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仪器种类 | 捕集离子淌度高分辨飞行时间质谱 |
布鲁克timsTOF SCP单细胞质谱系统
timsTOF SCP 专为无偏深度 4D-定量单细胞蛋白组学、免疫肽组学、表观蛋白质组学和翻译后修饰组学( PTM )设计,和 scRNA-seq 技术形成补充,从而拓展单细胞研究的视野。
重新定义单细胞蛋白质组学 —— 发现真正的蛋白质组异质性
拓展单细胞研究视野
超高灵敏度:开创性的新的离子源几何设计,让离子传输效率提高 5 倍,并带来更高的稳定性。
数据更完整:数据非依赖性采集 —— 平行累积连续碎列( dia-PASEF )超越定量重复性的极限,为大规模研究细胞异质性铺平道路。
超快采集速度:高采集速度与 dia-PASEF 灵敏度相结合,可采用短色谱梯度进行样本分析,从而减少极低的样本量分析时的色谱稀释效应。
更稳定:经过双正交反射后,离子再进入捕集离子淌度谱( TIMS )中,连续分析数千个样本也无需仪器的清洗。
重新定义单细胞蛋白质组学
先进的离子透镜和 PASEF 技术,可从单个细胞中发现细胞异质性和生物学特性
基于质谱的蛋白质组学已成为现代研究理解生物功能和疾病机制的主要工具。健康或疾病组织看起来是同质的,但其蛋白质组是非常不同的。破解每个细胞中的蛋白组的差异( 细胞异质性 )是充分理解其功能的关键。
timsTOF SCP 采用了一个全新改进的离子源概念,结合平行积累连续碎裂( PASEF® )采集方法的优势,提供了极高的速度和灵敏度,以应对单细胞的蛋白组或后几个细胞的翻译后修饰的分析挑战。
革命性的离子传输技术
发现真正的蛋白质组异质性
timsTOF SCP 采用经过改进的离子源几何设计,包括 1 毫米离子传输毛细管可将离子传输提升五倍,更高压力级的离子漏斗和八级真空系统。
更大的离子传输毛细管带来超高灵敏度,额外的正交离子反射和高压离子漏斗,提供独立的、差分真空系统,依然维持了 timsTOF 仪器系列所固有的系统稳定性。
蛋白质组学性能的显著提升
timsTOF SCP 全新的设计提高了离子在离子源里的传输,更高的真空度维持了仪器的稳定性,这些改进让离子传输提升近 5 倍。当与以 100 nL/min 流速运行的 Evosep One Whisper 方法和 dia-PASEF 方法相结合时,Evosep One 的灵敏度比以前的高流速方法提高了约 100 倍,这使得单细胞水平的无偏蛋白质组学具有非常好的重现性和稳定性,并首次实现每个细胞覆盖约 1,500 种蛋白质。
双 TIMS,CCS 支持的分析
捕集离子淌度谱( TIMS )首先是前级的气相分离技术,在高性能液相色谱(HPLC)和质谱分离的基础上,离子淌度带来的额外的一个维度分离,降低了样品的复杂离,提高了峰容量和分析的可靠性。
同样重要的是,TIMS 还对特定质量和淌度值的离子进行累积和聚焦,从而实现灵敏度和速度的独特提升。通过双 TIMS 技术,前部 TIMS 进行离子累积的同时,后部 TIMS 跟据离子淌度对离子进行释放,这样的设计可以实现近 100% 的离子利用率。这个过程也即为碰撞横截面( CCS )辅助的平行累积连续碎裂( PASEF® )分析。
支持 CCS 的分析为数据进一步的分析提供了很多的可能性,从更可靠的化合物鉴定到更可靠的数据库比对,以及的更大确定性到自信的库匹配,以及降低大型数据集中的误发现率( false discovery rates,FDRs )。
免疫肽组学和其它富集工作流程的理想检测工具
除了无偏真单细胞蛋白质组学应用外,timsTOF SCP 还提供了出色的灵敏度,可用于一些需要进行肽段富集的工作流程,比如免疫肽组学研究就需求从血浆或组织中纯化免疫肽开始。
由于免疫多肽在这些样本中以相对较低的丰度存在,timsTOF SCP 是理想的免疫肽组学分析,在可用材料有限的情况下进行新生抗原发现,比如生物活检的样本。timsTOF SCP 革命性的灵敏度还可用于在癌症信号通路的研究中的磷酸化蛋白质组学研究。
PASEF®
肽段离子通过捕集离子淌度谱( TIMS ) 分离,洗脱( ~ 100 ms ),并在四极杆飞行时间质谱( QTOF )上进行检测,生成 TIMS MS 热图。在 PASEF® 方法中,相同的 TIMS 分离后的离子又通过四极杆对特定离子进行逐一隔离。母离子和碎片离子谱图按离子淌度值进行对齐。
平行积累序列碎片( PASEF® )技术实现了 > 120 Hz 的扫描速度, 使用 PASEF® 通过多次选择低丰度肽来提高低丰度肽的 MS/MS 谱图质量。
PASEF® :鸟枪法蛋白质组学的完美选择
由 PASEF® 驱动的 timsTOF SCP 提供 >120 Hz 的扫描速度,而不会牺牲灵敏度或分辨率,这是通过四极杆筛选离子和碰撞池中的离子碎裂与 TIMS 中肽段离子包释放保持同步而实现的。
PaSER Run & Done —— 无偏单细胞分析数据的实时质量控制
timsTOF SCP 可以以超过 120 Hz 的扫描速度,对数百个微量样本( < 200 ng )进行分析。这改变了蛋白质组学的研究方式,但增加的数据量对数据分析提出了新的要求。
数据分析已经成为许多工作流程中常见的瓶颈。现代分析方法经常需要在 timsTOF SCP上生成数百个数据,布鲁克已经推出的实时数据库搜索功能 —— 实时并行数据库搜索引擎( PaSER ),从而消除了这一障碍,使用 PaSER, LC-MS 运行一旦完成,结果就即使呈现 —— 也就是 “ Run & Done ”。
MaxQuant/Perseus 和 PEAKS Studio 数据处理
开放式数据格式允许研究人员直接使用原始数据,并使用自己选择的行业领先软件。
MaxQuant 软件通过保留时间、离子淌度、质量和信号强度来提取 4 维(4D )特征。这有利于肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。
PEAKS Studio 将 de novo 测序与传统数据库搜索相结合,并对 timsTOF 原始数据的处理进行了优化。
超高灵敏度的 dia-PASEF 加持的 4D-蛋白质组学
CCS 支持的分析使鉴定更可靠
timsControl 允许针对感兴趣的离子进行 dia-PASEF 窗口的自定义,并能调整质量隔离窗口,TIMS 的扫描范围,和循环时间,以使 dia-PASEF 方法适应不同的色谱方法有趣的离子。
结合 Evosep One 系统的低流速方法与 timsTOF SCP 高灵敏度的 dia-PASEF 方法,可从 500pg 细胞消化液内鉴定出超过 2,000 个蛋白质,从 250pg 的细胞被鉴定出超过 1,500 个蛋白质。这展示了真正的单细胞蛋白质组学所需的灵敏度。从 250pg 中鉴定出的蛋白质的丰度范围约为 4 个数量级,可以在单细胞水平上进行蛋白质组定量分析。
探索肿瘤微环境
理解 TME 及其浸润性免疫细胞可被认为是影响疾病进展、治疗反应和患者生存的关键步骤。凭借其高灵敏度,timsTOF SCP 能够在 FFPE 组织样本的激光捕获显微切割( LMD )获得的细胞上获得足够的蛋白质组深度。典型的工作流如图所示。
在 timsTOF SCP 仪器上,细胞标记物用于识别肿块中的黑色素瘤癌细胞和那些与基质密切相关的细胞,随后通过 LMD 对这两个群体分割,然后进行无偏 4D-蛋白质组学分析。
关键发现:富集分析揭示了中枢和外周黑色素瘤细胞之间的差异调控蛋白,有可能进行疾病分型以指导临床决策。结果由 Matthias Mann 教授提供 (doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.22.423933)
" 我总是说,单细胞蛋白质组学不会发生在我有生之年,但我很高兴这个说法被证明是错误的。"
布鲁克timsTOF SCP单细胞质谱系统 拓展单细胞研究视野,timsTOF SCP
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2023年9月24-27日,人体蛋白质组导航国际大科学计划全球峰会暨第十二届中国蛋白质组学大会(CNHUPO 2023)将在中国成都举行。 值此盛会,布鲁克和景杰生物将于9月26日联合举办CNHUPO专题午餐会,聚焦单细胞蛋白质组学和微量蛋白质学技术,致力于推动精准医疗发展。 诚挚邀请您参加本次午餐会。会议时间和地点2023年9月26日 12:30-13:30 成都非遗博览园缇沃丽酒店,3楼,会议室1
2020-2023年中国质谱学术大会日程将于2023年6月9-13日在杭州召开,布鲁克将携ASMS 2023最新发布的前沿质谱技术和产品盛装参与本次会议,欢迎大家前往布鲁克展台(A11-13)和布鲁克午餐会(6月10日)交流指导!布鲁克午餐会 ——单细胞蛋白质组学和空间多组学6月10日 12:00-13:30杭州太虚湖假日酒店 紫光厅B会议日程12:00-12:15-12:20 签到发餐+欢迎致辞12:20-12:40《全新
ProteomicsUncover the latest in plasma proteomics biomarker discovery and high-throughput analysesMetabolomicsDive into high-throughput mass spectrometry for metabolomics discovery and innovative mapping approachesPharmaDiscover t
蛋白质组学技术已经成为推动精准医学加速临床转化的主要支撑技术。通过蛋白质组学技术能够探索疾病机制获得疾病诊疗标志物,发现治疗药物靶点。围绕临床应用,面对临床队列设计复杂、样本异质性、血液高丰度、样本微量等挑战,布鲁克与青莲百奥共同组织了此次“高深度蛋白质组学新技术研讨会”,与临床疾病专家共同讨论血液蛋白质组学和空间蛋白质组学等热点方向的前沿进展,推动多学科融合,助力技术创新临床应用。此次会议将于2023年05月23日15:00-17:00在北京召开,届时临
注册参会:https://live.vhall.com/v3/lives/watch/794235164 注册链接: https://live.vhall.com/v3/lives/watch/794235164
Get ready for an exciting week of science and innovation at ASMS 2023 in Houston! Bruker is thrilled to be a part of the action from June 4-8, 2023. We're bringing our A-game and we can't wait to show you what we've go
布鲁克最新发布#摘要#应用在免疫肽组学的PaSER™ Novor,具有更快速、实时从头测序的特点使用PaSER 2023b蛋白质组学软件实现无需构建谱图库的dia-PASEF数据分析(Library-free dia-PASEF®)与Mass Dynamics合作, 实现4D-Proteomics™知识可视化2023年3月6日美国伊利诺斯州芝加哥 —— 布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)在美国HUPO会议上宣布为基于timsTOF平台的4D-蛋白质组
3月15日17:00-18:00单细胞蛋白质组学可以帮助我们深入了解细胞水平的分子过程。timsTOF SCP质谱使我们比以往任何时候都更容易获得这些信息,而且其避免了对昂贵和有偏向性的标记技术的需求。 赶快加入本次的在线讲座,内容包括:演示单细胞蛋白质组学完整分析流程:样品转移、分离、采集以及数据实时分析;如何解决样品制备、稀释和处理过程中相关难题;涵盖分析过程中可能遇到的灵敏度和稳定性问题。注册会议:https://www.bruker.co
2023年2月22日中国苏州 —— 布鲁克公司于2月22日至23日出席了在苏州举办的AntibodyChina 2023第六届求实抗体药物深度聚焦峰会。继2022年多款国产ADC药物相继出海,抗体药物继续高速发展。双抗药物与ADC药物持续火热,三抗/四抗等多抗药物开启新型抗体的新篇章,“新型免疫检查点”点燃行业靶点新风向,工艺生产技术持续优化加速产业化进程。本届论坛由求实药社主办,携手130+讲者与1200+行业同仁,深度探讨抗体药物开发中难点,
工作地点北京岗位职责1.负责蛋白质组学相关研究解决方案的开发;2.在客户现场独立进行QTOF相关仪器的演示实验、应用培训课程;3.通过对样本集的分析,展示QTOF的能力,并向潜在客户报告结果;4.与全球市场部及国外工厂保持密切沟通,制定符合全球战略的中国市场和策略:翻译和编纂市场资料;策划和组织市场推广活动;组织并实施对销售团队的内部培训。岗位要求1.化学、生物化学或相关领域的硕士或博士学位;2.有蛋白质组学或代谢组学的样品制备
大 有 可 “微”近年来,蛋白质组学在质谱技术的驱动下得以快速发展。蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。越来越多科研工作者也是聚焦于组学研究向临床应用转化的工作,使其能够更好服务于精准医学。临床样品来源非常广泛,包括体液样本、生物穿刺、临床切片、石蜡包埋(FFPE)以及激光显微切割(LCM)的组织样品等。这些生物样本是病理分子生物学和蛋白质组学研
新闻摘要● 采用第 4 代 TIMS XR cell,具有更宽的动态范围,进样 1 微克蛋白,可以在 60 分钟内鉴定超过 10 万条肽段(1% FDR);● 增加的动态范围与 14 位 Digitizer 可提供出色的定量蛋白质组学结果(CVs值<5%);● 共同销售 CellenONE PICO 液体分配系统,推进单细胞蛋白质组学 (SCP) 应用;● 全新 PaSER™实现实时数据流和智能数据采集控制;● timsTOF Pro 2 带动 4D
新闻摘要● 靶蛋白快速、大视野的 MALDI HiPLEX-IHC 成像,并把新鲜冷冻或 FFPE 组织切片小分子 MALDI 成像数据叠加,为空间生物学和癌症研究提供了具有说服力的创新性证据;● 基于 MALDI 定位的 timsTOF fleX 平台,全新 microGRID 技术可在低至 5 µm 像素间隔的整个切片中提供几乎无伪影的图像;● SCiLS™ Lab 2023a 软件展现了 4D 特征搜寻功能的高级成像分析,可实现支持 CC
高通量蛋白质组学成为了生物医学基础研究和应用开发的重要前沿和突破口,而如何实现对大队列样本稳定可靠地分析也逐渐成为了科研热点和难点。总的来说,实现高通量蛋白质组学面临如下挑战:蛋白质组学样本自身的复杂性(蛋白丰度的动态范围>106)使得低丰度蛋白鉴定异常困难;目前质谱仪采集速度和灵敏度的局限性,使得短梯度下难以实现蛋白深度覆盖;大队列样本分析对高通量方法和仪器稳定性提出了很高的要求。近日迈维代谢继斥资千万引进timsTOF fleX质谱仪
截至目前,人类蛋白质组计划收录的质谱数据可覆盖人类约90%的蛋白,同比可映射至其他物种的蛋白。尽管如此,复杂体系单针蛋白组学鉴定深度依旧受限于液相分离能力、质谱扫描速度和灵敏度等因素。近些年,基于离子大小和结构在气相中进行分离的技术成为质谱领域的关注焦点。该技术不仅在高效性和便捷性上点燃了大众对离子淌度的兴趣,更因其能结合传统液相 (LC) 和质谱 (MS) 的技术优势而备受瞩目。为了能将基于新型捕集离子淌度的4D-蛋白质组学技术讲清楚,我们将通过一系列的
蛋白质组研究是后基因组时代最前沿和热点的研究领域之一。近年来,基于质谱技术的蛋白质组学研究取得了令人瞩目的成果。蛋白质组学不仅仅是寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一,而且在对癌症、老年痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面也有十分诱人的前景。 为促进蛋白质组学的研究和学科发展,帮助从事相关研究的用户学习和了解蛋白质组学研究技术及方法,中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)、 国家蛋白质科学中心(北京)、北京蛋白质组
基于创新性离子淌度的4D代谢组学,不仅能够显著推动已知的甚至是未知代谢物的准确鉴定。更重要的是,区别于从基因组到代谢组的纵向多组学 (Longitudinal Multi-omics),结合4D蛋白组+4D修饰组+4D代谢组的4D功能多组学 (4D Functional Multi-omics) 的研究新范式,聚焦“代谢调控”的三大核心因素:蛋白+修饰+代谢物,更精准、更系统、更深入地解析生物分子功能与代谢调控机制。作为全球4D-蛋白质组学技术的引领者布鲁
基于单细胞层面的研究为生物系统中细胞间的同质性和异质性提供了更精准的信息,随着蛋白质组学技术的快速发展,检测技术和灵敏度的提升,使实现单个体细胞的蛋白质组学分析成为可能。为推动单细胞蛋白质组学的发展,拓展单细胞研究的视野,布鲁克和景杰生物将于2021CNHUPO会议期间联合举办“单细胞蛋白质组学专题午餐会”,线上线下同步进行,诚邀您与会。会议时间: 2021年10月14日12:30-13:35会议地点: 武汉 东湖宾馆 1楼 晴川厅网络直播:
细胞是生命活动的基本单元,一切生命的关键科学问题都要从细胞中寻找。由于细胞间的异质性,因此需要在单个细胞水平上进行生物学研究。随着质谱仪器空间分辨率和灵敏度的不断提升,使得单细胞分析甚至单细胞成像成为了可能。质谱成像具有无标记、广谱性的优势,可以进一步洞悉单细胞内或细胞器间生物分子的差异性分布,在揭示重大疾病病变机理、生命现象活动规律、靶向药物开发和治疗等方面均发挥了重要作用。2012 年,Schober等人将MALDI技术用于HeLa细胞成像中,对DIO
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