芯片名称:Affymetrix GeneChip® Human Transcriptome Array 2.0 芯片介绍:HTA2.0为Affymetrixzei新开发的高密度探针芯片。这一高分辨率芯片包含了超过六百万条不同探针,覆盖编码和非编码转录本。该芯片上70%的探针覆盖编码转录本的外显子,其余30%的探针覆盖外显子之间的剪接位点和非编码转录本。芯片设计和注释的数据来源于 RefSeq、Ensembl、UCSC、Vega、MGC (v10)、NONCODE、lncRNA db和Broad Institutee, Human Body Map lncRNAs and TUCP catalog等多个权威公共数据库。
芯片名称:Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array
芯片介绍:U133 Plus 2.0包含了47,000个转录本,代表了38,500个明确的人类基因。数据库来源于GeneBank、dbEST、RefSeq、UniGene database(Build 159 January 25 2003)、Washington University EST trace repository、NCBI human genome assembly(Build 31)。
芯片名称:Affymetrix GeneChip® GeneChip Human Gene 1.0 ST Array
芯片介绍:Human Gene 1.0 ST 覆盖99%人类转录本,芯片包含764,885个探针,每个基因用大约25个探针来检测,可检测28,869个功能明确基因的表达情况。数据来源于RefSeq,Ensembl,GenBank,UCSC。
芯片介绍:MTA1.0为Affymetrixzei新开发的高密度探针芯片。这一高分辨率芯片包含了超过五百万条不同探针,覆盖编码和非编码转录本。该芯片设计的探针覆盖超过114,000个蛋白编码转录本和超过101,000个非蛋白编码转录本。芯片设计和注释的数据来源于 RefSeq、Ensembl、UCSC、Vega、MGC (v10)、NONCODE、lncRNA db、MGI和Intergenic noncoding RNA from Luo, et al (doi:10.1371/journal.pone.0070835)等多个权威公共数据库。