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转录组是指一个活细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括编码RNA和非编码RNA。 转录组测序技术主要是针对转录产物mRNA进行高通量测序,无需了解物种基因组信息,能够对任意物种进行转录组分析,可全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的完整表达信息,是基因功能及结构研究的基础。目前已广泛应用于生物学基础研究、临床诊断及药物研发等多个领域。
主要研究方向
1. 转录本结构研究:UTR区识别、可变剪切预测、分子标记开发等;2. 基因转录水平研究:基因表达定量、基因功能注释、不同样本间差异表达基因分析等;3. 全新转录区域研究:检测新基因,完善物种基因组功能注释;4. 遗传进化分析:构建系统进化树、进化选择模式分析。中康博技术优势
● 精确性高:精确到单核苷酸水平,可区分高度同源的RNA的分子,鉴定剪切变异体和RNA多态性。● 高度开放性:无需预先了解信息,可研究任意物种已知和未知的转录本序列及定量信息。● 灵敏度高:可在超过6个数量级范围内实现准确的序列检测和定量分析。● 检测范围广:自主研发的基因组数据分析方法和算法,提供多种遗传疾病及肿瘤方向的高级分析● 高通量的数据:采用长读长对读测序及更高的测序深度,提高了对重复序列和同源序列的辨识能力,有效提高可绘制转录组的比例和组装可信度,获得更多长无误的重叠群contigs。● 均匀覆盖度:采用随机降解转录本和随机反转录的策略制备测序文库,有利于获得更为均匀的读取分布,提高了测序效率。● 获取更丰富的转录信息:更高的测序深度和更均匀的覆盖度,帮助研究者发现和区分低丰度的转录本、高相似性的转录本、可变剪切及单个核酸多态性。 推荐测序模式
mRNA测序实验流程
mRNA测序分析流程
mRNA测序样品要求
● 样品纯度:OD260/280为1.8-2.2,完整无降解● 样品浓度:Total RNA:≥2 μg , 浓度≥100ng/μl● 适用范围:真核生物(有、无参考基因组皆可)
转录组测序,转录组测序
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