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环状RNA(circRNA)是5’和3’端共价结合形成闭合环状的非编码RNA。circRNA作为一种特殊的lncRNA,广泛存在于动植物中,具有物种保守性和组织特异性。而独特的环状结构,也使得circRNA不易被RNAase降解,并且胞内稳定性强,从而能够长效行使转录“调控者”的职能。近几年的研究表明,circRNA在生物的生长发育、对外界环境的抵御等方面具有重要的调控作用。由于circRNA的闭合环状特性,通过去除total RNA中的rRNA和线性RNA分子,可以特异地富集circRNA分子后测序,更有针对性地分析受检样本中特定的circRNA谱、circRNA剪接模式、组间差异和功能等。
中康博技术特色
● 应用范围广:可以检测几乎任何动植物的环状RNA● 环状RNA全覆盖:高深度覆盖,可以检测到低丰度的稀有circRNA● 专业化的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,提供新环状RNA鉴定、环状RNA功能预测、环状RNA分子标志物筛选等深入分析易读性强的数据报告
circRNA测序建库方法
推荐测序模式
● 测序平台:Hiseq X 10;Hiseq 4000● 测序类型:PE150● 测序数据量:推荐10G/样本
circRNA测序实验流程
circRNA测序数据分析流程
circRNA测序样本要求
样本类型:细胞、新鲜组织或足量total RNA样品量:总量≥2 μg,浓度≥100 ng/μL样本质量:OD 260/280值应在1.9~2.2 之间样品保存运输:RNA用离心管保存,封口膜封口后用干冰运输,组织样品则用冻存管保存,干冰或液氮运输
circRNA(环状RNA)测序-环状rna测序,circRNA(环状RNA)测序
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