用:避免缓冲液成分干扰配体固定或分子互作。

  • 对实验的影响:

    ○ 氨基偶联时含 Tris / 叠氮化钠→影响偶联效率,偶联量低;

    ○ 含高浓度 DMSO(>10%)→损害流路系统,影响信号稳定性;

  • ○ pH 偏离 4.0~8.5→配体 / 分析物失活,无结合信号。

  • 新手注意:提前告知缓冲液成分,实验人员会判断是否需要透析置换,避免白费功夫。

  1. 样品溶解度 & 稳定性

  • 需明确:

    分析物在缓冲液中的最大溶解度(如 50 μM); 样品是否易聚集、降解(如 4℃稳定 24h)

  • 作用:设计合理的浓度梯度,避免实验中样品失活。

  • 对实验的影响:

    ○ 溶解度低→无法设置覆盖 KD 值的浓度梯度(如 KD=1 μM,溶解度仅 0.5 μM,测不到饱和结合);

    ○ 易聚集→结合信号漂移,数据重复性差(RSD>10%);

    ○ 未确认稳定性→实验中样品降解,误以为 “无结合”

  • 新手注意:小分子溶解度低可加DMSO 助溶(通常5%),蛋白样品需现配现用,避免反复冻融。

  1. 互作体系特殊要求

  • 需明确:

    是否需要模拟生理环境(如 37℃温度、特定离子)? 是否有抑制物 / 竞争物?

  • 作用:优化实验条件,确保结果贴近真实生理场景。

  • 对实验的影响:

    ○ 膜蛋白实验需无洗涤剂缓冲液→否则脂质双层破坏;

    ○ 核酸互作需高离子强度(200 mM NaCl)→否则非特异性结合升高;

    ○ 未说明特殊要求→按常规条件(25℃、150 mM NaCl)做,结果与实际场景偏差大。

  1. 预期互作强度(可选但推荐)

  • 需明确:

    是否有文献参考值(如 KD=10 nM)? 预期是高亲和力(KD<10 nM)还是低亲和力(KD>1 μM)?

  • 作用:优化浓度梯度和再生条件,提高实验效率。

  • 对实验的影响:

    ○ 高亲和力互作→需更强再生液(如 pH2.0 甘氨酸),避免分析物残留;

    ○ 低亲和力互作→需高配体固定量 + 长结合时间(180s),否则信号太弱

  • 新手注意:无参考值也没关系,实验人员会通过预实验摸索,但有参考值能少走弯路。。

  1. 实验通量需求

  • 需明确:

    单对样品检测? 还是多样品筛选(如 1 个配体 + 50 个分析物)?

  • 作用:匹配实验类型和仪器通道,控制成本和周期。

  • 对实验的影响:

    ○ 单对样品→选 “结合表征”(成本约2500~3000 元 / 对),聚焦精准数据;

    ○ 5 个以上样品→选 “高通量筛选”(成本约2500 元含 5 个样品),性价比更高。


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三、如何根据这些信息选实验类型和方法?

第一步:按 “样品组合 + 目标” 选实验类型


第二步:按 “标签 + 样品类型” 选芯片和固定方法


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四、实验提示及样品信息清单

  1. 通过等电聚焦或使用软件预测,确定待分析蛋白的等电点。对等电点小于3的酸性蛋白一般不推荐进行分析;

  2. 对被固定在芯片上的配体和被测定的分析物的标准要求是纯度大于90%,最少200ug;

  3. 采用氨基偶联方法的配体缓冲液中不能含有Tris、叠氮化钠、甘氨酸等含伯胺基团的成分;

  4. 确保样品处于均一的、不聚集的状态,样品中没有任何沉淀、颗粒,请在样品测试前进行离心操作;

  5. 分析物样品中不含高折光率物质,如甘油、蔗糖、咪唑、有机溶剂等;

  6. 待测样品请尽可能更换至HPS或者PBS溶液(建议盐浓度低于10mM);

  7. 溶解小分子化合物的DMSO溶液请使用高质量有机溶剂,如Sigma等;

  8.  尽可能多的提供文献报道的相关信息,并尽量提供文献原文。


    其实,SPR 实验前的信息搜集,本质是 “让实验方案精准匹配你的需求”—— 信息越全,实验越顺利,数据越有价值。


    如果不确定自己的信息是否完整,或者不知道怎么选方案,可咨询发送样品信息表,直接把这份清单发给对接人员,就能帮你快速定制最优方案~

    PS:为保证信息对接准确实验顺利进行,一般实验前仍需预约样品沟通会。同时注意样品在运输转移过程中的稳定安全,保证样品信息与沟通一致。



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