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主推表达谱芯片 Affymetrix表达谱芯片由来以早,是一类使用广泛的芯片,主要用来检测转录组水平,用以分析基因表达的差异情况。Affymetrix表达芯片是目前物种最全面的芯片品牌,包括常见的人、小鼠、大鼠外,还包括众多小物种,比如鸡、斑马鱼、猪等等,特别是在心血管和口腔领域,斑马鱼和猪这类模式动物用的比较多。这类型客户如果想做表达谱芯片,那只能选择Affymetrix的小物种芯片。目前主流Affymetrix表达谱芯片信息如下:
总结来说,目前Affymetrix主流表达谱主要有三类:1. Clariom D系列:Affymetrix最新一款芯片,有人、小鼠、大鼠三个物种,其中人的Clariom D芯片是一款四合一芯片,可同时检测mRNA、lncRNA、circRNA和pre-miRNA 四个层面,但是大鼠和小鼠的Clariom D芯片只能检测mRNA、lncRNA和pre-miRNA 三个层面。这是一款性价比最高芯片,无论您研究那个层面都是个不错的工具。2. Clariom S系列: 业界领先的人、大鼠和小鼠基因(mRNA)表达水平芯片,该芯片覆盖所有注释明确的基因,可检测20,000个注解基因的表达水平。这款芯片是研究注释明确基因的最好工具—简单、高速、低成本。3. Primeview系列:是一款针对人的表达谱芯片,只检测mRNA。它是经典表达谱芯片U133 plus 2.0 的简化版,它检测信号强以及重复性好,而且价格便宜,是一款强大又经济的检测工具。
补充:其他小物种表达谱芯片Affymetrix 3' IVT Expression Array: 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、大麦、小麦、柑橘、棉花、玉米、白杨、甘蔗、西红柿、葡萄、酵母、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猴、非洲爪蟾、热带爪蟾、斑马鱼。Affymetrix Gene 1.0 ST Array : 拟南芥、苜蓿、稻、大豆、果蝇、秀丽隐杆线虫、牛、犬、鸡、猪、恒河猕猴、食蟹猕猴、马、猫、豚鼠、狨猴、羊、兔、恒河猴、斑胸草雀、斑马鱼、番茄。
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