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简介
表达谱测序 基因转录水平的研究是功能基因组学和医学研究的基础。数字基因表达谱(Digital Gene Expression Tag Profiling, DGE)利用新一代高通量测序技术和高性能计算分析技术,通过全面、经济、快速地检测某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况。数字基因表达谱已被广泛应用于基础科学研究和药物研发等领域。
应用领域
基因表达精确定量
基因表达网络构建
疾病分类研究
分析内容
1. 标准信息分析
a)对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 tags 的处理
b)测序评估(数据比对统计,测序饱和度分析,Clean tag拷贝数分布统计,Clean tag比对统计,参考基因统计)
c)基因表达注释
d)差异表达基因分析(差异表达基因筛选,实验重复性分析)
e)反义链的转录分析
f)新转录本预测(需要参考基因组序列)
g)差异基因表达模式聚类分析
h)GO功能富集分析
i)Pathway显著性富集分析 j)蛋白互作网络分析(需要蛋白互作数据库中包含该物种的注释信息)
备注:部分分析需要合作老师提供详细的参考基因组/基因数据库 2. 高级信息分析 根据客户特殊要求进行个性化分析,协商确定分析内容。
样品要求
样品类型:去除蛋白并进行DNase处理后的完整RNA
样品需求:总RNA≥4 μg ,浓度≥80 ng/μl;
样品纯度:动物样本,RIN ≥ 7.0;植物样本,RIN ≥ 6.5; 28S:18S ≥1.0。
项目运转周期
标准流程的运转周期为30个工作日
表达谱测序,
表达谱测序信息由广州基迪奥生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于表达谱测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
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