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鸟枪战略(Shotgun Strategy)又称随机测序战略,是由美国塞莱拉遗传公司创始人克雷格·文特尔发明,主要针对大片段的全长测序。此策略是将基因组DNA用机械方法随机打断成小片段,并连入合适的载体构建亚克隆文库,从中随机挑取克隆测序,再通过生物信息学方法对测得的序列进行拼接组装以获得大片段DNA的序列。
构建不同插入片段大小的Shotgun文库(1.5~3 Kb、4~6 Kb、6~8 Kb等),可减少因基因组中的重复序列造成的错误拼装,提供更多Contigs之间的关联信息。Shotgun策略已广泛应用于包括基因组、叶绿体、线粒体、野生质粒、噬菌体、病毒以及Fosmid/Cosmid/BAC克隆等的全长测序。
BAC全长测序流程图
美吉优势
★ 成熟的Shotgun文库构建体系,确保您在zei短时间拿到数据
我们曾创造了10个工作日完成40 Kb Fosmid全长测序的记录。
★ 专业的生物信息团队
能提供可靠精准的序列拼接结果,8~10倍覆盖率,phred-20质量标准,全长准确率大于99.99%,并可提供专业的生物信息分析。
★ 丰富的实战经验
目前已成功完成了包括链霉菌、水稻、番茄、扬子鳄、熊猫、朱?等物种的
Fosmid/BAC克隆全长测序1000余例,小鼠、蚯蚓、油菜花、大豆等物种的线粒体
100余例,大肠杆菌的野生质粒、噬菌体、病毒等全长测序20余例。我们所提供的
全长序列已被众多实验室用于发表学术论文。
提供结果 完整的实验报告(包含实验细节、质控点、数据拼接记录和完整序列)。
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