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生物学通路(Biological pathway),包括代谢通路和信号转导通路是生物功能的重要组成部分,将研究待定蛋白映射到生物学通路中进行系统化分析,可以考察功能性变化对生物通路的影响。通过GSEA检验(需表达谱数据),KS检验,和超几何分布检验等方法对研究蛋白在某些通路的富集程度进行排序,识别发生功能改变的潜在通路。
---------------------------------------------------------------------------------------------------- BioGenius具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及:原始数据蛋白鉴定分析,蛋白修饰分析,蛋白质结构域分析,蛋白质相互作用分析,蛋白质结构建模分析,采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。
蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体,而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段,其蛋白表达可能存在巨大的差异。
常用的定量蛋白组学技术有:iTRAQ技术,LC-MS/MS技术等。
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