幽门螺杆菌全基因组芯片(V2.0)
产品目录号:SBC-R-HP-200-20
产品组成:幽门螺杆菌全基因组芯片(V2.0) / 杂交缓冲液 / 基因信息光盘
保存条件:室温干燥保存
芯片信息:
基因:
Hp基因组芯片共涉及HP的1632个ORF,其中包含标准菌株26695的基因1590个,标 准菌株J99的特异性基因103个。
芯片的模板制备:
以Hp的标准菌株26695的1590个ORF和J99的有别于26695的特异性的103个ORF为模板,PCR扩增了1876个片段。在模板的制备过程中,为了使得杂交信号比较均一,我们将PCR产物控制在1.5 kb以内,若大于1.5 kb长度的ORF就运用2~3对引物分段扩增。在整张芯片的点阵中,PCR产物的长度分别比例如下:
>1.5 kb 1~1.5 kb 0.5~1 kb 0.5 kb以下
基因数 68 575 775 473
芯片的设计
a.点阵18×15 ,8个block重复4次,共32个block。 b.设计21个control 点,其中9个为阳性对照点(Hp中高度表达的基因,其中包括16s rRNA和23s rRNA),6个为阴性对照点(人的与Hp无同源序列的基因)
用 途:
1 、研究不同情况下幽门螺杆菌基因表达的差异;
不同疾病结局患者中分离的幽门螺杆菌菌株
不同国家或地区人群中感染的幽门螺杆菌菌株、敏感与耐药菌株以及与螺杆菌属的其他细菌相比基因表达的差异。
2 、通过比较基因组学(comparative genomics) 分析可发现细菌生长、繁殖和代谢所必须的基因,揭示菌株特异性基因和病原性细菌所特有的基因,从而为细菌的致病机制提供有价值的信息;
3 、可用于Hp感染相关疾病的临床诊断;
4 、利用这张全基因组芯片,还可以进行表达谱相关的研究,从表达谱的水平研究不同生长条件下、不同毒性及致病性的菌株的差异,以其找到一些与毒性等致病因素紧密相关的一些重要基因。
相关介绍:
幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)是一种螺旋状、革兰氏阴性、微需氧性细菌,定植于人胃粘膜。流行病学调查和动物实验均证实幽门螺杆菌的慢性感染是慢性胃炎、消化性溃疡、胃癌及MALT淋巴瘤的危险因素。
幽门螺杆菌全基因组芯片,目录号:SBC-R-HP-200-20
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