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通量化及多基因siRNA文库筛选——10~7000基因同时Knock down筛选基因的功能与表型。
siRNA筛选及细胞模型 该技术平台建立于2006-2007年,拥有Tecan高通量液体分装设备,高灵敏度酶标仪,P2级细胞培养实验室。可以进行100-7000个siRNA基因文库的筛选工作,以及各类细胞模型的构建及表型检测工作。平台组成通量化及多基因siRNA文库筛选——10~7000基因同时Knock down筛选基因的功能与表型。
平台主要运用siRNA技术实现规模化基因沉默,可以进行Thermo, Qiagen等公司的商业大型siRNA文库或功能分类文库,也可以进行客户指定文库的筛选实验。
1. siRNA高通量干扰技术进行肿瘤新基因功能研究2. siRNA方法进行肿瘤功能基因的信号转导通路研究3. 基于siRNA技术规模化筛选新的肿瘤药物靶点4. 基于siRNA技术规模化筛选肿瘤药物的增敏基因或耐受基因5. 筛选和开发新的siRNA肿瘤基因治疗药物细胞模型构建及表型检测——特定的单个基因(包括miRNA)高表达或低表达细胞模型构建,以及后续的药物活性;细胞增殖,分化,迁移,厌氧培养,细胞周期等表型检测。细胞库资源——各类细胞株:人、鼠、肿瘤、血管内皮、原代等300多种细胞株siRNA筛选流程 可以将高通量测序及高通量表观遗传学在全基因组得到的差异化的具有潜在功能标志物基因群,进行规模化的siRNA的knock down的功能筛选研究:
参考文献: 徐晓晶,殷弘为 肝癌中高通量RNA干扰技术及其应用[J];中华肿瘤防治杂志2010 -12-14项目介绍:平台已完成上海市科委创新行动计划基础研究重点项目——(08JC1416500)《siRNA HTS数据分析方法在靶位点筛选中的应用》已与LXXXX,AXXXX等大型药物研发机构进行服务
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