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环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类新型非编码RNA分子,它在真核生物中的大量存在颠覆了传统的线性RNA观点,成为近两年来RNA领域中最炙手可热新星。环状RNA的表达具有组织和疾病特异性,与组织发育和疾病发生发展密切相关。此外,环状RNA比线性RNA更稳定,可作为新型疾病分子标志物。 实时定量RT-PCR是检测RNA表达的金标准,但环状RNA的实时定量PCR检测存在着特殊的挑战:1). 环状RNA为闭合环形结构,只有采取Outward-facing primer设计策略才能把它们和线性RNA区分开;2). 没有环状RNA的序列数据库,很难获取其序列信息;为了促进环状RNA的研究,云序生物全新推出了环状RNA实时定量PCR技术服务。云序生物环状RNA实时定量PCR服务流程云序生物提供一站式环状RNA实时定量PCR技术服务,包括:RNA抽提,RNA质控,环状RNA特异性引物设计,环状RNA逆转录,环状RNA qPCR检测。并提供详细的实验报告和实验数据。 云序生物环状RNA实时定量PCR特色1). “Outward-facing”引物设计策略云序生物针对环状RNA特异性的backsplice位点,采用了outward-facing引物设计策略:针对线性RNA,primer 1和primer 2是尾对尾,无法有效扩增;而如果线性RNA的外显子1和3收尾相连形成了闭合的环状RNA, primer 1和2就可以扩增出针对特异性backsplice位点的产物,从而特异性的检测环状RNA。 2). 预验证的引物云序生物根据权威文献和数据库整理了数万个人类和小鼠环状RNA,预设计了它们的PCR引物,并对其中一些常见的环状RNA在组织和细胞系中进行了预验证。从而帮客户节省了大量引物设计和测试的时间,并保证了实验的成功。
适用样品类型细胞,新鲜组织,血清血浆,石蜡包埋样品,抽提好的RNA云序生物技术服务列表1. 测序服务
2. 生信服务 & PCR技术服务
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