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小RNA是一类长度在20-30nt的RNA分子,主要包括miRNA、siRNA和piRNA等,参与调控基因表达、生长发育、非生物胁迫和病原菌的侵害等过程。小RNA测序是基于Illumina HiSeq2500测序平台对目标物种小RNA进行大规模测序分析,能够快速全面地鉴定该物种在特定状态下的小RNA和发现新的小RNA,并预测其靶基因。小RNA测序为研究小RNA的种类、结构和功能及此物种的基因调控机制提供了有力工具。主要研究方向
1. 小RNA的系统识别和鉴定; 2. 发现新的miRNA; 3. miRNA差异表达分析; 4. 靶基因预测; 5. 靶基因功能注释。测序方案
1. 测序平台:Illumina Hiseq 2500; 2. 测序类型:SE50; 3. 测序数据量:10M Reads。sRNA测序实验流程
sRNA测序分析流程
sRNA测序样品要求
● 样品纯度:OD260/280为1.8-2.2,完整无降解● 样品浓度:Total RNA:≥2 μg , 浓度≥100ng/μl● 适用范围:真核生物(有、无参考基因组皆可)
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